Ing

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Eduardo E. DAVILA S.

• Ingénieur en développement de logiciels de
• recherche en imagerie médicale et biologique.

Laboratoire CREATIS-LRMN Ville Lyon
France
28 Janvier 2009
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http//creatis.insa-lyon.fr Eduardo E. Davila
S. davila_at_creatis.insa-lyon.fr
http//imagine.uniandes.edu.co Marcela Hernandez
H. marc-her_at_uniandes.edu.co
CREATIS-LRMN
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CREATISLRMN Centre de recherche en imagerie
médicale180 personnes
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CREATISLRMN Missions de lEquipe Informatique
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• Définition dun cadre commun de développement
  logiciel en adéquation avec les besoins
• prototypage, démonstration, évaluation, usage
  clinique
• Aide aux développements logiciels
• Support et formation aux outils de
  développement
• Simplification de la gestion de logiciels
• Pérennisation
• Mutualisation
• Factorisation

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CREATIS-LRMN
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8 équipes de recherche 180 personnes

• Acquisition dimages
• Imagerie Ultrasonore
• Imagerie et Méthodologie Exploratoires en RMN
• Imagerie RMN et Optique
• Imagerie Spectroscopique en RMN
• Traitement dimages
• Imagerie Dynamique
• Imagerie Volumique
• Interprétation clinique
• Imagerie Morphologique et Fonctionnelle
• (Ischémie Myocardique, Lumière et Paroi
  Vasculaire , Ischémie
• Cérébrale, Réponse Pulmonaire à lAgression)
• Microarchitecture et Tissus Osseux

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Savoir faire
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• Librairies de développement
• Librairie IDO1992 Collection de fonctions de
  traitement
• DaVaW2001 Collection de widgets sophistiqués
• BBTK 2006
• Applications de traitement dimages
• CreaTools Python 2003 (DaVaW)
• Maracas 2004
• CreaTools suite 2008 (BBTK)

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Maracas
MAgnetic Resonance Angiography Computer
Assisted analysiS
http//www.creatis.insa-lyon.fr/maracas/
C, gdcm, Vtk, Itk, wxWidgets, OSGI, CMake, CVS,
Doxygen, windows, linux
Logiciel daide à lanalyse dimages médicales
3D Logiciel interactif 3D pour la visualisation,
lanalyse et la quantification de sténoses
vasculaires

• IHM conviviale et utilisable par des médecins
• Manipulation et traitement dimages 3D
• Visualisation de scènes 3D complexes multi objets

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BBTK
Black Box Tool Kit
http//www.creatis.insa-lyon.fr/creatools/
C, Vtk, Itk, wxWidgets, OSGI, XML, HTML, Latex,
CMake, CVS, Doxygen, windows, linux
Environnement simple et flexible pour le
design/prototypage de nouvelles chaînes de
traitements dimages et de maillages

• Capitalisation, pérennisation et
  auto-documentation dalgorithmes
• Prototypage rapide description de workflows
  par langage de script
• Mécanisme de plug-in
• Images multi-modalités et multi-dimensionnelles
• Composants dinterface graphique et widgets
  évolués

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médicale180 personnes
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Chaîne de traitement vs besoin de développement
logiciel
Développement dapplications
Dev. logiciel
Chaîne detraitement
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Chaîne de traitement vs besoin de développement
logiciel

• Pérennisation
• Mutualisation
• Factorisation

Efficacité de développement
Dev. logiciel
Chaîne detraitement
BBTK
Développement dapplications Développement de
librairies
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Problématique
Problèmes - Connexion entre les modules
difficile - Maîtrise de linformatique nécessaire

• Avantages
• Capitalisation du travail du laboratoire
• Génération des interfaces rapide simple
• Documentation automatique

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CREA
BBTK
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SQLite
vtk
gdcm
wx
bbcreaImageIO
bbcreaMaracasVisu
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bbNewPackage
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personalLIB
Bbs box, appli, examples Data bbNewPackage
box1
Box2
Box3
EXE
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newProject -doc -appli (endUser) -libsrc -bbNewPac
kage -doc -bbs -data -src -box1 -box2
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CREA
1. New Project
newProject -doc -appli (endUser) -libsrc -bbNe
wPackage -doc -bbs -data -src -box1 -box2
newProject
3. New Box
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1. New Project
BBTK
newProject -doc -appli (endUser) -libsrc -bbNe
wPackage -doc -bbs -data -src -box1 -box2
2. New Package
bbNewPackage
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BBTK
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1. New Project
BBTK
newProject -doc -appli (endUser) -libsrc -bbNe
wPackage -doc -bbs -data -src -box1 -box2
2. New Package
3. New Box
box1
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1. New Project
newProject -doc -appli (endUser) -libsrc -bbNe
wPackage -doc -bbs -data -src -box1 -box2
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newProject -doc -appli (endUser) -libsrc -bbNe
wPackage -doc -bbs -data -src -box1 -box2
2. New Package
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1. New Project
newProject -doc -appli (endUser) -libsrc -bbNe
wPackage -doc -bbs -data -src -box1 -box2
3. New Box
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-newProjectBIN -sln/Makefile -debug/release -do
c -appli -src -bbNewPackage -doc -src -box1 -box2
-newProject -doc -appli -src -bbNewPackage -doc
-src -box1 -box2
lib.dll bblib appli.exe
Code source
Project to be compiled
CMake
Compiler visual C / gcc
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Collaboration avec LECAM pour la visualisation
en stéréo
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Images
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• img 2.3.A Modèle 3D dune hanche pathologique.
  Le modèle a été repris pour un logiciel de CAO
  afin de produire une prothèse adaptée
• img 2.4.A Segmentation dune dissection
  aortique
• img2.6.C  Bifurcation de canaux de corail
• img 2.7.A Image dun cheveu acquise avec un
  scanner de haute résolution

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img 2.3.A Modèle 3D dune hanche pathologique.
Le modèle a été repris pour un logiciel de CAO
afin de produire une prothèse adaptée
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img2.6.C  Bifurcation de canaux de corail
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img 2.4.A Segmentation dune dissection aortique
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img 2.7.A Image dun cheveu acquise avec un
scanner de haute résolution
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Maracas IRM Quantification
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BBTK
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• Merci
• pour votre attention

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