LA RECHERCHE EN GENOMIQUE DU CEA

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LA RECHERCHE EN GENOMIQUE DU CEA

• Spécialisation Analyse fonctionnelle des
  génomes
• bactéries
• levure
• plante modèle (Arabidopsis thaliana)
• modèles murins (rat, souris)
• être humain

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APPROCHES DE LANALYSE FONCTIONNELLE

• Transcriptome
• service de génomique fonctionnelle (CEA/Evry)
  Génopole dEvry
• puces à ADN sur lames de verre pour
• levure, souris, homme, A. thaliana
• Protéome
• labo de chimie des protéines (CEA/Grenoble)
  Génopole Rhône Alpes
• service de biochimie post-génomique
  (CEA/Marcoule)
• Métabolome
• CEA/Saclay profils métaboliques (GC et HPLC/
  MS)
• CEA/Grenoble profils métaboliques (RMN P31 et
  C13)
• Imagerie fonctionnelle
• CEA/Saclay, CEA/Orsay IRM sur petit animal
  (rongeurs)

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DEVELOPPEMENT DE NOUVEAUX OUTILS DANALYSE

• Programme biopuces du CEA
• biopuces à ADN sur nouveaux supports
• biopuces à protéines
• lab on chips
• etc
• Programme multidisciplinaire
• microélectronique
• biologie, bioinformatique
• chimie de surface
• physico-chimie
• microfluidique
• Objectifs
• développer de nouveaux instruments danalyses
• développer une PI forte

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PROBLEMATIQUES BIOLOGIQUES ENTRANT DANS LES
MISSIONS DU CEA

• Radiobiologie
• effets des rayonnements ionisants
• stress oxydant
• Radiopathologie
• cancers radio-induits
• Toxicologie nucléaire
• effets de radionucléides(R.N.) ou de métaux
  lourds (M.L.) au niveaux cellulaires et
  moléculaires
• processus daccumulation cellulaires des R.N. et
  M.L.
• Application des techniques issues du nucléaire
• développement et utilisation de limagerie
  fonctionnelle

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CADARACHE ET LA GENOMIQUE AU CEA

• DEUX DOMAINES
• microbiologie
• biologie végétale
• MICROBIOLOGIE réponse aux métaux lourds
• protéome
• séquençage peptidique (CEA/Grenoble)
• transcriptome (Pseudomonas brassicacearum)
• puces à ADN de fragments du génome (Evry)
• séquençage en cours du génome de
  P.brassicacearum
• 5iem PCRD et ACI du ministère (Génoscope)

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ARABIDOPSIS thaliana effets des radiations
ionisantes effets des métaux lourds

• Dynamique du transcriptome et du traductome
• Puces à ADN 10 000 ADNc (Evry)
• Technique SAGE/SADE quantification de messagers
  dans un tissu
• utile pour caractériser des gènes
• utilisable pour lannotation du génome
  (Montpellier)
• Banque de délétions par irradiation gamma
• 10 délétions (1-10 Kb) en moyenne par lignée
• développement dune technique (brevet) pour
  repérer le gène inactivé
• technique générique applicable à dautres
  végétaux et animaux
• les mutants obtenus ne sont pas considérés comme
  des OGM
• Plateforme technologique croissance des plantes
  en conditions controlées (prestations de
  recherche)
• La reproductibilité des conditions de croissance
  est primordiale
• manipulation précises des paramètres de
  croissance