???? MicroRNA????? CHAPTER 16 MICRORNA AND COMPLEX DISEASE

1
???? MicroRNA?????CHAPTER 16 MICRORNA AND
COMPLEX DISEASE

• ??? ??
• Section 1 Introduction

2

• microRNA??miRNA,???????RNA??(?22????),??????
  3????????RNA????????(RNA-induced silencing
  complex,??RISC)????mRNA?????????
• ??miRNA???????????,???????????????????????,?
  ???????????????????????miRNA???????????????????(bi
  omark),?????????????????????????

3
??? miRNA???? Section 2 miRNAs and Their
Targets

• ??miRNA????
• (?) miRNA???
• miRNA?????1993?,????????????????????
  ?,???Lin-4,????Lin-14?3UTR????,??????????,???????
  Hela??????????????????????????????????????RNA,????
  miRNA?

4
(?)microRNA????
? ?
5
(?)miRNA???

• ????
• miRNA??????????ORF,??????
• ???miRNA 5 ????????,3????
• ????
• miRNA????????????
• ??????,???????
• ????
• miRNA?????????????
• ??miRNA?????????
• ??????????miRNA??
• ??????
• miRNA????????????
• ????50kb??????
• ?????
• ??????

6
miRNA?????

• ?????
• ???miRNA??mRNA?????????
• ????
• ???miRNA 5 ??????????????
• ??????
• ??
• ???????
• ????

7
???????miRNA???????

• miRNA????????????
• miRanda
• TargetScan
• RNAhybrid
• TargetBoost?miTarget
• ????

8
(?)miRNA????

• miRNA ?????????
• 5 ????(5-dominant)
• 3' ????(3'-compensatory)
• 5???????5???????(canonical)????(seed)

9
(?)miRNA???????????????
?????

• miRNA?????mRNA?3'UTR??????
• ?????????????
• miRNA?mRNA?????????????
• ???????????????????????

????

• ?3'UTR????miRNA??????????
• ??miRNA????????????????,???????
• ????????????,?????????????

10
(?)miRanda

• ????????????????????miRNA???????

http//cbio.mskcc.org/research/sander/data/miRNA20
03/miranda_new.html
11
miRanda???????

• ?miRNA?mRNA?3'UTR??????????,??????4???
• miRanda???????Smith-Waterman??????????
• miRNA??????????????????, miRanda??Vienna?????RNAli
  b ??miRNA?mRNA 3'UTR??????
• miRanda???????????,???????3'UTR?????????????????

12
(?)TargetScan

• TargetScan??????????miRNA???,???TargetScan???????
  ???(seed match)????

http//www.targetscan.org/
13
TargetScan???????

• ?TargetScan???,????????miRNA 5'???2-8????mRNA
  3'UTR ????7nt(nucleotide)??????,miRNA???7???????mi
  RNA ????
• ???????miRNA????????,??G-U??,??????????????????,Ta
  rgetScan?????????????, ????????????,
  ??????????????

14
(?)RNAhybrid??

• RNAhybrid?????????????????????????????????????RNA(
  miRNA)?????RNA(mRNA 3'UTR)???????????miRNA????
• ????RNA????????mfold?RNAfold???,RNAhybrid?????????
  ???,RNAhybrid?????miRNA ????????????????
• RNAhybrid??????????????,???????????????P
  ?,?????????miRNA?????????????????G-U????

15
(?)??????

• ??????????miRNA????????miRNA?????????,????????????
  ???miRNA?????
• ?TargetBoost?miTarget?miRNA????????????????????,??
  ????????miRNA??????,??miRNA???????????????????????
  ?????,??????????????

16
(?)???????

• ?miRNA??????????, mRNA ?3'UTR???????????
• miRNA???????3'UTR???????????,????mRNA
  ?3'UTR??????????????????????miRNA-mRNA????????????
  ?,????miRNA???
• ??????,?????????????????????miRNA????????

17
(?)?????????

