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34398 Montpellier Cedex 5, France. G n tique et Evolution des Maladies Infectieuses (GEMI) ... http://gemi.mpl.ird.fr/SiteSGASS/SiteTDM/EnseignMeeus.html ... – PowerPoint PPT presentation

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1
Thierry de Meeûs Laboratoire de recherches et
de coordination sur les Trypanosomoses, UMR177
IRD/CIRAD, TA A-17/G, Campus International de
Baillarguet, 34398 Montpellier Cedex 5,
France. Génétique et Evolution des Maladies
Infectieuses (GEMI) UMR CNRS/IRD 2724, UR IRD
165 E-mail demeeus_at_mpl.ird.fr http//gemi.mp
l.ird.fr/SiteSGASS/SiteTDM/EnseignMeeus.html
2
(No Transcript)
3
Méthodes directes
Méthodes indirectes
4
TYPES DE MARQUEURS
Microsatellites
Primer1
Primer2
mRNA
Primer1
AUGCAGCCAUAGGCG
Primer2
PCR
Enzymes
Phe-Pro-Leu-Ileu-Val

-
Electrophorèse
Neutralité une hypothèse assez forte
5
Proportions de Hardy-Weinberg
6
Altérations des proportions de Hardy
Weinberg Déficits en hétérozygotes
Endogamies
Sous dominance
Effet Wahlund
Homogamie
Causes techniques
Allèles nuls Dominance des allèles courts
7
Altérations des proportions de Hardy
Weinberg Excès d'hétérozygotes
Superdominance
Hétérogamie
HLA
Clonalité
Candida albicans
Trypanosoma brucei
Biais de dispersion sexe spécifique
Hétérosis
8
Les F-Statistics de Wright
HObs2p1(1-p1)-2p1(1-p1)FIS
9
Structure d'une Population Taille des Unités de
Reproduction Migration
10
Génétique des populations d' Ixodes ricinus et
borréliose de Lyme en Suisse
11
Déficits en hétérozygotes
12
Distribution sexe spécifique du polymorphisme
Biais de dispersion sexe spécifique des tiques
13
Détection des Borrelia dans les tiques
Pour Borrelia burgdorferi
P
0.012
ss
0.08
0.07
B. burgdorferi
0.06
0.05
0.04
Prévalence of
0.03
0.02
F
M
Sex of the tick
14
Détection des borrélies dans les tiques
Pour Borrelia afzelii
Saines
Infectées
Saines
Infectées
15
Schistosoma mansoni et ses hôtes (rat et
mollusque) en Guadeloupe
16
Les F-Statistics de Wright et Clones
17
Génétique des populations des diploïdes clonaux
ou partiellement clonaux
18
Clones structurés en nombreux dèmes
Fst-Fis/(1-Fis) Fit0
19
Candida albicans à Abidjan (Côte dIvoire)
J0
42 Patients AIDS
FPatient0.5 (Plt0.001)
23 patients
19 patientes
J15
FSex0.08 (Plt0.02)
Rechute de 13 patients
Traitement anti-fungique
Fis-0.66
Fis-0.97
FD0-D150.2 (Plt0.001)
14 loci enzymatiques
20
Structuration de Candida albicans chez des
patients HIV de Côte d'Ivoire
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