Diapositive 1 - PowerPoint PPT Presentation

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Diapositive 1

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Quantification pr cise: soustraction du bruit de fond et quantification des spots ... BVA : Biological Variation Analysis. Master. Gel 3. Protein difference ratios ... – PowerPoint PPT presentation

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Transcript and Presenter's Notes

Title: Diapositive 1


1
2-D DIGE Decyder v6.5 software analysis
2
(No Transcript)
3
Co-détection des spots
Un gel, 3 images
Extrait 2
Standard
Extrait 1
Quantification précise soustraction du bruit de
fond et quantification des spots
4
Standard interne et quantification des spots
Gel 1
extrait 2 (Cy5)
extrait 1 (Cy3)
sans standard interne mesure de labondance
dans chacune des images
Gel 2
extrait 4 (Cy5)
extrait 3 (Cy3)
5
Co-détection Intra-gel Quantification Intra-gel
Cy2
Cy5
Cy3
Gel 1
Standard
extrait 1
extrait 2
Cy2
Cy3
Cy5
Internal standard and 2 samples per gel
Gel 2
Standard
extrait 3
extrait 4
Cy2
Cy3
Cy5
Gel 3
Standard
extrait 5
extrait 6
6
Standard internematching inter-gel et
normalisation de labondance des spots
Gel 1
  • Matching des spots
  • - Normalisation de labondance par rapport à
    chaque spot du standard

extrait 2 (Cy5)
extrait 1 (Cy3)
Standard (Cy2)
Gel 2
extrait 3 (Cy3)
extrait 4 (Cy5)
Standard (Cy2)
7
Cy2
Cy5
Cy3
Gel 1
Standard
extrait 1
extrait 2
Cy2
Cy3
Cy5
Internal standard and 2 samples per gel
Gel 2
Standard
extrait 3
extrait 4
Cy2
Cy3
Cy5
Gel 3
Standard
extrait 5
extrait 6
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