• ????????miRNA????????????
• ?????????miRNA??????????????,????????miRNA????????
  ?????,???????????miRNA??????????????
• ?miRNA?????????, ????????????3'UTR??????????,?????
  ??RNA??????????

18
???????????????miRNA???

• ??????miRNA???mRNA?3'UTR???mRNA??????,???????,????
  ????mRNA??????
• ??????????????,miRNA?????mRNA????????????????????
  ????miRNA???????,?????????miRNA????????????

19

• Huang?????88?????????miRNA?mRNA?????,?????????????
  ?????GenMiR,???104???miRNA???????,???????????let
  -7b???,????,??????????,???????????miRNA?mRNA??????
  ??????miRNA????
• (Huang, Using expression profiling data to
  identify human microRNA targets. Nat. Methods.)

20

• Gennarino??????miRNA????(host gene)?????,???miRNA?
  ??????HOCTAR?HOCTAR??????miRNA???????mRNA??????miR
  NA????????,???????????(inversely
  correlated)??????miRNA???????????178???miRNA??????
  ?,?????????????????????,HOCTAR??????????????????
• (V. A. Gennarino, MicroRNA target prediction
  by expression analysis of host genes. Genome Res.)

21

• Bandyopadhyay????miRNA?????mRNA????????????,??????
  ??????miRNA???????TargetMiner??????????miRNA??????
  ???,?????????miRNA?????????????,???miRNA?mRNA?????
  ???300???????????,????????miRNA?????,???????(SVM)?
  ??????miRNA??????
• (Sanghamitra Bandyopadhyay, TargetMiner
  microRNA target prediction with systematic
  identification of tissue-specific negative
  examples.Bioinformatics.)

22
??????????????miRNA???

• ????miRNA????????,?????????????????????????????miR
  NA????????
• ?????????????????????????????????miRNA??????????mi
  RNA????????
• ??????????miRNA???????????,??????????miRNA????????
  ??????miRNA???????????????miRNA??????????????????

23
??miRNA??????????

• (?) TarBase???
• TarBase???
• ???????????miRNA???????????
• ??http//diana.cslab.ece.ntua.gr/tarbase/
• ????Excel??????,????????????

24
microRNA??????- TarBase
25
(?) miRBase???

• miRBase
• ?miRNA??,?????????????????????,?????miRNA?????????
  ????
• ??http//www.ebi.ac.uk/enright-srv/microcosm/htdo
  cs/targets/v5/
• ????miRanda???????

26
microRNA??????-miRBase
27
(?) miRGen???

• miRGen
• ???miRNA?????(Targets?),???????(Genomics?)??????(C
  lusters?)??????
• ??http//www.diana.pcbi.upenn.edu/miRGen/v3/miRGe
  n.html
• ?????,??????????????DIANA-microT,miRanda,PicTar,Ta
  rgetScanS?miRNA????????

28
microRNA??????-miRNAMap

• miRNAMap???
• ??miRNA???????
• ???????????
• ??,??,????
• ??http//mirnamap.mbc.nctu.edu.tw/index.php

29
(?) RNA22???

• RNA22???
• ??????RNA22???
• ??????????????
• ??miRNA????????5UTR
• ??????
• ???????????miRNA 5UTR???????????????????
• ??http//cbcsrv.watson.ibm.com/rna22.html

30
(?) microRNA.org???

• microRNA.org???
• ??miRNA??????????
• ??http//www.microrna.org/microrna/home.do
• miRNA?????
• ?????miRanda??????
• miRNA?????
• ??????????????????RNA?????

