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ENZIMAS

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enzimas palabra griega ; zyme en fermento enzimas propiedades cineticas numero de recambio (transferencia)) k cat = vmax [ et ] kcat = numero de ... – PowerPoint PPT presentation

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Title: ENZIMAS


1
ENZIMAS
  • PALABRA GRIEGA ZYME
  • EN FERMENTO

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ENZIMASPOLIMEROS BIOLOGICOS
  • Catalizadores aceleran la velocidad de las
    reacciones bioquímicas y no se altera de forma
    permanente por la reacción
  • Reacción bioquímica cuando las moléculas que
    chocan poseen una cantidad mínima de energía
    (energía de activación ( Ea) o energía libre de
    activación AG)
  • Energía de activación (AG) cantidad de energía
    que se requiere para convertir 1 mol de moléculas
    (sustrato o reactante) desde el estado basal (la
    forma basal de baja energía) al estado de
    transición
  • Estado de transición intermediario transitorio
    en el que no existe sustrato libre ni producto

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ENZIMASAUMENTO DE LA VELOCIDAD DE REACCION
  • Depende
  • Moléculas con energía cinética suficiente
  • Orientación correcta para reaccionar
    (aproximación entre si a la distancia de
    formación de enlace)
  • Concentración de los reactivos
  • Las enzimas

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ENZIMAS
  • Sustratos (reactante) moléculas sobre las
    cuales actúan las enzimas
  • Productos las moléculas resultantes
  • Complejo enzima-sustrato ( ES) conformación
    intermedia y transitoria que se da como resultado
    de la interacción enzima (E) con su sustrato (S )
  • ES ES E P

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ENZIMASCONSTANTE DE EQUILIBRIO (Keq)
  • Es igual al producto de las concentraciones de
    los productos de la reacción , dividido entre el
    producto de los sustratos
  • En el equilibrio las concentraciones globales de
    reactivos y productos permanecen constantes
  • La velocidad de conversión de sustratos en
    productos es igual a la velocidad a la que los
    productos se convierten en sustratos
  • Relación constantes de velocidad
  • A B P Q
  • Keq P Q
  • A B
  • A A P
  • Keq P
  • A 2
  • Keq K1
  • K2

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ENZIMASPROPIEDADES
  • Velocidades de las reacciones que catalizan
    extraordinariamente elevadas ( aumento de la
    velocidad 10 a la 6 veces mayor)
  • Muy especificas para las reacciones que catalizan
    ( extremadamente selectivos tipo de
    reacción, sustrato o conjunto pequeños de
    sustratos), poco habitual productos secundarios
  • Estructuras complejas
  • Pueden regularse

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ENZIMASCATALIZADORES
  • Lugar activo superficie de unión de forma
    enrevesada y única
  • Función del lugar activo
  • Es el sito de unión del sustrato a la enzima
    (pequeña hendidura o grieta)
  • Los aminoácidos presentes participan activamente
    en el proceso catalítico
  • La información dentro del lugar activo su forma
    y distribución de carga se utiliza para orientar
    de forma optima al sustrato
  • Reduce la energía necesaria para que se produzca
    la reacción hasta el producto

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ENZIMASCATALIZADORES
  • Proporcionan una ruta de reacción que requiere de
    menos energía de activación que la reacción sin
    catalizar
  • No altera el equilibrio si no que aumenta la
    velocidad hacia el equilibrio
  • El equilibrio se alcanza en segundos o minutos en
    lugar de horas o días

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ENZIMAS ESPECIFICIDAD
  • Característica de mayor relevancia
  • Determinante en la regulación del metabolismo
    celular
  • Reduce la variedad de sustratos sobre los que una
    enzima puede actuar
  • Tipos de especificidad
  • La especificidad óptica solo sobre isomeros de
    la serie L (catabolismo de aminoácidos), sobre
    los de la serie D ( metabolismo de carbohidratos)
  • Especificidad de grupo sobre un grupo
    determinado de moléculas

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ENZIMASESPECIFICIDAD
  • Modelo llave-cerradura ( Emil Fischer)
  • Modelo de ajuste inducido (Daniel
    Koshland)

