Schema

1
Schemaändring!!!

• Föreläsningen 30/1 (tisdag)
• flyttad till
• Måndag 29/1 kl 10-12 i FR4 (den stora salen)
  
  

2
CELLKÄRNAN
Kap 8 i 3rd edtion, kap 9 fig 16.24, s.
673-675, fig 16.27 i 4th edition Chromatin S.
150-151, 257-258 3rd edition, s166-170, 281-283
4th edition.
3
INNEHÅLL

• cellkärnan
• membran, nuclear lamina och porer
• transport till och från kärnan
• intern organisation
• nucleolus och ribosomproduktion
• cellkärnans struktur vid celldelning

4
CELLKÄRNAN

• skiljer eukaryot från prokaryot
• eu gott, väl karyon kärna
• kärnan härbärgerar arvsanlagen
• möjlighet till bättre reglering av
• genexpression bl.a.
• alternativ splicing,
• transkriptionskontroll

5
Cellkärnan

• kärnmembran - dubbelt membranlager
• kontinuerligt med ER
• nuclear lamina
• under inre kärmembranlagret
• stödjande för kärnan och fästpunkt för kromatin
• kärnporer
• för selektiv transport av större molekyler
• nucleolus

6
Cellkärnan
7
Kärnmembranet

• en barriär
• bara små icke-laddade molekyler kan diffundera
  genom ett fosfolipid-dubbellager
• yttre membran har ribosomer
• inre membran har kärnspecifika proteiner

8
Nuclear lamina

• nätverk under kärnmembranet stödjer kärnan
• glest nätverk in i kärnan
• bildar fästpunkter för kromatin
• laminer intermediärfilament typ V

9
Kärnpor-komplex

• 120 nm i diameter (stor!)
• består av 50-100 olika proteiner i ryggradsdjur
• de enda ställen små polära molekyler, joner och
  makromolekyler kan passera in till /ut ur kärnan
  (lt9 nm)
• kontrollerar passage av molekyler

10
Molekylär trafik genom kärnporer
11
Kärnporkomplex
12
Selektiv transport av proteiner

• proteiner som behövs i kärnan importeras
  selektivt
• nuclear localization signals

13
Selektiv transport av proteiner

• Ran litet GTP-bindande protein
• karyopheriner importiner och exportiner
• importiner känner igen nuclear localization
  signals
• exportiner känner igen nuclear export signals
• importen sker i 5 steg

14
Proteinimport till kärnan
Nya rön, RanGDP släpper importin i cytoplasman
och åker in via separat väg

• Importin binder protein
• Importin/protein går in i nukleus
• Importin/protein binder Ran-GTP i nucleus
• protein släpper
• Importin/RanGTP exporteras
• GTP defosforyleras av GAP
• Importin släpper från RanGDP och är tillgängligt
  på nytt för nästa protein
• RanGDP importeras separat (via NTF2, eget
  importprotein)
• GDP byts mot GTP i RAN via GEF

fel
(gamla boken)
15
Ran GTP/GDP cykel driver import
16
aktuell modell
17
Reglering av proteinimport

• när proteiner ska importeras till kärnan regleras
• inhibitoriska proteiner binder till och maskerar
  nuclear localization signal
• fosforylering nära nuclear localization signal
  hindrar import

18
Transport av RNA

• transkription av DNA till RNA sker i kärnan
• RNA exporteras ut ur kärnan för att translation
  till protein ska kunna ske
• RNP-komplex (ribonukleotid-protein-komplex)
• mRNA i komplex med ca 20 olika proteiner
• rRNA binder ribosomala proteiner i kärnan,
  exporteras som pre-ribosomala partiklar
• tRNA exportproteiner ej kända
• snRNA åker ut ur kärnan, hämtar proteiner

19
Transport av snRNA
U1, U2, U4 part of the splicing machinery
20
INTERN ORGANISATION AV KÄRNAN

• kärnan har intern organisation
• genetiska materialet organiserat
• specifika funktioner hos kärnan lokaliserade till
  specifika områden
• kromatin basen för kärnans inre organisation