31
microRNA?????-microRNA.org

• ????
• ??miRNA?????????
• ???????miRNA,????,??miRNA?????
• ??????,??????miRNA??????
• ???????Targeted mRNA????????,?????????????????(?
  ???????????????3UTR)
• ???????miRNA??,????????????
• ???????miRNA,???????microRNA??,????????view
  expression profile,??????20????
• ?????????,????microRNA?????
• ???????miRNA Expression???????????????,?????????
  ???20??miRNA

32
??? miRNA??????? Section 3 miRNA polymorphisms
and complex disease

• ??
• miRNA??(miRNA polymorphisms)??????miRNA?????
  ,?????miRNA?????????????,????????????????????,????
  miRNA?????????(??),???????????????

33
(No Transcript)
34
????miRNA?????miRNA????miRNA?????

• ????????????????????miRNA??????miRNA??????????????
  ?????

Saunders, M.A.????474?miRNAs?SNPs????????????????m
iRNA?????????????????
49?pre-miRNAs???65?SNPs??,??3?miRNAs???????SNPs?
35
(?)??pri/pre-miRNA??

• Saunders, M.A.?Duan?????????????????pri/pre-miRNA?
  ????????????pri/pre-miRNA????????miRNA???,????miRN
  A????miRNA???????,???????????

36
1.??miRNA???

• Duan?????miR-125???,???????SNP,??miR-125a-G/U????,
  ??miR-125a-U??????DGCR8?pri-miRNA-125a??????,????m
  iR-125a????,?miR-125a????Lin-128??????????

37
1.??miRNA???

• Calin, G.A.?Raveche, E.S.??????????????????????miR
  -15a/miR-16??????(pri-miRNA)????CgtT??,????miR-15a/
  miR-16???????,???miRNA???70??????????????????????
  ??miR-15a/miR-16??????????????????

38
2.????miRNA

• miR-146a?????miR-146a(??)?miR-146a(??)??miRNA??mi
  R-146a?????????SNP(rs2910164)?????miR-146a???,????
  ?miR-146aC?miR-146aG??miRNA????

39
2.??miRNA???????,???????

• ??miR-146a?????(rs2910164)?????miR-146a,??miRNA??
  ????????,??miR-146aC??PTC1??,miR-146aG??IRAK1???
  ??????????CG???????????????,?CC?GG????????????????
  

40
(?)?????miRNA??

• ???miRNA?mRNA?3UTR?????mRNA????????miRNA?mRNA????
  ??????????miRNA?5??2-7???,??????,?????????mRNA??
  ??????????????3???,????????????3????(3MTR)?
• ????miRNA?????????????????,???????????????????

41
1.????miRNA????

• ??Saunders, M.A.?????????,??miRNA?????SNP??1?????
  ????,??miRNA??????????miRNA?????????????
• ??miRNA??????????miRNA???????????????miR-125a?????
  ????????pri/pre-miRNA??,??miRNA??????miR-206??ERa?
  ??,miR-206?????ERa????????miR-206????????????????,
  ???????????

42

• ??miRNA????????????????????????????????????miRNA??
  ?????mRNA,????????miRNA????????????????????,??????
  ?????????

43
2.??miRNA?3????(3MTR)

• 3MTR?????????,????????????,??????????SNPs????????
  ??????miRNA????????????,???????????????????????

44
3.???????miRNA???

• miRNA?????????,?????????????????????miRNA?????????
  ?miRNA??????,??????miRNA????
• Gottwein???????????miRNA???,??pri-miR-K5?SNP??????
  Drosha?pri-miR-K5???,??pre-miR-K5????miR-K5???????
  ?
• ??miRNA???????????????????,?????????miRNA?????????
  ??miRNA????????????,????????????

45
??miRNA?????

• miRNA???????????????miRNA???
• ????????????????????????miRNA
• ???????,??miRNA??????????????
• ??????????,????????????????
• ??

46
miRNA?????

• miRNA???????
• miRNA?????????
• miRNA???????????

47
(?)?miRNA????????????

• ?miRNA??????????????,??1922??????????????????????
  ??????????????27???,miRNA?????????????????????,SN
  P????????miRNA??????????????????????????,?????????
  ????

48
(?)?miRNA????????????

