Procaryote

1
?????? 2.?????????
????
???
???
?????????????????????????95 99.9
?????????????300 ???????????????????????????? (??
???Bergey Medal???????)
Eucaryote ????
Procaryote ????
??????????????????????????????????????????
2
???????? ??????????
??????????????????????????????????????????????????
??????????????????????????????????????????????????
??????????????????????????????????????????????????
??????????????????????????????????????????????????
???????????????? 44??(1872 )????????4 ???????
1)Sphaerobacteria (Cocci ??), 2)Microbacteria(sh
ort rods ???), 3)Desmobacteria(elongate rods
???) 4)Spirobacterien(spirals ???)
??? Ferdinand Julius Cohn 1828 - 1898
1885? ?????????????(???)
??????Bergeys Manual of Systematic Bacteriology.
?????2005
3
???????? ?????
????????
1876(33?) ???????????????????????????????????????
????? ??????????????????????????
1882?3?24?(39?) ????????????????????(????????3?24?
???????)? 1883(40?) ???????????????? 1890(47?)
????????????????????????????????????????????????
1905(62?) ??????????????
??? Robert Koch 1843 - 1910
?????? 1. ??????????????????????? (??) 2.
?????????????(???) 3. ??????????????????????????
??????? 4. ???????????????????????
4
????????????????
He followed the method of Paul Ehrlich, using
aniline-water and gentian violet solution. After
further treatment with Lugol's solution (iodine
in aqueous potassium iodide) and ethanol he found
that some bacteria retained the stain (Gram
positive) while others did not (Gram negative).
???????????
??? Hans Christian Joachim Gram 1853 - 1938
1938 ?????????? 1878 Copenhagen ??(??) 18831885
Berlin??? 1884(44?) ?????????
?????(?????)
?????(???)
5
???????????????
??????????????????????????????????????????????????
??????????????????????????????????????????????????
???????????????????????????
187883 ????????????? 1885 ?????????(1889 ???1891
???)
1890 ???????????????? 1891 ??????????????(???????
?????????????????????) 1896 ???????? 1904
????????????????????? 1906 ??????????????????? 190
8 ????????????????????? 1912 ??????????????????
(? ?????????)
1882 ?????(??????????????)???????????????????????
?????????(?????????????)
????????? Paul Ehrlich 1854 1915
6
??????? ?????
??5? - ??6?
1886(??19)????6???????????????????????????????????
????????????????????????3??????????????????(1882
)??7???????????(1890 )?1??????????????????????????
???????????????????????????
7
?????????100?
????????????????
?????????????????????????????????????????
??????????????????????????(??)??????????????(????)
??????????????????????????????????????????????????
??????????????????????????????(1889?)?
??????????????????????????????????????????????????
???????????????
???????????????
?????
??????????? ????????
????????????????????????????????????????????
??????????????????????????????????????????????????
??????????????????????????????????????????????????
?(???????????????)?????????????????????(???)??????
????????????????????????????????????????????????(1
890?)? ???????????????????????????????????????????
????????????
?????????
8
????????
????????? ????????
??????????????????????????????????????????????????
???????????????????? ???????????? ????????
???????????????????????? (??????)????????????????
(??)?????????????????(??)?????????????????????????
??????????????????????????????(???????)???????????
???????
9
????????? 2008?4? ?????????????
1893 ??????????????????(???????) 1914 ????????
?????????(1918 )????????????(1941 ) 1957
?????????????(1996????????) 1961
????????????????????????? 1962 ???????????????????
? 1972 ???????????? 1980 ???????????(???)????? 200
1 ??????????????????? 2002 ??????????????????????
2008 ???????????????????????????????????
??41?(1908) ????????
??????????150?
? ????????????????????????????????????????????????
??????????????????????????????????????????????????
??????????????????????????????
????????????????
10
????????????????
??????????????????????????????????????????????????
??????????????????????????????????????????????????
??????????????????????????????????????????????????
??
??(? ???)????????????????????????????????????????
??????????????????????????????????????????????????
????????? ????????????????????????????????????????
??????????????????????????????????????????????????
??????????????????????????????????????????????????
??????????????????????????????????????????????????
??????????????????????????????????????????????????
??????????????????????????????????????????????????
???????????????????????????
11
????????
1822? ???????????????? 1846(24?)
????????????? 1849(27?) ????????? 1861(39?)
?????????????????????????????? 1862(40?) ?????
