AMINO ASITLERIN

1
AMINO ASITLERIN ÖZELLIKLERI

• Prof. Dr. Esma GÜR

2
H

R C NH2 R C NH3
pH 7
-
COO
ZWITTERIYON
INSAN VÜCUDUNDA ?-amino asitler hakim
3
(No Transcript)
4
(No Transcript)
5
(No Transcript)
6
(No Transcript)
7
CORN prensibi ile L- amino asit (L-Ala)
8
Alifatik amino asitler
9
Aromatik amino asitler
10
Bazik amino asitler
11
Asidik amino asitler
12
Nötral-polar amino asitler
13
Yapisal önemi olan amino asitler
14
Denge Sabiti(Ka) Dissosiasyon Kat Sayisi
-logKa pKa
15
pI Izoelektrik Nokta
Amino asitin 2den fazla dissosiye olan grubu var
ise pI nötral formun iki tarafindaki pKa larin
ortalamasidir.
16
pI (2.35 9.69) / 2 6.02
17
2.09
3.86
9.8
pI (2.09 3.86) / 2 2.98
18
Glutamik Asit
19
pKa13.2
pKa24.25
pKa39.67
pI (3.2 4.25) / 2 3.7
20
pI (9.2 10.8) 10.0
2.16
9.2
10.8
21
(No Transcript)
22
Amino Acid pKa for a-COOHpKa for a-NH3 pKa
for R group Glycine 2.34 9.6  Alanine 2.34 9.
69 Leucine 2.36 9.6 Serine 2.21 9.15  Threonin
e 2.63 10.43 Glutamine 2.17 9.13 Aspartic
acid 2.09 9.82 3.86 Glutamic acid 2.19 9.67 4.
25 Histidine 1.82 9.17 6.0 Cysteine 1.71 10.7
8 8.33 Tyrosine 2.20 9.11 10.07 Lysine 2.18
8.95 10.53 Arginine 2.17 9.04 12.48
23

• 2 Dogru cevap seçin
• PK degerinin altindaki pH da iyonize olabilen
  gruplar protonlanir.
• Eger bir molekül düsük pK degerine sahipse, bu
  molekülün protonlara ilgisi yüksektir.
• Asetik asitin pKsi 4.7 dir. pH 7.4 de sadece
  asetik asit bulunur.
• Amino asitler gibi moleküllerin sadece 1 pK
  degeri olur.
• pK, amino asitlerin birbirine baglanma seklini
  tahmine yarar.
• Eger ortamin pHsi X molekülünün pK sindan yüksek
  ise, X molekülünün proton kaybetmis formu hakim
  olur.

24

• Proteinlerde Primer Yapinin Saptanmasi
• Örnek hidrolizi (6 M HCl 110C 24 sa.)
• Sekans (dize) Analizi protein
  ?polipeptidler?a.a.
  analizi veya Edman reaksiyonu

Br-CN ile parçalanma
25
(No Transcript)
26
(No Transcript)
27
Edman reaksiyonu ile a.a. dizesi saptanmasi
Fenil izotiyosiyanür
28

• Amino asid dizesi saptanirken
• Protein zinciri denatüre edilerek çözülür
• S-S baglari açilir
• Daha küçük peptidlere parçalanir (proteazlar ile)
• Küçük peptidlerin (oligopeptidler) dizeleri
  saptanir.
• Büyük proteinin a.a. dizesi hesaplanir

29
(H3N-) Gly-Arg-Phe-Ala-Lys-Trp-Val(-COO)
Tripsin (Lys ve Arg C-terminalinden)
Gly-Arg Phe-Ala-Lys Trp-Val
Gly-Arg Phe-Ala-Lys Trp-Val
(H3N-) Gly-Arg-Phe-Ala-Lys-Trp-Val(-COO)
Kimotripsin (Aromatik a.a.lerin C-terminalinden)
Gly-Arg-Phe Ala-Lys-Trp Val(-COO)
Gly-Arg
Phe-Ala-Lys
Trp-Val
Gly-Arg-Phe
Ala-Lys-Trp
Val
30
(No Transcript)
31
Amino Asitlerin Kullanildigi Reaksiyonlar

1. Peptid bagi olusumu
2. Transaminasyon
3. Dekarboksilasyon
4. Deaminasyon

32
Peptid bagi olusumu
33
(No Transcript)
34
(No Transcript)
35
(No Transcript)
36
(No Transcript)
37
(No Transcript)
38
Peptid zinciri
39
Peptid bagini gösterin.
40
Özel bir bag Disülfit bagi (S-S bagi)
41
(No Transcript)
42
(No Transcript)
43
Transaminasyon
44
AST (Aspartat Transaminaz)
45
Transaminasyon reaksiyonlari
?-amino asit
Enzim-Piridoksal
?-amino asit
?-keto asit
Enzim-Piridoksamin
?-keto asit
46
ALT reaksiyonu
Alanin
ALT -Piridoksal
Glutamat
Piruvat
ALT-Piridoksamin
??-keto glutarat
47
Dekarboksilasyon
48
(No Transcript)
49
(No Transcript)
50
Amino acid Amine Fonksiyonu
serin ethanolamin Conversion of phosphatidyl serine to phosphatidyl ethanolamine in bacteria
lysin cadaverin1,5-diaminopentane
arginin/ornithin putrescin1,4-diaminobutane spermine and spermidine olusumu

histidin histamin vasodilator, inflamatuvar, mideden asit sekresyonunu uyarir mast hücrelerinde yapilip sekrete edilmek üzere depolanir
glutamat gamma-aminobutyrat, GABA Beyinde önemli nörotransmitter
3,4-dihydroxyphenylalanine (Dopa) dopaminhydroxytyramin Beyinde inhibitör nörotransmitter catecholaminlerin ve melaninin öncüsü
5-hydroxytryptophan serotonin melatoninin öncüsü
phenylalanin phenylethylamin antidepressan, amfetamin gibi uyarici, çikolatada var
51
Glutamat dehidrojenaz sistemi
52
Glutamat Dehidrojenaz sistemi