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ENZIMASESPECIFICIDAD
  • Modelo llave-cerradura (lugar activo rígido)
  • Cada enzima se une a un único tipo de sustrato
  • El lugar activo de la enzima y el sustrato poseen
    estructuras complementarias
  • El sustrato entra e interacciona con el lugar
    activo (forma global y distribución de carga)

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ENZIMASESPECIFICIDAD
  • Modelo de ajuste inducido (estructura
    flexible de las proteínas)
  • El sustrato no se ajusta con precisión a un lugar
    activo rígido
  • Las interacciones no covalentes entre la enzima y
    el sustrato modifican la estructura
    tridimensional del lugar activo
  • Conforman la forma del lugar activo con la forma
    del sustrato en la conformación del estado de
    transición

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ENZIMAS MODELO DE AJUSTE INDUCIDO
  • La enzima y el sustrato sufren cambos
    conformacionales en el estado de transición
  • El sitio catalítico no es un lugar estático y
    rígido, dinámico y transitorio
  • Al final de la reacción la enzima recupera su
    estructura original

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ENZIMAS ACTIVIDAD ENZIMATICA
  • Depende
  • Interacción entre los aminoácidos del lugar
    activo y el sustrato
  • Componentes no proteicos (cofactores
    enzimáticos)
  • apoenzima componente proteico de una
    enzima que carece de
  • un cofactor esencial
  • holoenzima enzimas intactas con sus
    cofactores unidos
  • Iones Mg, Zn, Fe , K, Co, Cu,
    Se,(métaloenzimas)
  • Coenzimas moléculas orgánicas complejas
    presentes en el medio enzimático con enlaces
    transitorios y disociables a la enzima o a un
    sustrato
  • Grupos prostéticos incorporación de la cofactor
    fuerte y estable a la estructura proteica

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COENZIMAS Y VITAMINAS DE PROCEDENCIA
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ENZIMASACTIVIDAD ENZIMATICA
  • Control directo del organismo a través de la
    unión de activadores o inhibidores
  • Modificación covalente de la molécula enzimática
  • Regulación genética (síntesis proteica)

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CLASIFICACIONUNION INTERNACIONAL DE
BIOQUIMICA(UIB)ESQUEMA DE DENOMINACION
SISTEMATICACategorías reacción que catalizan
Oxidoreductasas Catalizan reacciones de oxidación reducción Deshidrogenasas,oxidasas,oxigenasas, reductasas, peroxidasas hidrolasas
Transferasas prefijo.Trans Catalizan reacciones en las que hay transferencia de grupos de una molécula a otra(metilo,fosforilo y acilo) Transcarboxilasas transmetilasas transaminasas
Hidrolasas Catalizan reacciones en las que se produce la rotura de enlaces por adición de agua Esterasas, fosfatasa y peptidasas
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CLASIFICACIONUNION INTERNACIONAL DE
BIOQUIMICA(UIB)CATEGORIA REACCION QUE
CATALIZAN
Liasas Catalizan reacciones en las que se eliminan grupos(H2O,C02,NH3), para formar un doble enlace o se añade a un doble enlace Descarboxilasas, hidratasas, deshidratasas desaminasas Desaminasas sintasas
Isomerasas Epimerasas Mutasas Catalizan varios tipos de reordenamiento molecular Inversión de átomos de carbono asimétricos Transferencia intramolecular de grupos funcionales
Ligasas Catalizan la formación de un enlace entre dos moléculas de sustrato Los nombres incluyen los términos Sintetasas,carboxilasas
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ENZIMASCINETICA ENZIMATICA
  • Relacionada con
  • Determinación cuantitativa de las reacciones que
    catalizan las enzimas
  • Estudio sistemático de los factores que afectan
    dichas velocidades
  • Miden la afinidad de las enzimas por los
    sustratos y los inhibidores
  • Mecanismos de reacción
  • Velocidad de una reacción bioquímica
  • El cambio de la concentración de un
    reactante o producto por unidad de tiempo