?????(?????????)??? 1865(43?) ???????(????)?
????????????? 1885(63?) ?????????
???????????????????????????????????? 1895(73?)
??????????????
????? Louis Pasteur 1822 - 1895
???????????
????? ?????????????????????
1665? ????????????? ?????????????? ?????????????
???????????????????????????????????????????
??????????????????????!
????????
12
?????
?????? Tyndall Effect ?????????????????(Rayleigh??
)?????????????????????????????????????????????????
???????????????????
???? John Tyndall 1820 1893
??????????(????????????)??????????????????????????
??????????????????????????????????????????????????
??????????????????????????????????????????????????
??????????????????????????????????????????????????
??????????????????????????????????????????????????
???????????????????????????????????????????
13
??????????????
???(1872 )????????? ???(1844)???????????? ??(1889)
????????????????
???????????????1876???????????????????????????????
??????????? (History of science--spores)
????????????????

• ???????????? ?????????
• 2. ?????????? ????????
• 3. ??????????(??????) ?????
• 4. ????????????(?????) ???????
• 5. ????? ????????????????
• 6. ??????? ?????????????
• 7. ?????????????????? ??????????
• 8. ?????????????? ????(???????)
• 9. ?????????????? ????????(???????????????)
• 10. ?????????? ?????????

14
?????(Hucker?)
?
?
1.?????? ? ????????????????????????1???? ?
?????????? ? ??????????? ?????????????????????????
??? 2.Hucker???1????(???) 3.??
??????? 4.??????1?30???????? ?? ???????????
5.?????????20???? 6.?????? ???????
7.???????30????(???) 8.?? ???????????
9.?????(??X100)
?
Hucker? ??????????????????????,??????????????????
???????Hucker????????????????????????????????????
???(????) ???????????????????????????????????????
,????????????????????????
????1884??????????????????????????????????????????
??????
15
??????????(?) ?????????????????????????????
?????????????????????????????????????????????????
(?)?????????? 10-100nm?????????????????????(????)
????????????????????????? (?)??????????
??????????????????????????????????????????????????
???????
16
????????????????? 1882?3?24??????39???????????????
??????????????????????????????????????????????????
?????????? ?????????????? ???????????????????????
??????????????????????????????????????????????????
??????????????????????????????????????????????????
???????????? ??????????? ???????????
??????????????????????????????????????????????20
?????????????????????????????????????????????????
??????????????????????????????????????????????????
??????????????????????????????????????????????????
?????????????????????????????????????????(acid-fas
t bacteria, ?????fast????????????????)?????????
?????????????? Ziehl Neelsen staining
17
?????????????????? ???????????????????????????????
??????????????????????????????????????????????????
????????????????????????????????????????????????
? ?????????????
3???????????1?????4????????2???????????0.1ml????
? ????????????????????? 3????2??????????????????
???????????pH????????? ? ????????????????
??????
?????(????)?????
???????2??????? 37???3???????????????
18
??(????)???(????)
??? ????? (C6H12O6) 2NAD 2ADP 2Pi ? 2
????? (C3H4O3) 2NADH 2ATP 2H
?????? 2 ????CoA (CH3COSCoA) 6NAD 2FAD
2GTP 2Pi(???) 6H2O ? 4CO2 6NADH 6H
2FADH2 2GTP 2HSCoA
??
??????? 10NADH 10H 2FADH2 6O2 ? 10NAD
2FAD 12H2O
????? (C6H12O6) 6O2 38ADP 38Pi ? 6CO2
6H2O 38ATP
??????????????????????????????????????????????????
??????????????????????????????????????????????????
??????????? O2 ????? ?????????????? H2O2
????????? O2- ????????????. ?????????????????????
??????????????? superoxide dismutase
??????????????????????????????????????????????????
???
????
??????? C6H12O6 2ADP 2Pi(???) ? 2C2H5OH
2CO2 2ATP ???? C6H12O6 2ADP 2Pi ? 2C3H6O3
2ATP
19
??????????????????????
????????????????
??????????
??
??
20
TCA??
?????????????
TCA??
??????????
21
???????
??????????????
????? ??2??????????????3??rRNA?53??????????????4?
? rRNA ?82???????????? rRNA ????????(ribozyme??)?
???? ????????????????????? ????
??????????????????????????
22
????
????????????
??????????????????????????????????????????1928????
??????????????????????????????????????????????????
??????????????????????????????????????????????????
??????????????????????????????????????????????????
