Fibrosi cistica

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Fibrosi cistica

• Calcolo del rischio in situazioni insolite

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Domande Intestino iperecogeno rischio di FC
nelle seguenti situazioni - 2 genitori
negativi al pannello standard - 1 genitore
negativo al pannello standard - 2 genitori
negativi per DGGE - 1 genitore negativo per
DGGE - feto Hz al pannello standard - feto Hz
per DGGE
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Domande IRT (immuno reactive tripsinogen) risc
hio di FC nelle seguenti situazioni - negativo
a pannello standard - Hz a pannello standard -
Hz per DGGE
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• Premesse
• E necessario avere i parametri di base
• Frequenza gene FC (1/50)
• Detection rate per pannello standard
• La DR dello stesso pannello può essere differente
  per origini differenti
• Detection rate per DGGE

Resta poi insoluto il quesito se mutazioni non
identificate con PS o DGGE siano capaci di essere
responsabili di alcuni quadri clinici
(
)
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Premessa Bisogna conoscere il calcolo delle
probabilità .
Probabilità di estrarre da un mazzo di carte 1
Asso? 4/40 1/10
Probabilità di estrarre da un mazzo di carte 1
carta di denari? 10/40 1/4
Probabilità di estrarre da un mazzo di carte 1 di
denari? 1/40 ¼ 1/10
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Teorema di Bayes P(Hi E) P(Hi ) P(EHi) / ?
P(Hi ) P(EHi)
Probabilità a priori P(Hi) Probabilità
condizionale P(EHi) Probabilità congiunta
P(Hi ) P(EHi) Probabilità a
posteriori P(Hi ) P(EHi) / ? P(Hi )
P(EHi)
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Bisogna conoscere tutte le alternative e le
Probabilità a priori P(Hi) per ogni
alternativa. La somma di P(Hi) deve essere
eguale a 1.
Si utilizza una (o più) informazione
supplementare non inclusa nella probabilità a
priori (probabilità condizionale P(EHi)). Per
ciascuna la somma per le varie alternative non
deve essere eguale ad 1.
In ogni colonna si ottine il prodotto delle
probabilità e si ottiene la probabilità
congiunta. Si divide quindi ogni probabilità
congiunta per la somma si tutte le probabilità
congiunte (probabilità finale). La somma delle
probabilità finali deve essere eguale a 1.
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Es. in una famiglia in cui vi sono due fratelli
sani ed uno affetto da FC. Qual è la probabilità
per ogni fratello di essere HZ?
Aa Aa AA Aa Aa aa
Essendo sani, possono solo avere genotipo AA, Aa,
Aa, cioè 2/3.
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In realtà il calcolo che noi facciamo
è Alternativa Oz AA Hz Aa Oz aa P. A
priori ¼ ½ ¼ (¼½¼)1 P. Condizionale (no
FC) 1 1 0 P. Congiunta ¼ ½ 0 P. Finale
¼/( ¼ ½ ) ½/( ¼ ½ ) ¼ / ¾ ½ / ¾
1/3 2/3
(1/32/3)1
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Probabilià di FC in caso di intestino iperecogeno
ed Hz per mutazione FC (DR 0.85) Alternativa
FC non FC P. A priori 3/100 97/100 P.
Condizionale (1 mutazione) 25.5/100 3.4/100 (.
85.15)2 1/25.85 P. Congiunta
76.5/10000 329.8/10000 P. Finale
76.5 (76.5 329.8) 329.8 /(76.5
329.8) 0.19 0.81
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1000 feti con EB
3 con FC
97 senza FC
30 feti affetti da FC 970 sani
85 detection rate
(4 Hz38.8) 85 DR
2.25 con 0 Mut.identif.
72.2 con 2 Mut. Identif.
25.5 con 1 Mut.identif.
38.8 0.85 33
0.65
21.7
7.65
33
Feti con FC ed 1 m 7.65/(7.6533) 18.8
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Probabilià di FC in caso di intestino iperecogeno
ed Hz per mutazione FC (DR 0.95) Alternativa
FC non FC P. A priori 3/100 97/100 P.
Condizionale (1 mutazione) 9.5/100 3.8/100 (.
95.05)2 1/25.95 P. Congiunta
28.5/10000 368.6/10000 P. Finale
0.07 0.93
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Probabilià di FC in caso di intestino iperecogeno
ed nessuna mutazione FC (DR 0.85) Alternativa
FC non FC P. A priori 3/100
97/100 P. Condizionale (1 mutazione) 2.25/100
1 (.15.15) P. Congiunta
6.75/10000 97/100 P. Finale
6.75/9706.75 9700/9706.75
0.0006 0.9994
1/1478 1477/1478
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Probabilià di FC in caso di intestino iperecogeno
ed nessuna mutazione FC (DR 0.95) Alternativa
FC non FC P. A priori 3/100
97/100 P. Condizionale (1 mutazione) 25/10000
1 (.05.05) P. Congiunta
0.75/10000 97/100 P. Finale
0.75/9700.75 9700/9700.75
0.00007 0.99993
1/12974 12973/12974
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Probabilità di FC in base al genotipo parentale
(DR.85)
AA .96 Aa 0.035 Aa 0.005
AA 0.96 AA ½ AA ½ Aa 0.0168 ½ AA ½ Aa
Aa 0.035 ½ AA ½ Aa 0.0168 ¼ AA, ½ Aa, ¼ aa ¼ AA, ¼ Aa, ¼ Aa 0.00004 ¼ aa 0.00004
Aa 0.005 ½ AA ½ Aa ¼ AA, ¼ Aa, ¼ Aa, ¼ aa ¼ AA, ¼ Aa, ¼ Aa, ¼ aa
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Probabilità di FC Probabilità di FC se è
identificato Int.Eperecogeno (3/100) e una
mutazione (0.0023) sulla probabilità di essere
Hz (1/25) sulla probabilità di non avere FC
0.03 0.0023 / 0.0004
- 0.03 0.0023/0.0004
0.970.9977/0.9996 0.1725
- 0.1725 0.9674 15