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Avalia o da Genotoxicidade Ambiental - AGA Carlos Alberto de Bragan a Pereira USP IME Dept. de Estat stica BioInfo N cleo de Bioinform tica – PowerPoint PPT presentation

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Title: Avalia


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Avaliação da Genotoxicidade Ambiental - AGA
  • Carlos Alberto de Bragança Pereira
  • USP IME Dept. de Estatística BioInfo Núcleo
    de Bioinformática
  • www.ime.usp.br/cpereira

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  • Bueno, Pereira Rabello-Gay (2000),
    Environmental genotoxicity using cytogenetic end
    points in wild rodents, Environmental Health
    Perspectives 1081165-9
  • Bueno, Pereira, Rabello-Gay Stern (2002),
    Environmental genotoxicity evaluation Bayesian
    approach for a mixture statistical model,
    Stochastic Environmental Research Risk
    Assessment- SERRA 16267-78

3
  • Pequenos animais da mesma espécie (Akodon
    Montesis - 2n24) foram capturados em 3
    diferentes áreas do Vale do Itajaí no Estado de
    Santa Catarina, Sul do Brasil.
  • Área 1 de Preservação Ambiental (PA) para
    monitorar animais que, supostamente não foram
    expostos a poluição. Foram capturados e estudados
    12 animais.
  • Área 2 de Plantação de Arroz (RF) para avaliar o
    efeito de pesticidas usados na cultura. Foram
    capturados e estudados 13 animais.
  • Área 3 de Indústrias (IA) para acessar o efeito
    do lixo doméstico e industrial que estão
    presentes naquele ambiente. Foram capturados e
    estudados 13 animais.

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3 end points estão aqui listados 1- Razão
PCE/NCE A freqüência de células PCE (eritrócito
poli-cromático) entre as primeiras 100 células
NCE (eritrócito normo-cromático) observadas em
uma placa. 2 Índice mitótico (MI) A
freqüência de células em meta-fase entre 2000
contadas. 3 Abundância de MNPCE A
freqüência de PCE com micronúcleos entre 2000 PCE
contados. A tabela com essas contagens estão
apresentadas nos artigos citados.
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  • Modelo Estatístico
  • PCE/NCE é, por construção, um modelo binomial
    negativo com k 100 onde p é a chance de observar
    um PCE quando um eritrócito é selecionado.
  • MI é uma binomial com n 2000 ou, por
    aproximação, uma Poisson com parâmetro np onde p
    é a chance de encontrar uma célula em meta-fase
    dentre as 2000 contadas.
  • MNPCE é uma binomial com n 2000 ou, por
    aproximação, uma Poisson com parâmetro np onde p
    é a chance de encontrar uma célula com
    micronúcleo dentre as 2000 contadas.

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(No Transcript)
7
(No Transcript)
8
Como primeira análise consideramos o método
tradicional que considera cada animal como sendo
uma unidade amostral com o o parâmetro sendo
comum a todas as unidades. Desta forma, para os
3 índices a estatística suficiente em cada área é
a soma das freqüências observadas em cada
animal. O dilema do investigador aparece
principalmente nesse ponto onde deve decidir se
coleta mais células em cada animal ou se aumenta
o número de animais para sua análise. Aqui, como
tem dificuldades em capturar os animais,
geralmente decide aumentar o número de células
contadas em cada animal.
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Vamos analisar em detalhes o índice PCE/NCE.
Apresentaremos todos os resultados ao final de
nossa apresentação. Lembremos que t x1 x2
...xn é a estatística suficiente e pp, pr e pi
são os parâmetros de nosso interesse e que
gostaríamos de comparar. Note que t é binomial
negativa com parâmetros 100n e p. A binomial
negativa tem a forma As verossimilhanças
associadas a cada área estão no próximo gráfico.
As probabilidades associadas são
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(No Transcript)
11
(No Transcript)
12
Os gráficos sugerem que o modelo tradicional pode
não ser o adequado para esse tipo de análise.
Pensamos então em um modelo de mistura. Este sim
considera a variação entre as unidades
amostrais. Imaginemos que existam 3 Deuses, o
da preservação, o da plantação e o da indústria.
Suponha também que cada um deles possui um
gerador de p e cada um gerado representa um
ratinho. Neste paradigma o nosso interesse é
testar se os parâmetros das distribuições
geradoras, o Deuses, são os mesmos. Isto é, só
existe um Deus.
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