GENETIKA IKAN

1
GENETIKA IKAN

• GEN TERPAUT SEX
• PLEIOTROPY

2

• Fenotip kualitatif bisa dikontrol oleh gen yang
  berlokasi di kromosom sex gen terpaut sex
• Penurunannya berbeda dg gen yang berada di
  autosom
• Ditemukan hanya pada beberapa spesies ikan,
  diantaranya pada GUPPY dan PLATYFISH
• Dikontrol oleh gen yang berlokasi pada kromosom X
  dan/atau Y (tidak pd kromosom W atau Z)
• GEN TERPAUT Y
• Gen yang berlokasi di kromosom Y, diturunkan dari
  induk jantan ke anak jantan.
• Hanya ada pd Jantan
• Contoh Gen maculatus pada Guppy (Ymc ,
  mengontrol pola pigmen maculatus bercak hitam
  pada sirip dorsal bercak merah pada tubuh)

3
Hanya ada 2 jenis perkawinan ? grey X ?
grey ? grey X ? Mc bisa menghasilkan ?
Mc
4

• GEN TERPAUT X
• Contoh caudalis pigmentation transparent tail
  pd Guppy

5
Ayah caudalis, anak ? semua caudalis
Ibu transparent, anak ? semua transparent
6

• FENOTIP YANG DIBATASI SEX
• Ada fenotip yang hanya terekspresi pada satu
  jenis kelamin.
• Cth sifat tigrinus (stripes pd tubuh) pada
  guppy dikontrol oleh XTi dominan yg terpaut sex
• pd kondisi normal, fenotip tigrinus tidak
• terekspresi pada ?, apapun genotipnya.
• Kebanyakan fenotip yg dibatasi sex perlu
  testosteron untuk ekspresinya.
• Kebanyakan X-linked gen pd guppy menghasilkan
  fenotip yg hanya terbatas pd ?.
• Penambahan methyltestosteron pd air atau pakan
  bisa membuat terekspresi pd ?

7

• GEN DENGAN MULTIPLE ALEL
• Masing-masing gen hanya memiliki sepasang alel
  (konsep hanya utk kemudahan).
• Pada populasi, jml alel bisa satu sampai belasan.
• Banyak gen yang memiliki 3 alel atau lebih.
• Cth Gen B yg mengontrol formasi melanin pd
  medaka.
• B dominan terhadap B
• B dominan terhadap b
• b resesif terhadap keduanya.

8

• Pada platyfish ada 9 alel pada lokus P P, PM,
  PMc, PT, PCo, PC, PCc, PO, PD.
• P menghasilkan fenotip unspott, sifatnya
  resesif thd seluruh alel. Alel sisanya adalah
  kodominan.
• menghasilkan 37 fenotip yg berbeda (visible
• 27).

9

• PLEIOTROPY, VARIABLE PENETRANCE, VARIABLE
  EXPRESSIVITY
• PLEIOTROPY
• Asumsi Gen memproduksi fenotip spesifik
• tidak selalu tepat
• - Single gen dpt menghasilkan multiple fenotip
• - Fenotip tidak selalu terekspresi
• - Ekspresi fenotip tidak selalu konstan.
• Gen mempengaruhi jalur biokimia.
• Efek fenotip sekunder disebut efek pleiotropy
• bisa kecil, atau besar.
• Bila memberikan efek yg signifikan terhadap
  meningkatnya atau menurunnya viabilitas,
  produktifitas, atau nilai pasar penting.
• Cth pada ikan mas bb (biru) gg (gold) punya
  tk pertumbuhan lebih rendah drpd warna normal
  efek pleiotropy

10
(No Transcript)
11

• Wlodek (1968) menemukan ikan mas Polish blue
  tumbuh lebih baik daripada ikan mas normal
• efek pleiotropi berbeda
• - Polish blue dan Israeli blue adalah
  fenotip yg
• berbeda, atau
• - Dihasilkan dari jalur biokimia yang berbeda
• Cth lain pd channel catfish albinisme (aa)
• efek pleiotropiknya telur kecil, kualitas
• telur rendah, pertumbuhan rendah,
• dibandingkan yg berpigmen.
• warna terang mudah dikenali predator

12

• PENETRANCE EXPRESSIVITY
• Genotip ttt tdk selamanya menghasilkan fenotip yg
  diharapkan.
• Pada aksi gen ? genotipe-genotipe yang sama
  tetapi tidak mengekspresikan fenotipe yang sama
  walaupun keadaan lingkungan seragam.
• Perbedaan ini disebut perbedaan dalam penetrasi
  (penetrance).
• Penetrance persentase individu yg keluar
  sesuai dg fenotip yg diharapkan. atau
• Penetrasi adalah presentase individu untuk
  genotype tertentu yang menampilkan fenotipe dari
  genotype tersebut.

13

• jika fenotip selalu diekspresikan penetrance
  100.
• Sex limited phenotype bisa membuat penetrance 0
  pd ? normal atau 0 pd ? normal.

Ekspresivitas adalah derajat atau tingkat suatu
genotype tertentu
mengekspresikan fenotipenya pada suatu individu.
14

• Expressivity menunjuk pd manifestasi fisika dr
  fenotip,
• yaitu, range dr ekspresi fenotip

15
(No Transcript)
16

• Glossary
• Pleiotropy (adj pleiotropic) The situation in
  which a particular gene has an effect on several
  different traits.
• Penetrance The percentage of individuals in
  population that show a particular phenotype among
  those capable of showing it, i.e., among those
  that have the genotype normally associated with
  that phenotype.
• Expressivity Degree of expression of a trait
  controlled by a gene. A particular gene may show
  different degrees of expression in different
  individuals.
• Variable expressivity Variation in the
  phenotype caused by different alleles of the same
  gene and/or by the action of other genes and/or
  by the action of non-genetic factors.
• ( Glossary of biotechnology and genetic
  engineering, FAO, 1999)

17

• LINKAGE (PAUTAN)
• Jika gen pada kromosom yg sama, dia akan berpaut
• Diturunkan secara berkelompok.
• Cth gen XVi dan XEi pada guppy terpaut pd
  kromosom X