Logiciels de Gestion de Rfrences Bibliographiques

1
Logiciels de Gestion de Références
Bibliographiques

• (Bibus, )

Gabriel Gallezot gallezot-at-unice.fr
2
Quel outil ?

• Un outil en  local  ? Bibus, biblioexpress,
  Zotero, Jabref, OOo, EndNotes, Refmanager
• Un outil en  ligne  BibliOpera, Basilic
  CiteULike, Connotea, refworks

3
Bibus

• Installation (chez vous) avec  un rapide  pas à
  pas 
• http//bibus-biblio.sourceforge.net/wiki/index.php
  /Main_Page
• Spécificités
• Gratuit (GNU GENERAL PUBLIC LICENSE)
• MultiOS avec quelques spécificités et plusieurs
  développement à venir
• Connexion avec MsWord et OOo (sauf sous Mac
  actuellement)
• Import/export avec format Endnote et Bibtex
• Manque un import en  texte  (tabulé)
• Orienté  Biomed  (connexion Pubmed et EtBlast
  les autres bases ?)

4
Zoterohttp//www.zotero.org/

• Intégration navigateur (FF2) gt multiOS, pas de
  pb dinstallation
•  Filtrage  de nombreuses bases
• Connexion avec Msword et OOo (et NeoOffice)
• Gestion de Refs biblio mais aussi des liens
  (copie de la  page  consultée)
• Possibilité dattacher le doc à la ref
• Bcp de développement à venir

5
Bibus
6
Rapide Pas à pas pour une install sous WinXP
(1)

• Téléchargez Bibus ici
• http//bibus-biblio.sourceforge.net/wiki/index.php
  /Main_Page
• Pour winXP bibus-1.3.0-Win32-Full-Setup.exe
• double cliquez sur l'icone "bibus" aprés le
  téléchargements
• ensuite plusieur fenêtre vont se succéder
  (j'indique juste ce qu'il convient de faire)
• choisissez "français"
• suivant
• j'accepte
• suivant
• suivant
• installer
• si vous n'avez pas OpenOffice.org (OOo) un msg
  d'alerte vous prévient
• (le plus simple, mais ce n'est pas une
  obligation, c'est peut-être de télécharger ce TTX
  gratuit qui remplace trés largement la suite de
  MS office Word, excel, PPT, ...)
  http//fr.openoffice.org/
• c'est installé enfin presque ? dia suivante

7
Rapide Pas à pas pour une install sous WinXP
(2)

• Démarrez Bibus (menu démarrer sous window gt
  Bibus)
• des msg d'erreur apparaissent ("dtBib.getRoot
  not such table bibrefKey"s, ....)
• cliquez OK à chaque fois
• Vous arrivez devant la fenêtre Bibus
• allez dans le menu "Aide" puis gt "première
  connexion"
• cochez Word si vous avez word, OpenOffice.org
  (OOo) si vous l'avez, puis "Next"
• "Next" si vous avez word (et si vous avec OOo
  "Activer", ensuite c'est indiqué)
• 'next" pour utiliser SQLite (les pros seront quoi
  faire avec MySql)
• choissez le nom d'utilisateur (votre nom c'est le
  plus simple), puis "Next"
• Donnez un nom à votre base (exemple
  BASE_Votre_Nom, observer aussi le chemin daccès)
  puis "ok"
• maintenant vous devriez voir une liste dans la
  colonne de gauche ( Références, Marquées, Toutes,
  ...)
• L'installation est vraiment terminées
• ....
• Rentrer les ref une à une ou vous servir de la
  fonction import comme montré en cours... sinon
  l'aide (menu "aide" gt "documentation)

8
Répertoire  Bibus  dans  Program Files 
9
2 fichiers à observer

• Le fichier  base de données  (le nom que vous
  avez donné à linstallation et si vous avez
  choisi cet emplacement)
• Le fichier  bibus.config 
• et aussi
• Le désinstallateur uninst.exe
• Tous les  fichiers et répertoires logiciel 
• Ce répertoire pourra servir aux raccourcis du
  menu éditeur de ref

10
Insérer une ref  à la main 

• Menu Références gt Nvelle références
• Fenêtre  éditeur de références 
• Choix du type de doc
• Champ auteur 
• Nom1, ABNom2, CDINom3, XYZ
• Choix revues
• attention au abréviation
• et à la saisie en générale
• Editer une ref double-click

