Slayt 1

1
(No Transcript)
2
Pürinler
Pirimidinler
3
Seker

• Pentoz (5-C seker)

4
Nükleozit
5
Nükleotid
6
(No Transcript)
7
(No Transcript)
8
Pürin ve primidin bazlarinin katabolizmasi ve
yeniden kullanimi
mavi-katabolizma kirmizi-salvaj yolu
endonukleazlar pankreatik RNAse pankreatik
DNAse Fosfodiesterazlar Genellikle non-spesifik
9
Page 1069
10
(No Transcript)
11
PRPP sentetaz
(-)
AMP, ADP, GDP
12
(No Transcript)
13
Transformilasyon reaksiyonlari multiprot.
kompleksi tarafindan katalizlenir
Kompleksin bilesenleri GAR transformylase
(4) AICAR transformylase (10) serine
hydroxymethyl transferase, trifunctional
formylmethenyl-methylene-THF synthase (activities
shown with asterisk)
14
AMP ve GMP den ATP ve GTP olusumu
Spesifik kinazlar GMP ATP lt-------gt GDP ADP
Guanilat kinaz AMP ATP lt-------gt 2
ADP Adenilat kinaz Nukleozit difosfat kinaz
(NDK) enziminin katalizledigi reaksiyon ile
trifosfatlara dönüsüm GDP ATP lt------gt GTP
ADP
15
GMP redüktaz
GMP IMP
()
(-)
GTP XMP
AMP deaminaz
AMP IMP
(-)
()
K, ATP Pi, GDP, GTP
16

• AMP H2O ? IMP NH4 (AMP Deaminase)
• IMP Aspartate GTP ? AMP Fumarate GDP Pi
  (Adenylosuccinate Synthetase)
• Iki reaksiyonun toplami
• Aspartate H2O GTP ? Fumarate GDP Pi
  NH4
• Iki reaksiyonun birlesimi GTP harcanarak
  aspartatin fumarata deaminasyonudur

17
Purin Nükleotid Döngüsü
Net AspGTPH2O?NH3GDPPifumarate
18
Purinlerin salvaj yolu Hipoksantin-guanin
fosforibozil transferaz (HGPRT)
HGPRT
Hipoksantin PRPP
IMP PPi
APRT
Adenin PRPP
AMP PPi
APRT Adenin fosforibozil transferaz
19
Kontrol
20
Purin Nükleotid Yikimi
21
Ürik asidin sonu
22
(No Transcript)
23
Pyrimidine Synthesis
24
UTP 3 basamakta CTP ye dönüsür
UMP ATP
UDP ADP Pi 1 UDP ATP
UTP ADP Pi
2
Nükleozit monofosfat kinaz
Nükleozit difosfat kinaz
25


3
26
(No Transcript)
27
(No Transcript)
28
Bir enzyme, ribonucleotide reductase, tüm
ribonucleotidleri deoxyribo türevlerine
dönüstürür.
Serbest radical mekanismasi ribonucleotide
reductase reaksiyonunda rol alir. Dogada 3
sinif ribonucleotide reductase var Class I
tyrosine radikal, NDP kullanir Class II
adenosylcobalamin. NTP kullanir (cyanobacteria,
bacteria, Euglena). Class III SAM and
Fe-S radical, NTP lari kullanir. (anaerobes and
fac. anaerobes).
29
(No Transcript)
30

• KAP Sentetaz II allosterik olarak kontrol edilir
• (Ökaryotlarda kontrol basamagi)
• PRPP ve IMP aktivatör
• Bazi primidinler inhibitör
• Aspartat transkarbamoilaz prokaryotlarda kontrol
  basamagi

31
Fe-içeren ribonükleozit difosfat redüktaz
ribonükleozit difosfatlari karsilik gelen
deoksiribonükleotidlerine indirger NDP ? dNDP
32
(No Transcript)
33
Salvage and de novo pathways to thymine
nucleotides
34
Timidilat sentaz ve tetrahidrofolat metabolizmasi
enzimleri arasindaki iliski
35
Thioredoxin and glutaredoxin okside RR yi
indirger
NDP indirgenmesi için electron transfer yolu
36
RR is feedback yoluyla düzenlenir. Herhangibir
dNTP nin bulunmamasi öldürücüdür vefazla
bulunmasi da DNA ya hatali nükleotid
eklenmelerine neden olur
37
dUMP metil vericisi olarak methylene-tetrahydrofol
ate kullanilarak thymidine synthetase enzimi ile
dTMP ye dönüstürülür. Bu rxn. THF in hem karbon
vericisi hem de indirgeyici ajan olarak
kullanildigi bilinen tek rxn. dur.
38
Timidin sentaz ve DHFR are kemoterapi için hedef
enzimlerdir
39
Antifolatlar antikanser ilaçlardir
40
Primidinlerin katabolizmasi
Primidinler okside olmak yerine indirgenirler
41
dUMP nin metilasyonu dTMP olusturur

• Deoksitimidilat (dTMP) ( DNA sentezi için
  gerekli) UMP den 4 basamakta olusur

UMP UDP dUDP dUMP dTMP
42

• dUMP den dTMP sentezi

43
(No Transcript)
44
Timidinden dTMP olusturan salvaj yolu
45
Insan dihydrofolate reductase (DHFR)

• Metatroksat (kirmizi) DHFR enzimini inhibe eder
• NADHP kosubstrattir (sari)

46
Primidin nukleotidlerin birbirine dönüsümü
47
Purin Katabolismasi
(deoksi) ribozdan bazin ayrilmasi

• Purine-nucleoside phosphorylase (PNP) separates
  the free purine base from the ribose (or
  deoxyribose)

(Deoxy)Nucleoside Pi Base
(Deoxy)-a-D-Ribose 1-phosphate
48

• Urasil ve timin katabolizmasi

49
(No Transcript)
50
Timin olusumu

• deoxyuridine monophosphate (dUMP) in metilasyonu
  ile olusur
• UTP RNA sentezi için gerekli
• dUTP dUTPase (dUTP difosfohidrolaz) ile
• dUMP ye hidroliz edilir
• dUMP ? C5de metillenir ve dTMP olusur
• dTMP ? dTTP olusturmak üzere yeniden fosforile
  edilir

51
Anti-Folat Ilaçlar

• Kanser hücreleri DNA replikasyonu için hizla
• dTMP tüketir.
• Timidilat sentaz rxn.nun inhibisyonu dTMP
  üretimini engeller
• (florodeoksiuridilat irreversible inhibitor)
  ayni zamanda hizla çogalan hücrelerin çogalmasini
  da baskilar (saç folikülleri, kemik iligi, immun
  sistem, intestinal mukoza)
• Dihidrofolat reduktaz basamagi DHF analoglari
  tarafindan baskilanir
• Anti-Folates Aminopterin, methotrexate,
  trimethoprim

52
Ribonükleosit difosfat redüktaz
53
dUDP nin dUMP ye dönüsümü için iki yol
1. dUDP ADP dUMP ATP 2. dUDP ATP
dUTP dUMP PPi
H2O
ADP