• ???miRNA???????????????miRNA???????,??miRNA???????
  ??,???????????????
• ??????miRNA???????????
• ????????-4(IGBT-4)miRNA?????SNP(rs743553)?????????
  ?(Brendle?)?
• ??GEMIN3??miRNA?????SNP(rs197414)??????????(Yang?)
  ?
• CD86???INSR???miRNA??SNP??????????????????????(Lan
  di?)?

49
(?)?miRNA??????????????

• ????????????????mRNA?????????miRNA???????
• miRNA??mRNA????????????miRNA??????????,?????????,?
  RISC?????????,??????mRNA?3-UTR?????????????????,?
  ????????????????????????????????????????????microR
  NA???,??mRNA?????microRNA?????????????mRNA????????
  ?????????

50
(?)?miRNA??????????????

• ??????????SNP???miRNA?3-UTR????????????
• ???3UTR??miRNA?????,??????????????????,??CPEARE??
  (3UTR??AuUUA????)????miRNA?????????????miRNA?????
  3UTR??????????,????miRNA????????

51
(?)?miRNA??????????????

• ??????miRNA???????????
• ?Tourette???????????? SLITRK1 3UTR??SNP?????miR-1
  89?????,????miR-189??SLITRK1?????????(Abelson?)?
• HLA-G??3UTR??SNP??miR-148a,miR-148b?miR-152?HLA-G
  ??,????????????(Zheng?)?
• ???????????(DHFR)3UTR??miR-24??????14bp??SNP C
  -829T???miR-24?DHFR mRNA???,?SNP?miR-24??DHFR?????
  ???,??????????(Prasun?)?

52
??miRNA ????????

• miRNA?????????????????,??????miRNA??????????,?????
  ??????????????

53
miRNA???????????

• ?????,????3UTR???SNPs?a-?????,?????????,?????,???
  ?5-???????????????
• ??????3UTR????????,miRNA??????????SNPs????miRNA-?
  ?????,??????miRNA???????????miRNA????,????????????
  ???

54
(No Transcript)
55
miRNA????????????

• Prasun J Mishra???????,miRNA?????????????(MTX????
  ???)????????DHFR??3UTR?miR-24?????SNP
  829??????T?,miR-24????DHFR??????,miR-24???????DHER
  ??mRNA??????,???DHFR????????????????

56
miRNA???????????

• miRNA?????????miRNA????
• ????????????(drug-target)???,????miRNA-???????????
  ?????????,?????????
• ????????????(drug-effector)???,????miRNA-?????????
  ????????????,??????????
• miRNA??????????miRNA-?????????????
• ???????????????,???????????????????,?????????
• ???????????????,????????????????,??????????

57
?16-4 miRNA?????????
58
miRNA??????

• miRNA????????????????miRNA???miRNA??????,?????????
  ???????????????

59
miRNA??????????

• miRNA??????????????????miRNA?????????,????????????
  ????????,??????????????????miRNA???????miRNA??????
  ????????????????,?????????????????????????????????
  ?,miRNA??????????????????????,???????????????

60
??miRNA??????????

• ??miRNA????????????????????
• miRNA???????????????????Lehmann
  U????71??????????miR-9-1?miR-124a3?miR-148?miR-152
  ?miR-663?34-86??????????????miRNA???????????????
  ?
• ??miRNA????????????????????????,??miRNA???????????
  ???????????????????????????????????,?????????????m
  iRNA????????????

61
??????

• ???dbSMR
• http//miracle.igib.res.in/polyreg/???????3UT
  R??SNP?miRNA??????????????

62
??????

• ???PolymiRTS
• http//compbio.utmem.edu/miRSNP/
  ?????????????????????????,????????????????????????
  ????????microRNA???????????????,????????PolymiRTS?
  

63
??? MicroRNA????????Section 4 MicroRNA
Expression Profile and Complex Disease
64
?? miRNA?????????miRNA

• ?????????????????????????

• ????????
• ????????

• miRNA?????????????,?????????????????????

