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MICROSCOPIA OPTIMIZADA POR ORDENADOR

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microscopia optimizada por ordenador consejos de captura de im genes desde el microscopio introducci n consideraciones previas posibles causas de una mala imagen ... – PowerPoint PPT presentation

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Title: MICROSCOPIA OPTIMIZADA POR ORDENADOR


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MICROSCOPIA OPTIMIZADA POR ORDENADOR
  • CONSEJOS DE CAPTURA DE IMÁGENES DESDE EL
    MICROSCOPIO

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MICROSCOPIA OPTIMIZADA POR ORDENADOR
  • INTRODUCCIÓN
  • CONSIDERACIONES PREVIAS
  • POSIBLES CAUSAS DE UNA MALA IMAGEN
  • AJUSTE KOHLER
  • MALOS PROCEDIMIENTOS
  • CAPTURA DE IMAGEN
  • CONSEJOS

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MICROSCOPIA OPTIMIZADA POR ORDENADOR
INTRODUCCIÓN
  • Para obtener unos buenos resultados en el
    análisis de imagen, es importantísimo partir de
    una buena adquisición de esa imagen.

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MICROSCOPIA OPTIMIZADA POR ORDENADOR
CONSIDERACIONES PREVIAS
  • HACER BIEN LOS PROTOCOLOS DE FIJACIÓN, TINCIÓN .
  • CANTIDAD DE CÉLULAS O TEJIDO SUFICIENTE PARA QUE
    NO FALLE NUESTRA OBSERVACIÓN
  • SI VAMOS A CONTAR CELULAS EVITAR AGREGADOS
  • PERO POCAS CELULAS SON POCO REPRESENTATIVAS
  • MONTAJE CON MEDIO DE MONTAJE
  • DURARÁ MÁS TIEMPO
  • ETIQUETADO SABER QUE ES LO QUE SE HA PUESTO EN
    EL PORTAOBJETOS
  • MUESTRAS DUPLICADAS SI SE PUEDE
  • SABER EXACTAMENTE LO QUE BUSCAMOS

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MICROSCOPIA OPTIMIZADA POR ORDENADOR
CONSIDERACIONES PREVIAS
  • USAR CONTROLES
  • CASOS DE EMISIONES DE FLUORESCENCIAS PRÓXIMAS EN
    EL ESPECTRO
  • COLOCALIZACIÓN
  • USAR UN BUEN CUBRE
  • PARA CONFOCAL 0,17 mm
  • VER LA CALIDAD 1,5
  • NO LLENAR EL PORTA DE MUESTRAS
  • EN EL BORDE PUEDE CHOCAR LA PLATINA CON EL
    OBJETIVO
  • NO APOYAR BIEN EL PORTA, SE PUEDE LEVANTAR,
    INCLINARSE
  • NO PODER ENFOCAR BIEN
  • VERIFICAR QUE TIENE ACEITE EL OBJETIVO, SI LO
    NECESITA

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MICROSCOPIA OPTIMIZADA POR ORDENADOR
CONSIDERACIONES PREVIAS
  • SI SE VA A OBSERVAR CÉLULA VIVA
  • PREPARACIÓN ANTICIPADA DE LA Tª Y CO2
  • PREPARAR EL SISTEMA
  • AL MENOS 1 HORA PARA LA Tª
  • VERIFICAR EL CO2
  • EN LA PLACA IDEALMENTE USAR MEDIO SIN ROJO
    FENOL,
  • QUENCHING (DISMINUYE LA SEÑAL, AUMENTA EL FONDO)
  • USAR UN POCILLO CON ROJO FENOL PARA CONTROLAR pH
  • COMPROBAR QUE EL FLUOROCROMO AGUANTA LA LARGA
    DURACIÓN DEL EXPERIMENTO
  • Si se va a excitar 200 veces en 24 horas,
    excitarlo 200 veces en 16 min.
  • Mas vale perder 16 min. que 24 horas de
    observación.
  • ASEGURARSE QUE TODO FUNCIONA BIEN, NO SE TIRAN 24
    HORAS.
  • VERIFICAR QUE LA PLACA DEJA PASAR LA
    FLUORESCENCIA Y EN SU CASO LOS LÁSERES.

