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Les Génopoles en France
Les Génopoles ont été créées pour favoriser
l'étude de la biologie à grande échelle dans
la recherche publique et privée, le domaine
industriel et des biotechnologies. La Génopole
d'Evry a été créée en 1998. Le réseau national,
comprenant actuellement sept Génopoles, a été
créé à partir de 1999
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La Génopole
De Banyuls-sur-mer à Bagnols-sur-Cèze, une
association de 40 Laboratoires dépendant des
établissements de recherche (CNRS, CIRAD, IRD,
INRA, INSERM, CEA) et des Universités. Une
Génopole dédiée à la biodiversité un
rassemblement unique de compétences dans le
domaine végétal et animal-Homme.
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Nîmes qui a organisé avec succès le 5ème
Carrefour Français des Biotechnologies en
novembre 2001.
4
Trois grands objectifs
Recherche fondamentale (séquençage et génomique
fonctionnelle) Intégrer la génomique dans la
formation des étudiants Stimuler l'implantation
d'entreprises innovantes
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Une organisation adaptée
Responsables scientifiques Joël Bockaert, pour
le domaine biomédical et Michel Delseny pour le
domaine végétal Relations direction du programme
Génopole Ministère-Collectivités
locales-industries (fédération des ressources)
Jean-Pierre Charlemagne 2 institutions
gestionnaires le CIRAD et le CNRS 1 conseil de
gestion 1 conseil scientifique Des sous-groupes
thématiques chargés de gérer les plateformes et
les programmes
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Génomique (linéaire) Génétique
Génomique fonctionnelle
(Physiologie - Pathologie - Développement)
Transcriptome
Na
Protéome
(ARNm)
Noyau
Homme 30 000 gènes Drosohile 16 000 gènes
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Des moyens nouveaux pour une nouvelle dynamique
Création de plate-formes technologiques
permettant une mise en commun des moyens
- Plateforme séquencage-génotypage - Plateforme
Transcriptome - Plateforme Protéome -
Bioinformatique - Plateforme d'exploration
fonctionnelle de la souris - Plateforme
transgénèse végétale - Plateforme biologie
structurale
Un financement spécifique de l'état de 45 MF
depuis 1999
Des interactions avec Agropolis international,
Genoplante et le programme GenHomme
Des enseignements nouveaux notamment en
bioinformatique
Un programme de séminaires et d'écoles thématiques
Un effort de diffusion de l'information
scientifique en direction du public (Ecole de
l'ADN)
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Carte des protéines du liquide céphalorachidien
de souris
pI
3
9
Mw (kDa)
200
A2MG Chain 1 34.76.1
CERU 121.25.5
116
CO3A 112.85.87
97
Albumin
ND
Transferin 78.5
66
Hemopexin (fragment)
Carboxylesterse 59.15.06
CO3B 70.77.35
Hemopexin (fragment)
Kininogen 47.95.7
Contrapsin 46.95.05
55
Tubulin A 50.14.9
VTDB 51.85.2
PKM2 57.757.4
Alpha 1 antitripsin 45.95.5
ND
ENOA 47.06.4
ACTB 41.65.29
PGK 44.07.5
CKR M 43.06.6
ENOB 46.96.8
CKR B 42.75.4
Haptoglobin 38.75.9
ND
AL3 39.46.7
ALFA 39.28.4
36.5
LDHA 36.37.7
A2MG Chain 2 28.37
GAPDH 35.78.4
31
MDH 36.46.2
Serum amyloid P 23.96.4
14-3-3E 29.24.6
CA III 29.46.9
ND
CA II 29.06.5 PGME 29.96.5
GST1 25.88.1
ND
14-3-3D 27.84.7
AOP2 24.75.7
PGAM-M 28.78.65
Apo aI 27.95.4
Apo aI 27.95.4
TPIS 26.86.9
21.5
HBB 15.87.1
PEBP 20.8 5.2
Adenylate kinase 21.55.7
TDX 1 21.8 5.2
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Recherche
- 2 -
Base de données
IMGT (the immunogenetics database) TROPGENE
(plantes tropicales) ESTHER (alpha/beta
hydrolases) TUMEURS (cancer du sein)
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Sociétés de Biotech en Région

• NÎMES
  MONTPELLIER
• Synt em Kaczorek Innodia B. Pau
• Proteus D. Dupret
  SkuldTech J. Marti
• Phylogene G. Skorski NMRtec
  M.-A. Delsuc
• Genaxis P. Rataboul Maxmat A.Chojnacki
• Greenthal International S. Astié Bio pep
  N.Benattar
• Cezanne E. Bois Upgene M. Bensaada
• Adme Bioanalyse P. Hermann CellGene J.
  Esteller
• SelectBiotics The Duc Hua Novirio J-M Allaire
• Cligenetics J-L Falco Albhades C.Dalet
• Egytop S Alaoui Mycos O. Besnard
• Ivagen J_P Aziza Crid-pharma J-P Conduzorgues
• Biostatem A.Sanchez
• Cis-Bio D.Carette
• Mabgene P. Henno

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La création dentreprise essaimage des
laboratoires
Les 30 nouveaux projets se répartissent (source
CNRS)
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Axe Bioinformatique
Trois volets Recherche Formation
Service Actions sur le long terme
Collaborations Thèses co-encadrées (2-3/an)
Aide aux jeunes équipes Séminaires de
formation-recherche DESS de bioinformatique
depuis 2001