11
Chercher des Ref

• Dans la base  Bibus 
• Dans Pubmed
• Le principe des tampons Online/import

12
Classement des ref

• Les différentes catégories existantes
• Créer des sous catégories
• Glisser /déposer les ref (drag drop)

13
Supprimer une ref

•  Fausse  suppression, dans les catégories et
  sous-cat de  Références  (et  Marquées )
• Pas de suppression dans le(s) tampon(s) car
   vidé(s)  à chaque nouvel import
• Pas de suppression dans  Toutes  car
  multi-utilisateurs possibles
• Vrai suppression (SQLite database browser et
  add-on FF http//sqlitebrowser.sourceforge.net/de
  velopment.html
• https//addons.mozilla.org/en-US/firefox/addon/581
  7

14
Import/export

• Test avec, Science Direct, ProQuest, HAL (CCSD),
  Google scholar et dautres bases ou dautres
  sites (citeUlike, connotea)
• Test via Zotero (utile pour grouper des ref avant
  export vers Bibus)
• Echange de Fichier entre utilisateurs
• BibusltgtBibus, EndNoteltgtBibus,
• Export en HTML gt lister une biblio
• Bien regarder les formats import/export

15
Préférences

• Edition gt Préférences (cocher Pref Avancées)
• Changer laffichage des références
• Gérer les styles dimpression
• Gérer les champs de recherche dans la base bibus
• Gérer le contrôle des doublons
• Gérer les champs de léditeur de références
• Gérer les Raccourcis de léditeur de références
• Déterminer un répertoire de stockage des doc pour
  gérer les liens (champ URL dans Ed des Pref)
• Gérer la liaison avec la base (SQLite ou MySQL)
• Gérer la liaison avec OOo ou MS Word

16
Les raccourcis

• Éviter la saisie déléments récurrents
• Éviter les fautes de frappes,
• Édition gt Préférences gt onglet Raccourcis
• Nouveau gt nom du Raccourcis gt nom et emplacement
  du fichier qui conservera la liste
• Éditer gt Capturer gt choisir le champ de la base à
  capturer (ex Raccourcis  Revues , capturer
   Journal )
• pour compléter la liste de chaque raccourcis
  Éditeur de Ref gt Raccourcis gt Capturer la
  sélection
• Gérer la liste de chaque raccourcis par  Éditer
  les raccourcis 

17
Les champs  Custom 

• Ajouter des types de doc (BIBbase.NAME_TYPE'CUSTO
  M1' 'BREVET )
• Ajouter des champs à une ref (BIBbase.NAME_FIELD'
  Custom1' 'OAIdentifier )
• Soit à linstallation
• Soit en modifiant le fichier de config
• Fichier de config C\Program Files\bibus\bibus.c
  onfig
• Quelques bugs observés (pas changement de type de
  doc dans les Prefs, mais dans léditeur de Ref
  ok)

18
Partagé

• 2 (n) utilisateurs, une même base
• Fichier gt Se connecter, puis choisir un autre nom

19
Liaison avec TTX

• Choix à linstallation
• Pour changer après linstallation
• Edition gt Préférences gt Onglet  traitement de
  texte  ( utiliser lascenseur latéral)
• Choisissez votre TTX
• Ouvrez votre TTX
• A partir du menu MsWord ou OOo
• Insérer une citation

20
Choix des Styles

• Dépend de la communauté scientifique, des revues,
  de léditeur,
• Les styles répandus gt menu  Styles 
• Liste de styles créer par dautres utilisateurs
  ( Charger ) http//bibus-biblio.sourceforge.net
  /wiki/index.php/Bibus_Styles , http//www-cbd.ups-
  tlse.fr/imagerie/tech/bibus/index.php
• Créer son(ses) style(s)
• Attention à lemplacement denregistrement
  (valable pour suppression des styles après
  redémarrage)
• gt  nouveau ,  Éditer ,

21
Editer son Styles

• Penser à chaque type de doc
• Citations gt dans le texte
• Bibliographie gt fin de texte
• Pour vérifier
• gt liaison avec TTX

22
Quelques exercices

• Insérer une ref. à la main
• Ajouter/gérer les catégories
• Chercher une ref
• Choisir/éditer un style (charger autres styles
  cf.site bibus)
• Import (scholar, CiteUlike, ScienceDirect)
• Export (Html,)
• Insertion dans Ttx
• Changer de Ttx

23
Vos questions ?