• ??????????????????miRNA

65
(?) miRNA???
?? miRNA???
?????????????????????????????
?? miRNA??????
Northern?????(cloning)???PCR???
SAGE????????????????
66
(?)??miRNA?????????miRNA

• ??miRNA??????

Gene Expression Omnibus (GEO)??? ArrayExpress ???
??miRNA????????????
mRNA??????????????????? miRNA?????,????????????? ?
????miRNA???
67
???????? ????miRNA
????????????miRNA???? ???????T??? SAM???????
??????????,?????miRNA???????
?????????
???????Targetscan,miRanda,PicTar
68
???miRNA???????GO?????KEGG????,???????????????
??miRNA?????????

• ??miRNA????????????miRNA???
• ???,??miRNA???????????????
• ??,?????????????

69
??miRNA?????????

• ????????????????(mRNA)??????????????????????
  ?????????????(biomark)?????????????????
• ?????Lu?????2005?nature??miRNA??????????miRN
  A??????????

70

• ??GEO???GSE2564????????,????334??????mi
  RNA????,?????miRNA????,????,??????????????????334?
  ???miRNA??????????????????????334????miRNA????????
  ?????????????????,???????????,????????,?????????2?
  ???????

71

• ?????????????????,???????????,????????,
  ?????????2?????????miRNA???????,??????????????????
  ??miRNA?????miRNA????????????7.25,????miRNA???????
  ????????????????,???miRNA??????????0,????1????

72

• ????????
• ??????,???????
• ??????????????
• ???????????

73

• ???????218???,??????????73?????????????????mi
  RNA?????

74

• ????,?,?????????????????????????????????,???
  ??????miRNA?????????????????????????????????218???
  ??89????mRNA??????????16000?mRNA??????????????,???
  ????????????

75

• ??t???????????????miRNA????????,????????????
  ?miRNA????p?,???p???bonferroni???

76

• ????????miRNA????????????,???68???????
  ??(??11?????),???????????????????miRNA?mRNA???????
  ????????????????,????????????17???????????????
  miRNA???????????17??????????12?,???mRNA???????????
  ??????????
• ??miRNA?????????????????????????????,miRNA??
  ???????????????????

77
?? miRNA????mRNA????????
???????????,??????????,????????????????????????

• ????

• SNP

???????????(???????????????????
SNP????????)??????????????
??

• ????

• ????

78
(?)??miRNA-mRNA???????
?2005?Lu????????????????89???????????miRNA?mRNA???
????????
??????????
miRNA???
151?miRNA 11114?mRNA
????
mRNA???
79
??????????(???????)
(?) miRNA-miRNA????? (?) miRNA-mRNA?????
??miRNA??????????????(??????) 149?miRNA-mRNA?????
????? (???????gt0.4)
80
???????miRNA-mRNA??
81

• miR-99a???7???(ACTG2,MYH11,PRUNE2,GCSH,EDNRA,ACSL
  1,CCDN2)??????????
• ACTG2,MYH11,PRUNE2,GCSH,EDNRA,ACSL1,CCDN2?GO?????
  ???,??4?????????????????
• ??miR-99a??????????

82
???????miRNA?mRNA
?????12????????,??SAM??,????miRNA?mRNA??????????
60????? miRNA
GO ????
miRNA?? ?mRNA??
?????
485????? mRNA
83
?? miRNA????????

• ????????
• ??????????????????,???????????????????
• ?????????????????????,???????????

84
??miRNA???????

• ??????1000???miRNA????????,??????????????,??
  ??????????????????????????
• ???????????????miRNA??????????????????,??miR
  NA???????????????????????????

85
??miRNA????

• ???miRNA??????????????miRNA???????????
  
• ??,??????????,miR-122???????????????????????
  ???????????,miR-205??????????????????????????????
  ?????????????????mir-125b,mir-145,mir-21?mir-155??
  ??????????????????

86
????????????

