Informations, Donnes, Connaissances

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Informations, Données, Connaissances

• Informations
• Renseignement, fait qui apporte des
  renseignements nouveaux
• Données
• Information présentée sous forme conventionnelle,
  en vue d'être traitée
• Connaissances
• Règles utilisant les données pour en déduire
  d'autres
• Informatique
• Science du traitement rationnel, notamment par
  machine automatique, de l'information considérée
  comme le support des connaissances et des
  communications dans les domaines techniques,
  économiques et sociaux (Académie Française, 1967

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Qualité des données

• Utilité caractère indispensable
• Objectivité représentation fidèle, exempte de
  préjugé
• forte (réalité indépendante de celui qui
  interprète illusoire ?)
• faible (reproductibilité)
• en médecine
• signes subjectifs (interrogatoire -cliniques)
• signes objectifs (laboratoires - numériques)
• Validité
• Exactitude (Exactness) reflet de la réalité
  (moy. observée mesures valeur vraie)
• Précision (Accuracy) liée au niveau
  d'approximation, à l'unité de mesure (dépend
  surtout de la sensibilité aptitude à déceler
  une faible différence)
• Fiabilité (Reliability) confiance inspirée (en
  rapport avec la spécificité mesure-t-on ce
  qu'on est censé mesurer ?)
• Permanente / Temporaire
• Données permanentes Sexe, date de naissance...
• Données temporaires examen clinique,
  diagnostic, traitement

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Exemple

• Exactitude et précision

V
V'
Non Exact Précis
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Variabilité

• Des sujets variabilité biologique
• Des observateurs
• inter-observateurs
• intra-observateurs
• Des données et mesures
• Instrumentale Observateurs Intra-Sujet
  Inter-Sujets

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Quelques types de données

• Qualitatives
• littérales (nom, adresse ...) alphanumérique
• ou texte
• binaires (sexe) booléen
• Nominales (couleur) code énuméré
• Ordinales
• (dépendance) numérique
• Quantitatives
• continues (taille ) numérique
• discontinues (nbre d'enfants) entier
• Dates et Heures
• date et heure date

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Description clinique

• Interprétation des nombres et des mots
• Fréquent, souvent,.gt quelle valeur
• Interprétation des associations
• Typique, rare,. gt association fortuite ou
  réelle ?
• De la description littérale à la sémiologie
  quantitative

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Un compte rendu dhospitalisation

• Madame X a été hospitalisée en urgence pour des
  douleurs thoraciques rétrosternales
  caractéristiques irradiant dans le bras gauche
  dont les premiers épisodes remontent à 2 ans avec
  survenue à l'effort ou au froid. Il n'y avait pas
  d'OAP.
• Les enzymes cardiaques étaient élevées avec un
  tracé ECG permettant d'affirmer le diagnostic
  d'infarctus postérieur du myocarde.
• Cette patiente, obèse (120KG), est porteuse d'un
  diabète équilibré dont nous n'avons pas modifié
  le traitement insulinique. Elle présente
  également une hypercholestérolémie à 3,2 g/l.
  Malgré nos recommandations, elle continue à fumer
  environ 2 paquets de cigarettes par jour. Au
  niveau gynécologique, elle a un syndrome
  préménopausique assez bien toléré pour lequel
  aucun traitement n'a été envisagé. Dans les
  antécédents, on ne note pas d'IVG, mais une HTA
  en 86.
• Le bilan habituel et le traitement par
  angioplastie endoluminale de cet infarctus ont
  permis de laisser sortir la patiente au bout de
  15 jours.

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Première étape extraction

• En gras concepts sans ambiguité
• En italique rouge données à interpréter en
  fonction du contexte et des connaissances
  médicales
• En bleu abréviations et données ininterprétables

9
Extraction

• Madame X a été hospitalisée en urgence pour des
  douleurs thoraciques rétrosternales
  caractéristiques irradiant dans le bras gauche
  dont les premiers épisodes remontent à 2 ans avec
  survenue à l'effort ou au froid. Il n'y avait pas
  d'OAP. Les enzymes cardiaques étaient élevées
  avec un tracé ECG permettant d'affirmer le
  diagnostic d'infarctus postérieur du myocarde.
• Cette patiente, obèse (120KG), est porteuse d'un
  diabète équilibré dont nous n'avons pas modifié
  le traitement insulinique. Elle présente
  également une hypercholestérolémie à 3,2
  g/l.Malgré nos recommandations, elle continue à
  fumer environ 2 paquets de cigarettes par jour.
• Au niveau gynécologique, elle a un syndrome
  préménopausique assez bien toléré pour lequel
  aucun traitement n'a été envisagé. Dans les
  antécédents, on ne note pas d'IVG, mais une HTA
  en 86.
• Le bilan habituel et le traitement par
  angioplastie endoluminale de cet infarctus ont
  permis de laisser sortir la patiente au bout de
  15 jours.