????????????????????
????? Alexander Fleming 1881 1955)
????????????????????????????????????????????Penici
llium??????????????????? ????????????????????192
0?????????????????????????????????????????????????
??????????????????????????????????????????????????
??????????????????????????????????????????????????
????????????????
????????????????????????????
23
???????? ????????????????????????????????????????
???????????????????????????????? ????????
??????????????????????????????????????????????????
?? ??????? 1940-50???????????????????????????????
??????????????????1957???????????????V???????????
??????????????????????????????????????????????????
??????????????????????????????????????????????????
???????
?????G ???
??????????3D???
??????????????????????PBP(???????????)??????????
????????ß?????????????????????????????????????????
?PBP??????????????????????????????????????????????
????PBP?????????????????????????????????????ß?????
????????????????????????
?????
24
????????
?????(Tyndallization) ???????????????????????????
1?15-30???????????????????35?????????????????????
?????(??Heat Shock?????????)??????????????????????
???????????????????????????????????t???
??(sterilization) ??????????????????????????????
???????????????????????(sterile)??????????????????
?????(??????? 121??15?)?????(180??30?)?????(?????
??????????)????????????????????????????????? ??(pa
steurization) ?????????????????????????(63??30?
)????????????? ??(disinfection)
??????????????????????????????????????????????????
?????????? ??????????? ????????????????????????
?????????????????????????????????????(????????????
?)
?????? (Web???)
25
????????????? International. Committee of
Systematics of Prokaryotes (ICSP)
Volume 1 (2001) The Archaea and the deeply
branching and phototrophic Bacteria Volume 2
(2005) The Proteobacteria Volume 3 (2008)
The Firmicutes Volume 4 (2008) The
Bacteroidetes, Planctomycetes, Chlamydiae,
Spirochaetes, Fibrobacteres, Fusobacteria,
Acidobacteria, Verrucomicrobia, Dictyoglomi and
Gemmatimonadetes Volume 5 (2009) The
Actinobacteria
Bergey's Manual Trust
Bergey's Manual of Determinative
Bacteriology Bergey's Manual of Systematic
Bacteriology
?????
??????Bergeys Manual of Systematic Bacteriology.
?????2005
26
?????? 2
????(???????????? ???????)
27
????????? (Aquificae) ?????? (Thermotogae) ???????
??????? (Thermodesulfobacteria) ????????????
(Deinococcus-Thermus) ????????? (Chrysiogenetes)
???????? (Chloroflex) ?????????
(Thermomicrobia) ??????? (Nitrospira) ?????????
(Deferribacteres) ????????? (Cyanobacteria) ?????
?? (Chlorobi) ?????????? (Proteobacteria) ???????
? (Firmicutes) ???? (Actinobacteria) ?????????
(Planctomycetes) ?????? (Chlamydiae) ???????
(Spirochaetes) ????????? (Fibrobacteres)
????????? (Acidobacteria) ????????
(Bacteroidetes) ???????? (Fusobacteria)
????????? (Verrucomicrobia) ???????????
(Dictyoglom) ???????? (Gemmatimonadetes)
?????????!
?????
???? ??????
28
??????????
29
????
The Taxonomic Outline of Bacteria and Archaea
????
?????
International. Committee of Systematics of
Prokaryotes, ICSP
30
?????(????)
????? - ????????
?????????????????
????
???
???
31
?????????????(reverse transcriptase)???
???1977?????????RNA???????????????????????????(int
ron)????????????(exon)??????????????????(splicing)
??????????????????????????????????????????????????
?????????????????RNA??????????????????????????????
???RNA????????????????????????????????????????????
??????????RNA?????????????????????????????????????
???????????????????????????????RNA???????????????
??RNA???????(editing)??????????RNA????????????????
???????????????????????????????
?????????????????????????
??????? ????? ??
???? ?????
????????4??????
70???????????????????????
???(Howard M. Temin)
??????????
????? ??
70??????????RNA?DNA????????????????????
1970????
Temin and Mizutani,1970. RNA-dependent DNA
polymerase in virions of Rous sarcoma virus.
Nature, 226,1211
??????????
?????????????
???????
32
?????????????????????????????????????????????(????
?Archaea)?????(Eubacteria)??????????? ???NCBI
Taxon?????????????????????? Archaea (????)
Eubacteria (????)Eukaryota
(????)Viroids (?????)Viruses
(????)Other (???)Unclassified (???)