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ENZIMASCINETICA ENZIMATICA
  • Orden de la reacción
  • Relaciona la concentración del reactante, la
    saturación de la enzima con la velocidad de la
    reacción
  • Cinética de primer orden
  • Cinética de segundo orden
  • Cinética de cero orden

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ENZIMASCINETICA DE PRIMER ORDEN
  • Cuando la velocidad depende de la primera
    potencia de la concentración de un único
    reactante y sugiere que el paso limitante de la
    velocidad es una reacción uní molecular (no se
    requieren colisiones moleculares)
  • A P
  • La velocidad de la reacción es directamente
    proporcional a la concentración del sustrato,
    solo cuando la concentración del sustrato es baja
  • La concentración del reactante es función del
    tiempo ( t ½ se consume la mitad del reactante)

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ENZIMASCINETICA DE SEGUNDO ORDEN
  • la velocidad de la reacción depende de la
    concentración de los dos reactantes
  • AB P
  • Las moléculas A y B deben de chocar para que se
    forme el producto (reacción biomolecular )
  • La velocidad de la reacción depende de las
    concentraciones de los dos reactantes

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ENZIMASCINETICA PSEUDOPRIMER ORDEN
  • En ocasiones las reacciones de segundo orden
    implican reactantes como el agua, que están
    presentes en exceso
  • A H20 P
  • Como el agua se encuentra en exceso, la reacción
    parece de primer orden
  • Las reacciones de hidrólisis

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ENZIMASCINETICA DE ORDEN CERO
  • Cuando la adición de un reactante no altera la
    velocidad de la reacción
  • La velocidad es constante debido a que la
    concentración del reactante es lo suficientemente
    elevada para saturar todos los lugares
    catalíticos en la molécula de la enzima
  • Cuando la concentración del sustrato se hace lo
    suficientemente elevada de forma que la enzima se
    satura

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ENZIMAS CINETICA DE MICHAELIS-MENTEN
  • Cuando se une el sustrato S en el lugar activo
    de una enzima E se forma un complejo
    intermediario ( ES)
  • Durante el estado de transición, el sustrato se
    convierte en el producto
  • Tras un breve espacio de tiempo , el producto se
    disocia de la enzima
  • Constantes de velocidad
  • K1 constante de velocidad de
  • formación de ES
  • K2 constante de velocidad de
  • disociación ES
  • K3 constante de velocidad de
  • la formación y liberación del producto
  • del lugar activo

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ENZIMASMODELO DE MICHAELIS -MENTEN
  • K2 es despreciable en comparación con K1
  • La velocidad de formación de ES es igual a la
    velocidad de su degradación durante la mayor
    parte del curso de la reacción (suposición del
    estado estacionario)
  • La velocidad de formación de ES es igual a K1 E
    S
  • La velocidad de disociación de ES es igual a (K2
    K3)
  • La suposición del estado estacionario iguala
    estas dos velocidades

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ENZIMASCONSTANTE DE MICHAELIS Y MENTEN (Km)
  • Define algunos aspectos del comportamiento
    enzimático ( constante de afinidad)
  • Se considera una constante que es
    característica de la enzima y del sustrato en
    condiciones especificas
  • Cuando menor es la Km, mayor es la afinidad de la
    enzima por la formación del complejo ES
  • Km K2 K3
  • K1

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ENZIMASCONSTANTE Km
  • Km indicador de la afinidad de la
    enzima por el sustrato

  • concentración de sustrato a la que la enzima
    tiene la mitad de la velocidad máxima
  • Km grande se necesitara una concentración
    mayor de sustrato para alcanzar la mitad de la
    velocidad máxima
  • Km pequeña es menor la cantidad del
    sustrato para alcanzar la mitad de la velocidad
    máxima de la enzima ( enzima mas afín a su
    sustrato)

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ENZIMASVELOCIDAD MAXIMA DE REACCION
  • Vmax punto de la reacción en el que no
    importa con cuanto sustrato se realice la
    medición de la actividad enzimático , pues la
    velocidad de la reacción no aumenta mas
  • Vmax corresponde al punto de saturación de
    la enzima
  • Punto de saturación todos los sitios
    catalíticos de las enzimas están ocupados y por
    lo tanto no pueden interactuar con mas moléculas
    de sustrato