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Interprétation

• Fonction des connaissances médicales

douleurs thoraciques rétrosternales
caractéristiques irradiant dans le bras gauche
dont les premiers épisodes remontent à 2 ans
avec survenue à l'effort ou au froid.
Angor
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Décodage des abréviations

• Parfois impossible

Oedème aigu du poumon
OAP.
Électrocardiogramme
ECG
Insuffisance ventriculaire gauche / Interruption
volontaire de grossesse
IVG.
Hypertension artérielle / Hystérectomie totale
par voie abdominale
HTA
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Structuration par problème médical

• Rattacher les différents éléments à un problème
  médical précis (quand cela est possible)

Madame XInfarctus postérieur aigu du myocarde
avec Angor ancien, tracé ECG
caractéristique Enzymes cardiaques
élevées sans Oedème aigu du poumonAutres
problèmes actuels Diabète insulinodépendant Hy
percholestérolémie Tabagisme -
Obésité Syndrome préménopausique ?Problème
passé pouvant avoir des conséquences Hystérectom
ie totale par voie abdominale en 1986Actes
diagnostiques Bilan habituelTraitement
Angioplastie endoluminale
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Codage des informations

• Utilisation dun langage formel C'est la seule
  manière d'éviter la polysémie et de pouvoir
  envisager des traitements automatiques sur les
  données.
• Nomenclatures ou catalogues
• Collection méthodique, liste systématique des
  termes ou mots en usage, des informations
  concernant un champ sémantique défini (art,
  technique, science, médecine...)
• Un libellé (libre, long) ltgt Un code
• Si possible exhaustive
• Objectif décrire
• Exemple la nomenclature générale des actes
  professionnels (NGAP) utilisée pour la
  tarification des actes en médecine libérale
• Dictionnaires
• Recueil de mots, d'expressions d'un langage,
  présentés dans un ordre convenu et destiné à
  apporter des informations sur des termes, des
  signes ...
• Objectif définir

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Codage des informations

• Thésaurus
• Répertoire (alphabétique) de Nomenclatures
• Relations
• d'appartenance
• de proximité sémantique (analogie)
• de synonymie
• d'exclusion
• Exemple MESH
• Objectif analyser et chercher
• Classifications
• Action de distribuer par classe, par catégorie
  définie a priori en fonction des connaissances du
  moment
• Consiste à ranger dans un même groupe et à
  désigner du même nom des faits, objets ou êtres
  qui possèdent en commun certaines
  caractéristiques
• Thésaurus structuré - hiérarchisé
• Exemple CIM 10
• Objectif classer pour pouvoir rassembler de
  manière hiérarchique le plus souvent

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Codage des informations

• Utilisation de classifications partagées par les
  pairs en vue dobtenir un traitement automatique
  de linformation par un ordinateur
• Hypertension artérielle essentielle I10 en CIM
  10
• Pour
• Dénombrer et réaliser des statistiques
  (épidémiologie)
• Connecter lobservation à des systèmes daide
  comme les guides de bonnes pratique cliniques

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Notion de diagnostic et autres motifs de recours

• Diagnostics
• Maladies identifiées
• Complications
• Signes symptômes
• Facteurs de risque
• Autres motifs de recours
• Circoncision rituelle
• .
• Quelle définition pour quel usage
• Exemple
• certificat de mortalité
• PMSI
• Maladies à déclaration obligatoire

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Sémiologie quantitative

• Prévalence / Incidence
• Prévalence Fréquence de la maladie dans la
  population
• Incidence fréquence des nouveaux cas dans une
  population par unité de temps
• Sensibilité / spécificité
• Sensibilité fréquence de la présence dun signe
  chez les malades
• Spécificité fréquence de labsence dun signe
  chez les non malades
• Problème de la valeur seuil
• Valeur prédictive
• VPP fréquence de la maladie quand le signe est
  présent
• VPN fréquence de labsence de la maladie quand
  le signe est absent

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Le tableau à 4 cases dans un échantillon
représentatif

• La notion de signe présent
• Soit un signe qualitatif binaire éruption
• Soit une valeur quantitative supérieure
  (inférieure) à un seuil glycémie gt 1,2 g/L

Prévalence (AC)/N Sensibilité
A/(AC) Spécificité D/BD VPP A/(AB) VPN
D/(CD)
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Valeur seuil

• Influence sur la sensibilité et la spécificité
• Spécificité 1 Faux positif
• Sensibilité 1 Faux négatif
• Si seuil se déplace vers la droite
• Augmentation de la spécificité
• Diminution de la sensibilité
• Courbe de ROC

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Probabilité de trouver au moins un résultats
anormal chez une personne en bonne santé

• Calculable à partir des sensibilités, spécificité
  et prévalence

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Discussion

• Les indicateurs de la valeurs informationnelle
  sont utiles pour la stratégie diagnostique.
• Ils peuvent être utilisés dans des systèmes
  informatiques daide à la décision
• Mais
• La description de la population étudiée
  correspond-elle à ma pratique ?
• Les sujets examinés dans létude sont-ils
  comparables à mes patients ?
• Quelle est la valeur du test choisi comme test de
  référence (gold standard) ? Permet-il détablir
  le statut du patient avec certitude ?
• Linterprétation du test sest-elle faire en
  aveugle ?
• Les effets de la prévalence sont-ils examinés
  soigneusement ?