• miRNA????????,??????????????????????PCR????m
  iRNA??????????
• ???miRNA?????????????????????
• ??,???????????miRNA?????????????????

87
??miRNA??????????

• ??miRNA???, miRNA???????????????????,???????
  ??????????????????????????????????????????????????
  ??

88
??? microRNA?????? Section 5 miRNA
Regulation of molecular networks
89
??

• ????????????????????????????????????????????,
  ?????????????????????????????
• microRNA(miRNA)??????????????
• miRNA???????????,????????,????,????,???????
• ??miRNA??????????????????????????????????????miRNA
  ?????????????
• ???????miRNA????????????,?????????????????????????
  ?????
• ??,????miRNA???????(motif),????????????????????

90
??

• miRNA????????
• miRNA??????
• miRNA??????????
• miRNA????????
• miRNA???????

91
??

• miRNA????????
• miRNA??????
• miRNA??????????
• miRNA????????
• miRNA???????

92
miRNA????????

• ???????????????????????????,??????????????????,???
  ?,??????????
• ????????????????????????,??????????????????????
• ??????????????????????????????
• ???????????????????????????????,???????????,??????
  ????
• miRNA???????,????miRNA???????????

93
??????

• ????????????,????mRNA?????miRNA???
• miRNA?????????????,???????????????????????
• ?????????????,?????????,?????????????????,????????
  ???????????????????, miRNA?????????????
• 2006?,Cui??miRNA?????????????,??????miRNA????????
  ????

94
??

• microRNA?????
• Targetscans?PicTar?????
• ????
• ?????
• ??540???,1258???????

95
(?)miRNA???????????????

• 29.4??????miRNA????,??????(???????)???????17?miR
  NA??,??miRNA?????????????????? ?

96
????(Adaptors)
(?)miRNA???????????????

• ??????????????????????
• ????(?????4??????)
• ????(??????4??????)
• ?????????????miRNA????? ,??36.1?????????????miRNA
  ??,??????24.2 ,miRNA??????????????

97
miRNA?????????????
??????,Ra?????/????????

• miRNA???????????????,?????????????????
• ?????(id 98),miRNA?????????????????????????????

98
??

• ????????????,miRNA????????????
• ???????????????????????????????????,miRNA?????????
  ??????????????????
• ????,miRNA????????????,???????????????????????????
  ???

99
??

• miRNA????????
• miRNA??????
• miRNA??????????
• miRNA????????
• miRNA???????

100
miRNA??????

• ??????????????????,???????????????
• ?????????????,???????,???????????????????
• ???????????????????????miRNA???????????????,??????
  miRNA????????????
• ??????miRNA???????,??????????????
• miRNA???????????????????????????????????

101
????

• ?KEGG??????????????,?????????????????
• A?B????????????(???????????)
• ?TargetScan?????????????miRNA?????????????
• miRNA????????
• ?????????,??????miRNA??,?????????miRNA??
• ???????(???2??),???????miRNA??????,??????,??????,?
  ??????miRNA???

A
B
A
B
??1
??1
??2
102
miRNA???????????

• ????miRNA?????????
• ??????????????????????miRNA??????,??5000?
• ????????P?????,???5000????,?????????
• ???????????????,????????????,????R?Qvalue?????????
  
• ???????????0.25,???????????miRNA????????

103
miRNA???????????????

• ???????miRNA??????
• ???????miRNA?????????????miRNA???????hub?????????
  

104
????????????

• ????????????????miRNA??????,??????????????????????
  ????,???miRNA?????,??????5000?,???????????,???????
  ????????????,?0.05????????

105
miRNA?????????????????
????
????

• ???????
• ????
• ????
• ???
• ???
• ??????????miRNA????????????,??????????????????????
  
• ?????????
• ????????????????,???10000?
• ??????
• ??????????????
• ???????????????
• ?????????miRNA?????
• ???????????,???????miRNA???????????????,?????2?miR
  NA???????????????

