Ingen bildrubrik

1
Maskens form säger en hel del om
dig Marika Hellqvist Institutionen
för Cell och Molekylär Biologi Göteborgs
universitet
2
The Nobel Prize in Physiology or Medicine
2002 "for their discoveries concerning genetic
regulation of organ development and programmed
cell death"
Sydney Brenner H. Robert Horvitz John E.
Sulston 1/3 of the prize 1/3 of the prize
1/3 of the prize United Kingdom USA
United Kingdom Massachusetts
Institute The Wellcome Trust Sanger Institute
The Molecular Sciences of Technology (MIT)
Institute MA, USA Berkeley, CA, USA
Cambridge, b. 1927 b. 1947 b. 1942 (in Union
of South Africa)
3

• Vad jag skall prata om idag
• Kort introduktion till ämnet molekylär biologi
• Presentation av C.elegans
• Mutanter och genetiska screener
• Har man hittat något kul då?
• Vad gör jag?

4
(No Transcript)
5
Vild typ (N2 stam)
1 mm
Sett genom stereomikroskåp
6
Anatomin är enkel men tillräckligt komplex för
att studera organutveckling och andra basala
fenomen.
7
C.elegans En 1mm lång fritt levande nematod...
Beskrivning 50 timmars livscykel (ägg till
ägg hermaphrodite och hanar ca 1) Lätt att
odla på plattor med E.coli vid 20oC Går att
frysa för långtids förvaring
8
C.elegans Livscykel
9
Vuxen Hermaphrodite
10
C.elegans En 1mm lång fritt levande nematod...
Beskrivning 959 celler (302 neuroner, 20
tarmceller Tex.) Komplett cellinje
kartlagd(från zygot till vuxen)
11
Den första celldelningen
12
Ett cell-linje träd finns för alla 1090 celler
som bildas i masken. Av dessa genomgår 131
programmerad cell död och kvar blir 959 stycken.
13
C.elegans En 1mm lång fritt levande nematod...
Beskrivning 100 Mb Genome, gt99.9 sekvensat
(6 kromosomer) människa ca 30xstörre 19 000
Gener ( 5000 essentiella gener) människa ca 70
000 gener Power of Genetics
14
Mutanter vad är det?
Mutationförändring av genomet(DNA-kedjan) 3
klasser av mutationer spontana inducerade
(kemikalier, UV,röntgen,gamma strålning) specifik
(Knock-out) Ett sekvensat genom ger oss
information om vilka proteiner som finns men inte
vad dom gör. Forward genetics man vill leta
efter en intressant fenotyp tex tjock, problem
att röra sig och ta reda på vilka gener som
påverkar dessa fenotyper Reverse genetics man
utgår från ett protein som verkar intressant och
man söker sedan efter djur med motsvarande gen
muterad.
15

• Forward genetics eller genetisk screen
• Mutagenisera med EMS, detta genererar
  punktmutationeren bas byts ut
• Titta i mikroskåp på dom muterade maskarnas
  barn
• Plocka dom som uppvisar den sökta fenotypen
• Genom att korsa med andra kända mutanter
• kan man leta sig fram i genomet och hitta den
• gen som blivit muterad.

16
Gen-namnet beskriver mutantens fenotyp
Exempel på gen-namn bli blistered cuticle dpy
dumpy unc uncoordinated eat eating
abnormal let lethal rol roller Smasmall Lon
long muvmultivulva Och så vidare.
17
Dumpy
18
(No Transcript)
19
1 mm
20
Exempel på vad man hittat Alzheimer I dom
flesta fall av ärftlig Alzheimers har man
identifierat mutationer i en gen som heter
presenilin-1. Finns en homolog i
C.eleganssel-12 Om denna gen inte kan fungera i
masken får masken en muv(multivulva) fenotyp!
21
Sel-12/presenilin är en del av en komplicerad och
konserverad signal kedja som om den förändras
leder till olika fenotyper beroende på organism.

22
Användning I masken ger mutation upphov till en
lätt identifierad fenotyp som kan identifieras i
en genetisk screen.
Det handlar INTE om att studera själva syndromet
Alzheimer utan hur det uppkommer.
Låta masken äta droger för att studera hur den
påverkas
23
Vad gör jag?
Använder genetiska screener för att hitta
proteiner involverade i fettmetabolism. Vi färgar
med ett rött färgämnen, Nile Red, och muterar
maskarna och letar efter förändringar.
24
Använder reverse genetics för att studera en gen
familj, Forkhead(fkh), involverad i utvecklingen
hos C.elegans, mus och människa. Använder bla
maskar som har vissa specifika celler (tex
muskler) markerade med GFP (Green Fluorescent
Protein). Hur ser en mask med vår gen muterad
ut?
Vi har hittat att när fkh proteinet inte finns så
har flera celler problem att ta sig till rätt
plats i masken och att differentiera,dvs få sin
specifika identitet tex bli en muskelcell.