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MICROSCOPIA OPTIMIZADA POR ORDENADOR
POSIBLES CAUSAS DE UNA MALA IMAGEN
  • 1. Verificar que la iluminación sea la correcta.
  • 2. Verificar que las lentes del objetivo estén
    limpias.
  • 3. Comprobar que entre el diafragma de campo y el
    de abertura, no haya ningún filtro difusor.
  • 4. El centrado del revólver portaobjetivos debe
    ser el correcto.
  • 5. El portaobjetos y el cubreobjetos deben estar
    limpios. Comprobar que el primero esté bien
    colocado, y que no haya dos cubreobjetos
    superpuestos.
  • 6. Verificar la limpieza de todo el sistema
    óptico. Esto se puede efectuar haciendo girar por
    separado los oculares que el microscopio posea,
    comprobando si las pequeñas motas de suciedad se
    mueven Si es así, es que hay que limpiar el
    ocular.
  • Luego, habrá que hacer girar el tubo ocular en su
    conjunto éste no debe ser desmontado nunca, pero
    sí se pueden limpiar cuidadosamente los prismas
    soplando sobre las superficies accesibles. El
    objetivo puede limpiarse desenroscándolo
    ligeramente y ayudándose de un pincel seco.
  • En la cámara de fotos Si al girarla, las manchas
    no se mueven, las partículas están en la cámara.
  • CUIDADO PUEDE SER PEOR EL REMEDIO QUE LA
    ENFERMEDAD!!

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MICROSCOPIA OPTIMIZADA POR ORDENADOR
POSIBLES CAUSAS DE UNA MALA IMAGEN
  • 7. Comprobar que el aceite de inmersión sea el
    suficiente, sin burbujas ni impurezas, y que no
    sea fluorescente. Que no haya miserias ni
    derroches.
  • Excesos ensucian y manchan objetivos, mesa,
    dedos, manos
  • 8. Asegurarse de que el objetivo está bien
    enroscado.
  • 9. Verificar el grosor del cubreobjetos,
    portaobjetos y medio de montaje, que es decisivo,
    sobre todo en medianos y grandes aumentos. Es
    importante, igualmente,
  • NO COLOCAR DOS CUBREOBJETOS SUPERPUESTOS.
  • 10. La montura del condensador debe estar bien
    centrada y la frontal bien sujeta, en el caso de
    que sea abatible. Comprobar que la cremallera
    esté bien apretada, para mantener la posición.
  • 11. La intensidad lumínica no debe ser débil, ni
    excesiva.
  • No hay que regularla nunca con el diafragma del
    condensador.
  • 12. Tener cuidado de no utilizar objetivos de
    contraste de fases para observaciones de campo
    claro, sobre todo cuando trabajamos con grandes
    aumentos.

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MICROSCOPIA OPTIMIZADA POR ORDENADOR
POSIBLES CAUSAS DE UNA MALA IMAGEN
  • 13. Utilizar una combinación correcta entre el
    ocular y el objetivo, pues puede ocurrir que el
    ocular sea demasiado potente.
  • 14. Comprobar que la preparación esté bien hecha,
    comparándola con una preparación test.
  • 15. En contraste de fases, es común el error en
    el centrado del anillo de iluminación.
  • Aunque éste puede descentrarse debido a la
    geometría de las estructuras.
  • 16. En observaciones con fluorescencia, las
    fluorescencias parásitas que se pueden descubrir
    pueden ser debidas a el medio de montaje, al
    aceite de inmersión, una óptica inadecuada, el
    uso de un filtro incapaz de cortar los rayos de
    excitación.
  • 17. Si el medio de montaje tiene un índice de
    refracción muy similar al del objeto incoloro,
    éste no podrá verse, ni con contraste de fases,
    ni con contraste interferencial.
  • 18. Si se observa una neblina solamente en los
    bordes del campo, se deberá a una mala corrección
    de esfericidad del campo por parte del sistema
    óptico. Con objetivos caros es raro que ocurra.

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MICROSCOPIA OPTIMIZADA POR ORDENADOR
POSIBLES CAUSAS DE UNA MALA IMAGEN
  • 19. En DIC, comprobar que efectivamente está el
    prisma de corredera bien colocado. Con placas
    Petri de plástico, no se podrá manifestar el
    rendimiento óptico normal debido a la
    característica de polarización de la Placa Petri,
    con lo que se recomienda usar una de vidrio.
  • 20. Si se va a hacer colocalización no deben de
    estar interpuestos ningún prisma en la
    trayectoria de la luz fluorescente, ya que los
    primas producen la difracción la luz.