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ENZIMASECUACION DE MICHAELIS-MENTEN
  • V Vmax S
  • S Km
  • Grafica hiperbólica
  • Vmax velocidad que
  • puede alcanzar la reacción
  • Km cada enzima tiene un valor de Km
    característico en condiciones especificas

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ENZIMASECUACION DE MICHAELIS-MENTEN
  • Condición
  • Cuando s es mucho menor que Km ( condiciones
    fisiológicas)
  • El termino Km s es esencialmente igual que
    Km
  • Vi Vmax S Vmax S
  • Km S Km
  • Vi ( Vmax) S
  • Km
  • Cuando S es menor que Km la velocidad
    inicial de la reacción es directamente
    proporcional a la concentración del sustrato

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ENZIMASECUACION DE MICHAELIS-MENTEN
  • condición
  • Cuando S es mucho mayor que Km
  • El termino Km S es igual a S
  • Al sustituir Km S por S
  • Vi Vmax S Vi Vmax S
  • Km S S
  • Vi Vmax
  • la velocidad de la reacción es máxima
    ( Vmax) y es invariable con los incrementos
    adicionales con La S
  • cuando menor es el valor de Km mayor es la
    afinidad de la enzima por La formación del
    complejo ES

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ENZIMASECUACION DE MICHALIS- MENTEN
  • Condición
  • Cuando la S Vmax
  • Vi Vmax S V max S
  • Km S 2 S
  • Vi Vmax
  • 2
  • la velocidad inicial es igual a la mitad de la
    Vmax

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ENZIMASPROPIEDADES CINETICASNUMERO DE RECAMBIO
(TRANSFERENCIA))
  • K cat Vmax
  • ET
  • Kcat numero de moléculas de sustrato
    convertidas en producto por unidad de tiempo por
    una molécula enzimática en condiciones optimas (
    saturada por el sustrato)
  • ET concentración total de la enzima

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ENZIMASPROPIEDADES CINETICASNUMERO DE
RECAMBIOEFICACIA CATALITICA
  • Vmax Kcat ET
  • V Kcat ET S
  • Km S
  • Cuando la S es menor que Km ET E
  • V ( Kcat/ Km) E S
  • ( Kcat/ Km ) constante de velocidad para
    una reacción donde la S es lt que Km (
    constante de especificidad)

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ENZIMASEFICACIA CATALITICA
  • Perfección catalítica
  • cuando las enzimas convierten el sustrato
    en producto cada vez que el sustrato difunde en
    el lugar activo
  • Complejos multienzimaticos
  • organización de las enzimas en los seres
    vivos para alcanzar este grado elevado de
    eficacia
  • Actividad enzimática
  • se mide en unidades internacionales ( UI)
  • 1 UI la cantidad de la enzima que produce 1
    micromol de producto por minuto
  • Actividad especifica de una enzima numero
    de UI por mg de proteína
  • 1 Katal ( Kat ) cantidad de enzima que
    transforma 1 mol de sustrato por segundo (
    6 por 10 a la 7 UI )

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ENZIMASREPRESENTACIONES DOBLES INVERSAS DE
LINEWEAVER-BURK
  • La ecuación de Michaelis Menten puede
    ordenarse obteniendo su inversa o reciproca
  • 1 Km 1 1
  • V Vmax S Vmax
  • Inversa de las velocidades iniciales frente a
    las inversa de las concentraciones del sustrato
  • Grafica de línea recta
  • La pendiente de la línea es Km/Vmax
  • La intersección en el eje vertical es 1 / Vmax
  • La intersección en el eje horizontal es 1 / Km

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ENZIMASECUACION DE HILLCOMPORTAMIENTO
COOPERATIVO
  • Enzimas multimericas se unen al sustrato en
    varios sitios.
  • Cooperatividad positiva en la unión del sustrato
  • La forma de la curva es una recta
  • La grafica determina la concentración de sustrato
    que produce la mitad de la velocidad máxima y el
    grado de cooperatividad
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