21
Kromatin
22
I kromatin ligger DNA lindat runt nukleosomer
(histon-komplex)
23
Kromatin
INTERFAS-cell eukromatin tillgängligt för
transkription i varierande grad heterokromatin
mycket kondenserat inaktivt
konstitutivt heterokromatin fakultativt
heterokromatin
S. 150-151, 257-258 3rd edition,s166-170, 281-283
4th edition.
24
Eukromatin
Eukromatin
heterokromatin
heterokromatin

• Eukromatin
• 30nm fibrer, loopar och hyperacetylerade regioner
  
• Kan dekondenseras och transkriberas
• Heterokromatin
• Tätpackat, associerat med ytterligare
  packnings-proteiner
• resistent mot transkription och dekondensering
  (sker dock vid replikation)
• Heterokromatin-position ärvs oftast vid
  celldelning

25
Utryckta regioner är mer dekondenserade,tysta
regioner av eukromatin är hårt packade
(heterokromatin mkt hårt packade)

• Påverkas av
• Kromatin-remodellerande komplex
• Histon-modifierande komplex
• Acetylering (reversibel)
• Metylering (irreversibel)
• Fosforylering (reversibel)
• Ubiquitinering (reversibel)
• DNA bindande proteiner

26
Kromatinet måste dekondenseras för att
transkription ska ske
EU kromatin kan kondenseras och dekondeseras
heterokromatin är mer resistent
27

• Deacetylering och acetylering av histoner (på
  lysiner) påverkar hur tätt kromatinet är packat
• Hypo-acetylerat histoner gt TFs har svårt att
  komma åt DNA
• Hyper-acetylerade histoner gt DNA mer
  tillgängligt för transkription
• Transkriptionsfaktorer associerar med co-faktorer
  som styr acetylering
• Histone AcetylTransferase (HAT) eller Histone
  DeAcetylase (HDAC)

Acetylerade histoner binder inte DNA lika hårt
runt nukleosomerna (mindre positivt laddade)
Deacetylering ger tätt packat kromatin
28
Funktionella områden i kärnan

• DNA-replikation
• splicing i speciella områden speckles
• Cajal bodies RNP-rika
• PML bodies
• nucleolus

29
Nucleolus
30
Nucleolus

• RIBOSOMFABRIK
• rRNA-transkription
• ihopsättning av ribosomer

31
Organisation av nucleolus

• nucleolus associerad med generna för 5.8S, 18S
  och 28S rRNA
• tre morfologiskt olika områden
• fibrillar center
• dense fibrillar component
• granular component
• transkription, processning och ribosom-assembly

32
Ribosomala RNA-gener

• repeterade RNA-gener
• icke-transkriberade spacers

Transkription av rRNA-gener
33
Processning av pre-rRNA
1
2
34
Ribosome-assembly
35
KÄRNANS STRUKTUR VID CELLDELNING

• öppen eller stängd mitos
• kärnmembran
• kromosomkondensation
• reformering av kärnor

36
Stängd och öppen mitos
37
Kärnhöljet vid celldelning

• kärnporkomplexen dissocierar
• nuclear lamina fosforyleras
• dissocierar till fria dimerer av lamin
• kärnmembranet fragmenteras, bildar vesiklar

38
Nuclear Lamina
39
Kärnmembran
40
Kromosomkondensation

• H3 fosforyleras vid mitos
• kondensin ett komplex av 5 proteiner
• 2 strukturella subenheter
• 3 regulatoriska subenheter fosforyleras av
  kinaser, bl.a. Cdc2

41
Återskapande av interfaskärna

• inaktivering av Cdc2 (nedbrytning av cyclin B)
• reformering av kärnhöljet
• kromosomdekondensering
• selektiv import av kärnproteiner mm genom
  kärnporer

42
Återskapande av kärnan
43
(No Transcript)
44
(No Transcript)
45
Kärnan under mitos
46
SAMMANFATTNING

• cellkärnan
• hölje och transport till och från kärnan
• intern organisation och ribosomproduktion
• Chromatin
• Kärnan vid celldelning