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MICROSCOPIA OPTIMIZADA POR ORDENADOR
AJUSTE KÓHLER
  • NECESARIO PARA UN BUEN ALINEAMIENTO DE LA LUZ
  • AJUSTES PARA LUZ TRANSMITIDA-CAMPO CLARO SEGÚN
    KÓHLERPara la representación más fiel posible de
    un objeto juegan un papel muy importante, además
    de los llamados haces de luz directos, también
    los indirectos, es decir, los haces de luz
    difractados y dispersados en los detalles del
    preparado.
  • Según ABBE vale Cuanto mayor es el factor de los
    haces de rayos indirectos (apertura), tanto más
    fiel al objeto será la representación
    microscópica.Para aprovechar el rendimiento
    óptico total del microscopio, en particular del
    objetivo, el condensador, el diafragma de campo
    luminoso y el diafragma de apertura deberían
    estar ajustados según el principio de iluminación
    de KÓHLER,
  • PROCEDIMIENTO
  • El microscopio debe estar conectado, con la
    lámpara halógena encendida.
  • Regular la claridad de la imagen mediante el
    regulador de luz.
  • Poner un preparado con contrastes fuertes en la
    platina de desplazamientos en cruz.
  • Intercalar en caso dado la óptica frontal del
    condensador, se recomienda el objetivo de menor
    aumento y llevar el condensador mediante el mando
    para movimiento vertical hasta el tope superior.
    El tope tiene que estar ajustado de tal manera
    que el preparado no sea levantado por el
    condensador.
  • Intercalar el objetivo 10x  mediante el revólver
    portaobjetivos y enfocar el preparado mediante el
    mando de enfoque.

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MICROSCOPIA OPTIMIZADA POR ORDENADOR
AJUSTE KOHLER
  • Cerrar el diafragma de campo luminoso,  hasta que
    se pueda ver (aunque poco nítido) en el campo
    visual ,
  • Bajar el condensador mediante el mando para
    movimiento vertical hasta que el borde del
    diafragma de campo luminoso aparezca con
    suficiente nitidez.
  • Centrar la imagen del diafragma de campo luminoso
    mediante los dos tornillos de centrado situados
    en el portacondensador
  • Abrir después el diafragma de campo luminoso
    hasta que su borde justamente desaparezca del
    campo visual .
  • Para ajustar el diafragma de apertura (contraste)
    sacar un ocular del portaoculares y mirar a
    simple vista por el tubo- Ajustar el diafragma de
    apertura a unos .2/3 .,.4/5 del diámetro de las
    pupilas de salida de los objetivos. En la mayoría
    de las aplicaciones, este ajuste del diafragma.
    de apertura proporciona el mejor contraste con
    una resolución casi completa, y por lo tanto
    representa el compromiso más favorable para la
    vista humana.
  • Volver a insertar el ocular en el portaoculares
  • http//www.ipb.csic.es/servicios/Microscopia/ajust
    es-en-microscopios.html

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MICROSCOPIA OPTIMIZADA POR ORDENADOR
MALOS PROCEDIMIETOS BREVEMENTE
EVITARLOS, NO HACERLOS Y SOBRE TODO NO
REPETIRLOS Y AVERIGUAR PORQUE SALIÓ MAL
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MICROSCOPIA OPTIMIZADA POR ORDENADOR
BUENOS PROCEDIMIETOS
  • UTILIZAR CONTROLES
  • PROCEDIMIENTO
  • USAR EL QUE TIENE SEÑAL Y AJUSTAR
  • PONER EL CONTROL
  • SI DA SEÑAL BAJARLO HASTA QUE DESAPAREZCA
  • SI NO DA SEÑAL DEJARLO YA ESTÁ HECHO
  • SI DIO SEÑAL EL CONTROL
  • DESPUÉS DE AJUSTAR HASTA QUE DESAPAREZCA
  • VOLVER A PONER LA MUESTRA PROBLEMA Y AJUSTAR
  • SI NO SE HACE PENSAR SI LO QUE HACEMOS,
  • LO ESTAMOS HACIENDO BIEN
  • ES UN BUEN PROCEDIMIENTO?
  • VALORACIÓN O TITULACIÓN DE LAS CONCENTRACIONES DE
    LOS FLUOROCROMOS
  • FACILITA UN AJUSTE ADECUADO DE NUESTRO CONTROL

