Salmonelles

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Salmonelles
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Classification

• Genre le plus complexe et le plus vaste de la
  famille des entérobactéries
• 2 espèces S. enterica et S. bongori (rare)
• Salmonella enterica divisée en 6 sous-espèces
• Salmonella enterica subspecies enterica
• homme et animaux à sang chaud (gt 99,5 des
  souches pathogènes)
• Salmonella enterica subspecies salamae
• Salmonella enterica subspecies arizonae
• Salmonella enterica subspecies diarizonae
• Salmonella enterica subspecies houtenae
• Salmonella enterica subspecies indica
• Dans chaque sous-espèce, différents sérovars
  (sérotypes) sur la base des antigènes O, H et Vi

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Nomenclature

• Genre, espèce, sous espèce
• toujours en italique
• Ex Salmonella enterica subspecies enterica
• Salmonella enterica subspecies arizonae
• Sérotype
• Jamais en italique
• Commence par une majuscule
• Ex Salmonella enterica subsp. enterica
  sérotype Typhi
• Salmonella enterica subspecies enterica
• seul groupe isolé chez l homme
• gt la sous espèce et l espèce ne sont pas
  mentionnés
• gt seul le sérotype est précisé
• gt nomenclature usuelle genre sérotype
• Ex Salmonella Typhi
• Salmonella Enteritidis

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Habitat

• Les Salmonella enterica sont essentiellement des
  parasites du tube digestif de l homme et des
  animaux à sang chaud
• Sérotypes strictement humains
• Typhi
• Paratyphi A, B ou C
• Sendai
• Sérotypes strictement animaux
• Abortus-Ovis ovins
• Gallinarum-Pullorum volaille
• Sérotypes ubiquistes
• Typhimurium
• Hadar, Heidelberg, Saint-Paul, Virchow,
  Senftenberg volaille (dinde, poulet)
• Enteritidis œufs
• Dublin bovins

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Sous-espèce enterica 2 types de salmonelloses

• Salmonelloses majeures
• Salmonelloses mineures

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Salmonelloses majeures

• Affections strictement humaines
• fréquentes en zone tropicale
• Sérotypes
• Typhi cosmopolite mais pratiquement plus de
  cas autochtones
• Paratyphi A surtout répandu en Afrique
• Paratyphi B Europe
• Paratyphi C Extrême-Orient
• Transmission
• Directe au contact des malades ou des porteurs
• Indirecte par ingestion d eau ou d aliments
  souillés par les selles de sujets infectés
  (malades, convalescents ou porteurs chroniques)
• Très peu de salmonelles suffisent pour gt la
  maladie

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• Physiopathologie
• Passage à travers la barrière intestinale
• Colonisation des ganglions lymphatiques
  intestinaux
• Passage dans le sang par le canal thoracique
  septicémie
• Possibilité de multiplication dans différents
  organes
• foie, vésicule biliaire
• Passage dans le colon gt germes retrouvés dans
  les selles

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Symptomatologie des fièvres typhoïdes

• Incubation 5 à 30 jours (15 jours en moyenne)
• Période d'invasion
• fièvre, céphalées, vertiges
• constipation, puis diarrhée, vomissements,
  douleurs abdominales
• hépatosplénomégalie inconstante
• Période d'état
• Tuphos (état d obnubilation phases de délire)
  inconstant
• taches rosées lenticulaires (2-4 mm diamètre)
  inconstantes
• Guérison en 3-4 semaines, mais fatigue résiduelle
• Rechutes fréquentes (8 à 30 jours après larrêt
  du traitement)

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Salmonelloses mineures

• Affections fréquentes en zone tropicale
• Sérotypes très nombreux
• Typhimurium
• Enteritidis
• Hadar, Heidelberg, Virchow, Dublin
• Transmission
• Ingestion d eau ou d aliments contaminés
• Aliments incriminés produits contaminés
  (viandes, charcuterie, laitages, œufs,
  volailles), fruits et légumes souillés
• Infection souvent collective repas préparés à
  l'avance, défaut dans la conservation des
  aliments (chaîne du froid)
• Il faut ingérer beaucoup de germes pour gt
  maladie (106)

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Symptomatologie des salmonelloses mineures
gastroentérite fébrile

• Incubation 12 à 36 h (après ingestion de
  l'aliment contaminé)
• Fièvre, nausées, céphalées
• diarrhée liquide glaireuse parfois sanglante,
• douleurs abdominales violentes, vomissements
  douloureux et fréquents
• Évolution favorable en quelques jours (1 à 7)
• Certains sujets restent porteurs sains après la
  maladie (plusieurs mois)

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Symptomatologie des salmonelloses mineures
formes extra-digestives

• Plus rares, surtout chez le patient immunodéprimé
• Circonstances favorisantes
• drépanocytose, déficit enzymatique des globules
  rouges
• Formes cliniques septicémies, infections
  urinaires, cholécystites, méningites, infections
  ostéo-articulaires, infections pulmonaires

