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TRAVAIL DE GENETIQUE

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TRAVAIL DE GENETIQUE Carte des QTL des Traits Fonctionnels dans la population bovine Holstein allemande Renson Julie Robat C cilia Rondeaux Charlotte – PowerPoint PPT presentation

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Title: TRAVAIL DE GENETIQUE


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TRAVAIL DE GENETIQUE
  • Carte des QTL des Traits Fonctionnels dans la
    population bovine Holstein allemande
  • Renson Julie
  • Robat Cécilia
  • Rondeaux Charlotte

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INTRODUCTION
  • -Importance croissante des caractères
  • fonctionnels
  • -durée de vie productive
  • -santé du pis
  • -fertilité
  • -Caractère fonctionnel caractère utilisé en
  • génétique pour augmenter lefficience et
  • diminuer le coût de production

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INTRODUCTION
  • Corrélation génétique négative entre caractères
    de production laitière et les caractères
    fonctionnels
  • Possession de données subjectives ou même
    absentes pour ces caractères fonctionnels
  • gt utilisation de données indirectes
  • - Héritabilité faible gt progression difficile
    dans le domaine

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INTRODUCTION
  • MAS (Sélection Assistée par marqueurs)
  • certains QTL influencent les caractères de
    production laitière
  • QTL emplacement au niveau du génome
    correspondant à un caractère quantitatif

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ETUDES REALISEES
  • Recherche de QTL contribuants à la variation
    génétique concernants différents caractères
    fonctionnels
  • -facilité du vêlage
  • -fréquence des avortements cliniques
  • - TNR 90j
  • -durée de vie productive du troupeau
  • -taux cellulaire du lait

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ETUDES REALISEES
  • -Mise en place dun système de cartographie
    génétique
  • -Etudes sur 16 familles avec liens de parenté
    (872 taureaux au total avec 54,5 fils/famille)
  • -Séquençage des autosomes (BTA) et des régions
    pseudoautosomales des chromosomes sexuels (BTA
    x/y)

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ETUDES REALISEES
  • -Détermination de lordre des marqueurs et des
    distances cartographiques pour analyser ces QTL
  • -Etude de différents traits phénotypiques
  • -avortements cliniques(effet mère-effet
  • veau)
  • -dystocie( effet veau-effet mère)
  • -TNR 90j(effet père-effet mère)
  • -caractères fonctionnels du troupeau
  • -taux cellulaire du lait( données indirectes
  • de la
    santé du pis)

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ETUDES REALISEES
  • -Carte QTL pour chaque caractère
  • -Tests statistiques gtdétermination des QTL

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RESULTATS
QTL 7 8 10 18 x/yps
DYSd SCC DYSm-STIm x x x x x x x x
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RESULTATS
QTL non confirmés 2 6 7 10 13 18 27 x/yps
Durée vie productive SCC STId TNR 90j -effet père -effet mère x x x x x x x x x x x x x x
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RESULTATS
  • -Pour 5 chromosomes( 7-8-10-18-x/yps), dun QTL
    pour les caractères fonctionnels déterminés
  • -DYS et STI sont très proches

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DISCUSSION
  • -Effet mère sur la difficulté de vêlage et les
    avortements cliniques
  • -QTL détecté au niveau de BTA8
  • -au même endroitQTL pour la taille et la
  • stature de la mère
  • gttaille et stature de la mère ont un impact
  • sur la mise bas du veau

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DISCUSSION
  • - Au niveau de BTA8 locus à impact
  • sur la force et largeur du bassin
  • gtaffecte aussi la facilité du vêlage
  • - DYSm et STIm sont très proches
  • sur le BTA8

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DISCUSSION
  • -Effet mère sur le TNR 90j
  • -fertilité diminue si dystocie et mammites
  • gtQTL pour TNR 90j sur BTA18?

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DISCUSSION
  • -Effets directs sur difficulté vêlage et sur
    lavortement clinique
  • -QTL pour avortement sur BTA6
  • -QTL pour la taille et caractère laitier aussi
    sur BTA6
  • -QTL non confirmés
  • -STId sur BTA6
  • -QTL pour le poids à la naissance sur
  • BTA6

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DISCUSSION
  • -SCC
  • -QTL sur BTA 18
  • -QTL sur BTA 27
  • -QTL sur BTA 27 pour la résistance aux mammites
    et pour la profondeur du pis
  • gt corrélation importante avec le QTL pour SCC

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DISCUSSION
  • -Durée de vie productive
  • -QTL sur BTA 2 et BTA 18 mais résultats variables
    car définition de la durée de vie productive non
    standardisée
  • -QTL sur BTA 2 pour
  • -lattachement du pis
  • -la rapidité de la traite
  • gtcorrélation entre vitesse de traite et
  • attachement du pis et entre les
  • mammites et SCC

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DISCUSSION
  • - Forte corrélation entre caractères du pis
    (attachement,profondeur) et durée de vie
    productive
  • gt on a de mammites, plus la durée de vie
    productive est courte en raison dune réforme
    précoce (corrélation locus pour SCC et durée de
    vie productive)

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DISCUSSION
  • En ce qui concerne la corrélation génétique
  • négative et les caractères fonctionnels et
  • les performances laitières, rien dans cette
  • étude ne montre des chevauchements des
  • QTL
  • DONC pas de preuves de cette corrélation
  • mais des études sont encore en cours

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CONCLUSION
  • -Mise en place du MAS infos nécessaires
  • sur la prévalence, la position et leffet des
  • QTL pour les caractères cibles
  • -QTL non confirmés pour
  • -dystocie
  • -avortements cliniques
  • -TNR 90j
  • -SCC
  • -durée de vie productive

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CONCLUSION
  • -5 chromosomes possèdent dun QTL pour les
    caractères fonctionnels
  • -Corrélation entre caractères du pis et durée de
    vie productive dans le troupeau
  • -Grâce à la détection des QTL, on va pouvoir
    utiliser la MAS pour la sélection génétique de
    ces carctères fonctionnels dans la population
    Holstein allemande

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REMARQUE
  • la MAS nest bien sur pas appliquable pour toutes
    les exploitations vu les coûts et les contraintes
    requises.
  • Son application doit dès lors être réservée au
    cheptel de grande valeur, comme les animaux de
    reproduction (IA ou saillie naturelle).

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BIBLIOGRAPHIE
  • -Kühn Ch,Bennewitz J,Reinsch N,Xu N,Thomsen
    H,Looft C,
  • Brockmans GA,Schwerin M,Weimann C,Hiendleder
    S,Erhardt G,
  • Medjugoras I,Föester M,Brenig B,Reinhardt
    F,Reents R,Russ I,
  • Averdunk G,Blümel J,Kalm E. 2003.Quantitative
    Traits Loci
  • Mapping of Functional Traits in the German
    Holstein Cattle
  • Population.J.Dairy Sci.86360-368
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