Sin ttulo de diapositiva

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Identificación de marcadores moleculares de
importancia económica para camélidos
sudamericanos INIA-CRI La Platina Ing. Agr.
Ph.D. Jorge García Huidobro, Bioq. Dr. Patricio
Hinrichsen, Med. Vet. Rafael Mancilla, Bioq.
Víctor Obreque, Lic. Bioq. Geneviève
Merabachvilli. INIA-CRI Kampenaike, Med. Vet.
Etel Latorre. Escuela de Agronomía, Pontificia
Universidad Católica de Chile, Ing. Agr. Ph.D.
Fernando Bas, Dr. Cristian Bonacic, Ing.Agr.Sr.
Benito González y la Med.Vet. Srta.Beatriz
Zapata. Universidad de Kentucky Dr. Gus Cothran.
Figura 2.- Secuencia de tipo de una repetición TG
(microsatélite)
Resumen La diversidad genética existente entre
poblaciones que representan a las cuatro especies
de camélidos sudamericanos (CSA) fue estudiada
mediante el desarrollo y utilización de
marcadores moleculares (SSR, RAPD, AFLP y SCAR).
Estos marcadores permitieron determinar las
relaciones de similitud genética entre los cuatro
taxa de CSA, así como respaldar registros
genealógicos. Con respecto a los microsatélites,
se identificaron cerca de 70 marcadores
polimórficos aislados de una genoteca genómica de
CSA, 23 de ellos se seleccionaron y
caracterizaron para los estudios de población y
filiación. Los datos obtenidos a partir del uso
de los marcadores moleculares fueron analizados
con diferentes paquetes estadísticos, lo que
permitió estimar las diferencias genéticas
existentes en los CSA. En este contexto, se
encontró que alpacas y vicuñas forman un grupo
separado de guanacos y llamas. Las especies
domésticas generaron grupos mas heterogéneos que
las especies silvestres. Finalmente utilizando
el rebaño del CE de Hidango, se generaron las
pautas y protocolos pertinentes para implementar
un registro genealógico, que consideró las
características fenotípicas de calidad de fibra y
mediciones zoométricas. En conclusión se
implementaron todas aquellas metodologías y el
material humano necesarios para el uso de
técnicas de DNA en la filiación de CSA como apoyo
a los registros genealógicos.

• Resultados Obtenidos
• Se identificaron un número significativo de
  microsatélites con un alto grado de polimorfismo,
  para su uso en las cuatro especies de camélidos
  sudamericanos.
• Se logró definir las relaciones de similitud
  genética entre las especies de camélidos
  sudamericanos usando estos marcadores de
  microsatélites.
• Se complementó la información con una gran
  cantidad de marcadores de RAPD y AFLP (gt 200 loci
  genéticos polimórficos), cuyos resultados fueron
  coincidentes a los obtenidos con microsatélites,
  separando a las alpacas y vicuñas en un grupo
  genético diferente de llamas y guanacos.
• A partir de algunos marcadores de RAPD
  especie-específicos, se desarrollaron marcadores
  de tipo SCAR, los que tendrán su principal
  aplicación en determinación de pureza genética
  de razas y especies.
• Los microsatélites desarrollados, nos permitieron
  contar con un método rápido y certero para la
  identificación de filiación de CSA.
• Citogenéticamente se detectaron diferencias en el
  patrón de bandeo GTG entre algunos de los
  camélidos sudamericanos. Estas diferencias no
  habían sido reportadas previamente, pudiendo
  corresponder a reordenamientos cromosómicos o
  inversiones paracéntricas, producidos durante la
  especiación.
• Se elaboró un idiotipo fenotípico de alpaca,
  basado en mediciones zoométricas, los que están
  disponibles para la implementación de un registro
  genealógico de CSA

Figura 1.- AFLP
Tabla 1.- Calificación de CSA
Objetivo General Utilización y desarrollo de
marcadores moleculares en camélidos
sudamericanos, que permitan interpretar las
relaciones de filiación, determinar los grados de
hibridismo ínter e intra especie e identificación
de la diversidad genética dentro de cada especie.

• Objetivos Específicos
• Identificar secuencias de microsatélites
  presentes en el genoma de la alpaca.
• Diseñar partidores de PCR que sean capaces de
  amplificar regiones del genoma que contengan
  estas secuencias de microsatélites y determinar
  aquellos que den la mayor información basándose
  en el nivel de polimorfismo detectado.
• Describir la variabilidad genética de poblaciones
  cautivas y silvestres de CSA.
• Desarrollar protocolos de filiación genética como
  respaldo a un registro genealógico para CSA.
• Iniciar los estudios para el desarrollo de una
  mapa de ligamiento de la especie alpaca, par lo
  cual se deben definir las relaciones entre la
  información genética obtenida y el fenotipo de
  los animales muestreados.

Colaboraron Dra. María Angélica Alliende INTA,
U. De Chile Alumnos Paola Mandiola, Juan Ureta
y Fred Aros.
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