Amino Asitler - PowerPoint PPT Presentation

1 / 16
About This Presentation
Title:

Amino Asitler

Description:

Amino asitler ... Amino Asitler – PowerPoint PPT presentation

Number of Views:84
Avg rating:3.0/5.0
Slides: 17
Provided by: anyc151
Category:

less

Transcript and Presenter's Notes

Title: Amino Asitler


1
Amino Asitler
2
Siklikla karsilasilan amino asitler için kisaltma
ve semboller
  • Her amino asit ismi bir tane üç- harfli kisaltma
    ve bir tane de tek harfli sembol vardir.
  • Tek harf kodlari asagidaki kurallara göre
    saptanmistir.

3
--- Tek ilk harf Eger sadece bir amino asit
belli bir harfle basliyorsa, bu harf onun sembolü
olarak kullanilir.
  • Sistein (Cystein) Cys
    C
  • Histidin (Histidine) His
    H Izolösin (Isoleucine) Ile
    I
  • Metyonin (Methionine) Met M
  • Serin (Serine) Ser
    S
  • Valin (Valine) Val
    V

4
En sik kullanilan amino asitler öncelige
sahiptir.Eger birden fazla amino asit ayni
harfle basliyorsa, bu harf amino asitlerden en
sik görülen sembolü olur.
  • Alanin (Alanine) Ala A
  • Glisin ( Glycine) Gly G
  • Lösin (Leucine) Leu L
  • Prolin ( Proline) Pro P
  • Treonin (Treonine) Thr T

5
Benzer isimler Bazi tek- harf sembolleri
temsil ettikleri amino asidin ismiyle benzerlik
gösterir
  • Arginin (Arginine) Arg R
    (aRginin)
  • Asparagin (Asparagine) Asn N (N
    tasir)
  • Aspartat (Aspartate) Asp D
    (aspar Dik)
  • Glutamat (Glutamine) Glu E
    (glut Emate)
  • Glutamin (Glutamine) Gln Q
    (Q-tamin)
  • Fenilalanin (Phenylalanine) Phe F
    (Fenilalanin)
  • Trozin (Tryrosine) Tyr Y
    (tYrosine)
  • Triptofan (Tryptophan) Trp W
    (molekülde çift halka

6
  • Ilk Harfe Yakin Harf
  • Geri kalan amino asitleri için,
    alfabede amino asidin ilk harfine yakin olan harf
    tek- harf sembolü olarak verilmistir.
  • Bundan baska, B hem aspartik asiti hem
    de asparagini gösteren Asx için, Z hem glutamik
    asiti hem de glutamini gösteren Gl x için ve X
    belirlenmeyen bir amino asit için kullanilir.

7
  • Aspartat veya asparagin Asx B
  • Glutamat veya glutamin Glx Z
  • Lizin (Lysine) Lsy K
    (lye yakin)
  • Bilinmeyen amino asit X

8
Amino Asitlerin Optik Özellikleri
  • Her amino asidin a-karbonu dört fakli kimyasal
    gruba baglidir ve bu yüzden siral veya optikçe
    aktif karbon olarak adlandirilir. Glisin bir
    istisnadir, çünkü a-karbonuna iki hidrojen
    baglidir ve bu yüzden inaktiftir. Bu iki forma
    stereoizomerler, optik izomerler veya
    enantiyomerlerdenir.
  • Proteinlerin yapisindaki bütün amino asitler
  • L-konfigürasyonundadir.ancak, bazi
    antibiyotiklerde ve bakteri hücre duvarlarinda D-
    amino asitlere de rastlanir.

9
Amino Asitlerin Asit/ Baz Özellikleri
  • Sulu çözeltilerdeki amino asitler zayif asidik
    a-karboksil ve zayif bazik a- amino gruplarina
    sahiptirler. Ayrica, her asidik ve bazik amino
    asidin yan zincirinde iyonize olabilen bir grup
    vardir. Bu yüzden hem serbest amino asitler hem
    de peptit baginda yer alan bazi amino asitler
    potansiyel tamponlar olarak davranabilirler.
    Zayif bir asitle (HA) onu konjuge bazi(A-)
    arasindaki kantitatif iliski Henderson-Hasselbalch
    denklemiyle açiklanir.

10
Henderson- Hasselbalch denklemi
  • Bir protonun HA olarak gösterilen zayif bir
    asitten ayrildigini varsayalim

11
Tuz veya konjuge baz A- , zayif bir asidin
iyonize formudur. Asidin dissosiayon sabiti olan
Ka asagidaki gibi tanimlanir.
12
  • ( Ka ne kadar büyükse, HAnin çogu H ve
    A-1 e çevrildiginden asit o kadar kuvvetlidir.
    Tam tersine Ka ne kadar küçükse, daha az asit
    dissosiye olmustur ve bu yüzden, asit daha
    zayiftir).

13
  • Yukaridaki denklem H için çözülüp, denklemin
    iki tarafinin da logaritmasi alinip, iki tarafi
    da -1 ile çarpip, pH -log H ve pKa
    -logKa olarak ifade edildiginde Henderson-
    Hasselbalch denklemi elde edilir.

14
Henderson- Hasselbalch denkleminin uygulanimi
  • Molekülde titre edilebilen ikinci bir grup
    oldugu için, karboksil grubunun dissosiyasyon
    sabitine Ka yerine K1 denir. Henderson-
    Hasselbalch denklemi asetik asit için tarif
    edildigi gibi alaninin karboksil grubunun
    dissosiyasyon unu incelemek içinde
    kullanilabilir.

15
(No Transcript)
16
  • Sekilde görüldügü gibi alaninin tamamen
    protonlasmis hali ve II alaninin izoelektrik
    formudur. Bu denklem asagidaki gibi
    düzenlenebilir.
Write a Comment
User Comments (0)
About PowerShow.com