???
???
106
??

• ????,miRNA??????????????
• ????????????HUB??????????,?????????????????????
• ??????????miRNA????,???????/?????????,???miRNA????
  ??????????

107
??

• miRNA????????
• miRNA??????
• miRNA??????????
• miRNA????????
• miRNA???????

108
miRNA??????????

• ???????????????????????????
• ???,?????????????????????????????????????????????
  
• ???????????????????
• ????????????????,?????????????
• ????????????????miRNA???????,?????????????????????
  ??

109
miRNA????????????

• ??
• 2005?Boyer??ChIP-chip??????????????????????
• OCT4,NANOG?SOX2
• miRNA?????
• PicTar
• ???????????????,?????,?????????????????miRNA??????
  ?? ?
• miRNA?????????(????2)????????????(Fisher???? )
• ?????????????,?????miRNA??

110
miRNA??????????

• ????????????,?????????????????????????
• ????????????????????---- 2005?Krek et al
• ???????????????,???????????????,???????????????
• ??miRNA??????????
• miRNA?????????????????????????
• ??,???????,??????miRNA????????????????????????????
  ??
• ?????????????????miRNA?????????????
• ????????????,???????????????
• ????????????????????????????????,?????????????????
  ??????

111
??

• miRNA????????
• miRNA??????
• miRNA??????????
• miRNA????????
• miRNA???????

112
miRNA????????

• ???????????????????????????,???????????????????
• ?????????????????,??????????????,?????????????????
  ????????
• ?????????????,?????,????????????
• ???,????????????????????????,????????????????????
  ????
• ??,??miRNA?????????????

113
?????????????

• ?????miRNA???,????????????
• ??????????????,?????miRNA,????????????
• ????miRNA,???miRNA??????????
• ?miRNA????,????????miRNA,????????????????

114
(?)?????miRNA

• ?-------??????????????
• ??miRNA????????????
• ?????????????????3UTR????????????
• hub??----????5????
• ?hub?,miRNA?????????????????
• ???????Hub??????????hub
• miRNA????????????? ----???????????
• miRNA?????????????????????
• ?????????????????????????????????

115
(?)????miRNA

• ???miRNA?????????????
• miRNA????????????hub??????
• ????? (????)
• L0??miRNA?????????
• L1??miRNA?????????????????
• ???????????????
• ??L0??????????0.031,???L1???????0.448,?????????
• ???miRNA???????????,??????????????????????????????

116
(?)?miRNA????

• ??????????miRNA????
• ??miRNA?????????(?)?(?)??????????
• ?????????????miRNA???miRNA??? ?
• ????,??????miRNA?????????????????????????
• ?????------??(Communities)
• ????Cfinder??????????????
• miRNA??????????

117
??

• ????????,????????????????????????????????
• ???????HUB???????miRNA???,????????miRNA?
• ??????????????????
• ??miRNA??????????????,??????????????????
• ??,??????miRNA???????????

118
??

• miRNA????????
• miRNA??????
• miRNA??????????
• miRNA????????
• miRNA???????

119
miRNA???????

• ????
• ??????????????????????
• ???????,?????????????
• ??,????????,Notch????????miR-61???,?miR-61????????
  ???Notch???????????
• ????-miRNA?????TransmiR(TFmiRNA regulatory
  database)

120
???

• I?miRNA???
• ??. miR-17-5p??E2F1,???????????c-Myc?????
• ????????????????????
• ???????????
• II?miRNA???
• miRNA???????????????????, ????????????????????????
  ??????????????????????
• ??II?????miRNA???????miRNA??????

121
?????miRNA????????????

• ????????I?II??????
• ??,????????miRNA??????????????????
• ????????????????

122
??

• ????
• ?????????????
• miRNA???????????????
• ???????????????????????????
• ??????
• ???????????
• A????????????????????????????????
• miRNA??????????????????????????????????????
• ??????,miRNA?????????????????,????????????