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Diagnostic direct des salmonelloses

• Prélèvements pour culture
• 1. Suspicion de fièvre typhoïde
• Hémoculture (au début de la maladie, lors des
  ascensions thermiques)
• Prélever au moins 10 ml de sang
• 1ère semaine dans 90 des cas
• 3ème semaine dans 40 des cas
• Coproculture (négative au début, peut rester
  longtemps positive après la négativation de
  l'hémoculture)
• 2. Salmonelloses mineures
• Coproculture
• L'hémoculture reste négative (parfois positive
  chez le jeune enfant)
• Autres prélèvements en fonction du contexte
  (pus, LCR)
• Aliments

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• Milieux d isolement
• Dans un prélèvement théoriquement stérile
  (hémoculture)
• Milieu ordinaire
• Dans les selles
• l'excrétion des germes peut être faible au cours
  des salmonelloses, et leur nombre est inférieur à
  celui des espèces commensales
• Culture sur milieu sélectif contenant des
  inhibiteurs
• Utilisation d'un milieu liquide d'enrichissement

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• Milieux sélectifs généralement utilisés
• Hektoen contient des sels biliaires, du lactose
  (si utilisation du lactose, le milieu vire au
  jaune) et des indicateurs (mise en évidence de la
  production de H2S)
• Salmonella colonies verdâtres (lactose -) à
  centre noir si H2S
• Milieux chromogènes très spécifiques de
  Salmonella(colonies roses, oxydase -)

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• Milieux sélectifs généralement utilisés
• Hektoen contient des sels biliaires, du lactose
  (si utilisation du lactose, le milieu vire au
  jaune) et des indicateurs (mise en évidence de la
  production de H2S)
• Salmonella colonies verdâtres (lactose -) à
  centre noir si H2S
• Milieux chromogènes très spécifiques de
  Salmonella(colonies roses, oxydase -)
• Milieux d'enrichissement
• contiennent des antiseptiques sélectifs inhibant
  les autres bactéries
• Müller-Kauffmann (au tétrathionate de Na et vert
  brillant)
• Sélénite (au sélénite de sodium).

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SCHEMA D'ISOLEMENT D'UNE SALMONELLA PAR
COPROCULTURE
Selle
Isolement sur gélose sélective Hektoen ou
milieu chromogène
Bouillon d'enrichissement (Müller-Kauffmann)
1e jour
Identification présomptive - de 5 colonies
suspectes sur Hektoen uréase - ou d  1 colonie
rose sur milieu chromogène oxydase Si uréase -
ou oxydase - galerie API 20E
Isolement sur gélose sélective Hektoen ou
milieu chromogène
2e jour
Si une Salmonella n'est pas déjà isolée étude
des colonies suspectes.
Si Salmonella agglutination sur lame
3e jour
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Caractères d'identification API 20 E

• Caractères des entérobactéries
• Gaz en glucose (sauf Typhi)
• Mobiles (sauf Gallinarum)
• Lactose -
• ONPG -
• ODC (sauf Typhi)
• LDC (sauf Paratyphi A, Choleraesuis)
• Citrate de Simmons (sauf Typhi, Paratyphi A)
• H2S (sauf Parayphi A, Choleraesuis et Typhi)
• Uréase -, TDA-, gélatinase -
• VP -

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Identification antigénique étape indispensable

• Basée sur la détermination, par agglutination sur
  lame, des antigènes O (LPS paroi), H (flagelle)
  et Vi (capsule).
• il existe gt1400 sérotypes pour Salmonella
  enterica subsp enterica
• Le typage est effectué à partir d'une gélose
  ordinaire en pente (humidité utile pour un bon
  développement de l'antigène H).
• Vérifier que la souche n est pas
  autoagglutinable en testant un peu de culture
  dans de l eau physiologique.

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• Antigènes O
• Spécifique du lipopolysaccharide de paroi
• Antigène H
• Portés par les flagelles contenant une protéine,
  la flagelline, qui détermine le type antigénique
• Habituellement diphasiques les salmonelles ont
  deux systèmes de synthèse codant pour 2
  flagellines différentes
• Antigène Vi
• Polyoside capsulaire retrouvé que chez 3
  sérotypes mais de façon inconstante Salmonella
  Typhi, Paratyphi C, et Dublin
• Salmonella Typhi est O-inagglutinable par la
  présence d'un antigène Vi.
• gt devient O-agglutinables après chauffage à
  100C, qui fait passer l'antigène Vi dans le
  surnageant.