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MICROSCOPIA OPTIMIZADA POR ORDENADOR
CAPTURA DE IMAGEN
  • USAR EL BOTONCITO DEL SOFTWARE QUE NOS REFERENCIA
    EL NO SATURAR LAS IMÁGENES.
  • CAPTURA DE IMAGEN UTILIZANDO
  • EL MÁXIMO RANGO DE NIVELES DE GRISES
  • SI SE SATURAN LAS IMÁGENES Y QUEREMOS CUANTIFICAR
    INTENSIDAD, NO PODRÁN VALORARSE
  • COMPROBAR EN EL RECORRIDO DE Z QUE NO EXISTE
    SATURACIÓN
  • SI NO SE COMPRUEBA ES COMO VOY A TENER SUERTE DE
    GOOGLE
  • FOTOGRAFÍA OSCURA SE PODRÁ REALZAR
  • FOTOGRAFÍA SATURADA

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MICROSCOPIA OPTIMIZADA POR ORDENADOR
CAPTURA DE IMAGEN
  • DEFINICIONES
  • BINNING
  • El proceso de combinar la carga de varios pixeles
    adyacentes para crear superpixeles antes de la
    lectura.
  • El Binning incrementa la velocidad de refresco y
    la proporción de señal-ruido de la cámara a
    cambio de una reducción en la resolución
    espacial. Es fundamental para enfocar en vivo
    en condiciones de baja luminosidad

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MICROSCOPIA OPTIMIZADA POR ORDENADOR
CAPTURA DE IMAGEN
  • BLOOMING/SATURACIÓN
  • La saturación se relaciona con la intensidad
    máxima de luz con la que un píxel puede
    enfrentarse. Si un píxel es pensado como un
    pocillo de fotoelectrones, la saturación ocurre
    cuando el pocillo está lleno. El Blooming ocurre
    cuando el pocillo comienza a desbordar y cobrar
    (cargar) extensiones en pixeles vecinos,
    causándolos saturación. El desbordamiento se
    resalta como una raya blanca o la gota alrededor
    de un punto brillante sobre la imagen.

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MICROSCOPIA OPTIMIZADA POR ORDENADOR
CONSEJOS
  • NECESARIO UN BUEN ALINEAMIENTO DE LA LUZ
  • SI TENEMOS LUZ PARÁSITA
  • FOTOGRAFÍA EN BLANCO, SIN MUESTRA, PARA ELIMINAR
    LOS RUIDOS.
  • UTILIZAR EL SOFTWARE PARA REFERENCIAR LA NO
    SATURACIÓN DE LAS IMÁGENES
  • A LA HORA DE HACER Z-STACKS SABER DETERMINAR LA
    DISTANCIA IDEAL PARA EVITAR DESENGAÑOS
  • PÍXELES ALARGADOS, VESÍCULAS CORTADAS
  • NO SE OBTIENEN CUANTIFICACIONES ADECUADAS

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MICROSCOPIA OPTIMIZADA POR ORDENADOR
CONSEJOS
  • SI EL FLUOROCROMO SE QUEMA CON FACILIDAD
  • PLANTEARSE SI HACER LA IMAGEN CON MENOR
    RESOLUCIÓN
  • HACER PRIMERO TODO EL STACKS DEL FLUOROCROMO QUE
    ANTES SE QUEMA
  • NO PERDER EL TIEMPO BUSCANDO CÉLULAS CON LA
    FLUORESCENCIA SIN OBTENER IMÁGENES
  • BAJAR LA POTENCIA DEL LASER SI ES NECESARIO Y
    TENER UN POCO DE RUIDO AUNQUE HAYA QUE TRATARLO
    LUEGO DESPUÉS
  • PLANTEARSE SI EXISTE OTRO PARECIDO O SUSTITUIBLE
  • USAR PROTECTORES DE FLUORESCENCIA

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MICROSCOPIA OPTIMIZADA POR ORDENADOR
SI TENÉIS ALGUNA DUDA PREGUNTARME MUCHAS GRACIAS
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