Diapositive 1

1
SEQUENCAGE DES GENOMES DE Cenibacterium
arsenoxidans (IA) ET Thiomonas spp. (KB)
2
TRAITEMENTS DES SEQUENCES

• Comparaison des séquences contre une banque dADN
  ribosomique (RIgt80 RLgt100)
• Comparaison des séquences contre une banque dIS
  (RIgt80 RLgt100)

LISTES DE SEQUENCES A ELIMINER DE LASSEMBLAGE
ASSEMBLAGE SANS CES SEQUENCES
RECHERCHE DE SEQUENCES REPETEES PAR NOSFERATU

• Constitution dune banque de séquences répétées
  de plus de 500pb
• Comparaison des séquences contre cette banque de
  répétés (RIgt80 RLgt100)

LISTE DE SEQUENCES A ELIMINER DE LASSEMBLAGE
3
ASSEMBLAGE SANS LES SEQUENCES RIBO/IS/REPEATS
CONSTRUCTION DE LA MOLECULE SANS LES SEQUENCES
RIBO/IS/REPEATS
RAPATRIEMENT DES SEQUENCES DE MANIERE CIBLEE
4
1
5
3
2
4
ASSEMBLAGES INDIVIDUELS DES SEQUENCES RECUPEREES
A
B
1
5
3
2
4
CONCATENATION DES ASSEMBLAGES
1
7
6
5
RESULTATS
6
(No Transcript)
7
BILAN DE FIN DE PROJET