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• Tableau de Kaufmann-White
• indique pour chaque sérovar les antigènes O, Vi
  et H
• A chaque sérovar correspond une formule
  antigénique
• ex. S. Virchow 6,7 r 1,2
• Les sérovars ayant des antigènes O communs
  forment un groupe désigné A, B, C, D etc...
• ex. sérovars du groupe B ? tous ont l'antigène O4
• sérovars du groupe D ? tous ont l'antigène O9
• Méthode classique de sérotypage
• Utilisation des sérums polyvalents O, puis
  agglutination par les sérums monovalents
• En pratique, minimum de sérums à posséder au
  laboratoire
• sérum anti-Vi (S. Typhi)
• sérums polyvalents anti-O 4,5 - O 6, 7, 8- O 9
• (gt 90 des Salmonella en France)
• Sérums anti- Hi - Hb - Hd - HG (mélange) et Hr

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(No Transcript)
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(No Transcript)
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Diagnostic indirect des salmonelloses

• recherche des anticorps sérodiagnostic de Widal
  et Félix
• Utile uniquement pour le diagnostic des fièvres
  typhoïdes et paratyphoïdes,en particulier
  lorsque l'isolement de la bactérie n'est plus
  possible(malade vu tardivement ou
  antibiothérapie donnée "à l'aveugle")
• Permet de rechercher dans le sérum les anticorps
  (agglutinines) correspondant aux antigènes O et H
  de Typhi et Paratyphi A, B, C
• Nombreux causes d'erreurs demander en parallèle
  une coproculture
• et une hémoculture pour isolement du germe
• Méthode
• Utilisation de suspensions antigéniquesTO, TH,
  AO, AH, BO, BH, CO, CH
• Ce sont des bactéries tuées
• soit par l'alcool (détruit les antigènes H)
• soit par le formol (détruit les antigènes O)
• Chaque suspension antigénique est mise en
  présence de dilutions croissantes du sérum du
  malade pour déterminer le titre en agglutinines

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• Interprétation
• Sérodiagnostic négatif la première semaine
• Apparition des anticorps anti-O vers le 8ème jour
  de la maladie(titre 1/800e à 1/1600)
• Apparition des anticorps anti-H vers le
  10ème-12ème jour de la maladie (titre 1/3200)
• A la période d'état, il y a simultanément les
  agglutinines O et H(titre plus élevé des
  anticorps anti-H).
• Les anticorps anti-O disparaissent après la
  maladie (en 2-3 mois)
• Les anticorps anti-H persistent plusieurs années
  après la maladie ou après une vaccination
  anti-TAB
• La présence seule d'anticorps anti-O témoigne
  d'une infection récente

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• Résultats faussement positifs
• Anticorps anti-TO seuls infection par une
  Salmonella ayant un antigène O commun avec Typhi,
  mais des antigènes H différents.
• ( Il s'agit le plus souvent de Enteritidis)
• anticorps anti-BO seul Typhimurium
• BO ou TO certaines souches de Yersinia
  pseudotuberculosis (communautés antigéniques)
• Réaction faussement positives au cours du
  paludisme, typhus exanthématique,
  dysglobulinémies et infections diverses à
  entérobactéries
• Résultats faussement négatifs
• Pendant la première semaine de la maladie
• Traitement précoce par antibiotiques ou
  corticoïdes
• Rares cas de typhoïdes sans élévation d'anticorps
• La sérologie est une orientation et non un
  diagnostic

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Prévention

• Surveillance épidémique nationale Institut de
  Veille Sanitaire, Centre National de Référence
• Salmonella Typhi déclaration obligatoire
• Autres salmonelles envoi au Centre National de
  Référence
• Réduction de la dissémination hygiène
• Distribution d'eau de qualité, tout à l'égout,
  traitement des eaux usées, contrôle de qualité de
  l'alimentation, zones contrôlées pour les
  coquillages
• Détection des porteurs sains à l'embauche pour
  certaines professions (cuisines, industries
  alimentaires)
• Précautions d'hygiène quand un cas se déclare
  (hôpital, crèche...)
• Vaccination contre la fièvre typhoïde chez les
  militaires et personnels professionnellement
  exposés
• TYPHIM Vi protection contre S. Typhi, peu de
  réactions secondaires

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Traitement

• Fièvres typhoïdes et paratyphoïdes
• Les souches isolées en France demeurent sensibles
  aux antibiotiques(1 de souches résistantes)
• Antibiotiques de choix bonne concentration dans
  les ganglions lymphatiques
• fluoroquinolones (voie orale préférée),
  triméthoprime-sulfaméthoxazole (Bactrim),
  céphalosporines de 3ème génération ou ampicilline
  (bonne élimination biliaire)
• Entérites et toxi-infections alimentaires
• Evolution favorable en qq jours, le traitement
  des salmonelloses est destiné à réduire le risque
  de diffusion systémique bactérienne dans les cas
  suivants
• diarrhée profuse ou très fébrile
• âge lt 3 mois
• âge gt 65 ans
• déficit immunitaire, drépanocytose, prothèse
  cardiovasculaire ou ostéo-articulaire
• Chez l'immunocompétent, une prise unique de
  fluoroquinolone raccourcit la durée de la
  diarrhée (principe ATBthérapie chez le voyageur
  par exemple )