N

1
Námety na výzkum škodlivých organismu ve VÚRV
v.v.i. v projektu EUPHRESCO II
Ing. Jiban Kumar, Ph.D. Výzkumný ústav rostlinné
výroby, v.v.i. oddelení virologie Drnovská 507,
Praha 6, 161 06 Tel.[phone] E-mail
jiban_at_vurv.cz
2
Výzkum karanténních a regulovaných patogenu ve
VÚRV v.v.i.
Fytoplazmy Grapevine flavescence dorée European
stone fruit yellows Viry Plum pox virus Little
cherry disease (LCD Little cherry virus 1,
2) Tomato yellow leaf curl virus Tomato spotted
wilt virus Pepino mosaic virus Houby Monilinia
fructicola Mycosphaerella pini a M. Dearnessii
3
Bakterie Xanthomonas axonopodis pv. vesicatoria
Clavibacter michiganensis subsp.
Sepedonicus Xylophilus ampelinus Erwinia
amylovora Škudci Diabrotica virgifera virgifera
- bázlivec kukuricný Glischrochilus
quadrisignatus - lesknácek Pseudaulacaspis
pentagona štítenka Fytoparazitická
hádátka Bursaphelenchus xylophilus Paratrichodorus
a Trichodorus
4
Fytoplazmy

• Candidatus Phytoplasma vitis (Grapevine
  flavescence dorée, GFDP)
• Po Evrope se šírí od jihu k severu.
• Vektorem je krís Scaphoideus titanus.
• Zpusobuje až úplnou ztrátu výnosu a odumírání
  napadených keru, velké ekonomické ztráty.
• Soucástí detekcního pruzkumu GFDP je i pruzkum
  výskytu kríska révového, který na území CR dosud
  nebyl zjišten.
• Projekt MZE 000270604 (2009-2011)
• Námet výzkumu Metody rychlé diagnostiky a
  identifikace tohoto patogena a jeho vektora.

Flavescence doree infected Baco 22A grapevine,
Armagnac, France.  Photo courtesy Clemson
University, Plant Virus Slide Series photo
credit W. Gartel.

• Candidatus Phytoplasma prunorum (European stone
  fruit yellows, ESFY)
• Evropská žloutenka peckovin napadá rod Prunus
• Infekce bývá obvykle bezpríznaková
• ESFY je prenášena merou Cacopsylla pruni
• Salava J., Polák J., Komínková-Bryxiová M.,
  Svoboda J. 2005 In (Petria 15 (1/2)), pp.
  221-223.
• Polák J., Salava J., Komínková-Bryxiová M.,
  Svoboda J. 2007 Bulletin of Insectology 60(2)
  261-262.
• Polák J., Salava J., Komínková-Bryxiová M.,
  Svoboda J. 2006 In Sborník príspevku "XVII.
  ceská a slovenská konference o ochrane rostlin",
  12.-14. zárí 2006, CZU Praha, pp. 105-110.
• Projekt MZE 000270603 (2004-2008) a MZE
  000270604 (2009-2011)
• Námet výzkumu Metody spolehlivé diagnostiky a
  identifikace tohoto patogena a jeho vektora.

www.srs.cz
5
Viry ovocných drevin

• Plum pox virus (PPV)
• PPV je nejrozšírenejší virus peckovin,
  karanténní patogen.
• Ze šesti kmenu (PPV-M, PPV-D, PPV-EA, PPV-C,
  PPV-rec, PPV-W) v CR se vyskytují M, D, a Rec.
• Polák J., Komínek P., Krška B., Pívalová J.
   2008 Journal of Plant Pathology 90(1,
  Supplement) S1.37-S1.40
• Polák J.  2006 Bulletin OEPP/EPPO Bulletin 36
  225-226.
• Polák J., Krška B., Pívalová J., Svoboda J. 2005
  Phytopathol. Pol. 36 53-59
• Projekt MZE 000270603 (2004-2008), MZE 000270604
  (2009-2011) a EU 7. SharCo (2008-2012)
• Námet výzkumu Diagnostika, genetická diverzita,
  rezistence.

• Little cherry disease (LCD Little cherry virus
  1, 2)
• Výskyt na kulturních a okrasných druzích trešní a
  višní.
• Pravdepodobne introdukován pomocí okrasných
  trešní z Japonska.
• Virus se prenáší vegetativne i pomocí apple mealy
  bug Phenacoccus aceris (cervec javorový).
• V CR dosud nebyl zkoumán, ale je potvrzen výskyt
  v sousedních zemích (Polsko, Nemecko a další zeme
  Evropy).
• Projekt nereší se v žádném projektu ve VÚRV
  v.v.i.
• Námet výzkumu Diagnostika a genetická diverzita
  LChV-1, LChV-2 v CR.

http//www.agf.gov.bc.ca/cropprot/tfipm/lcv.htm
6
Skupina karanténních viru zeleniny

• Tomato yellow leaf curl virus (TYLCV)
• Zpusobuje nemalé ztráty pri pestování rajcat v JZ
  Evrope.
• Je prenášen molicí Bemisia tabaci.
• Muže se vyskytovat i v CR, zejména ve
  skleníkových porostech rajcat.
• Projekt nereší se v žádném projektu ve VÚRV
  v.v.i.
• Námet výzkumu Diagnostika TYCLV v porostech
  rajcat/papiky pestovaných v CR stanovení
  vlastností získaného izolátu viru vypracování
  metodiky ochrany proti TYCLV. 

Zdroj Len tesoriero, 2006

• Tomato spotted wilt virus (TSWV)
• V Evrope je rozšíren na rostlinách rajcat, paprik
  a salátu
• Je prenášen mechanicky nebo trásnenkami.
• Je zvlášte nebezpecný tím, že muže prežívat na
  okrasných rostlinách mesícku, cínské astry,
  chryzantémy, krásenky, jiriny, ostrožky, mecíku,
  hledíku a statice.
• Projekt nereší se v žádném projektu ve VÚRV
  v.v.i.
• Námet výzkumu Diagnostika TSWV v porostech
  rajcat/papiky pestovaných v CR stanovení
  vlastností získaného izolátu viru vypracování
  metodiky ochrany proti TSWV.

Chlorotic sinuous lines and concentric rings on
leaf of capsicum due to TSWV.G. Marchoux - INRA,
Montfavet (FR)

• Pepino mosaic virus (PepMV)
• V Evrope byl PepMV nalezen v r. 1999 na
  skleníkových rajcatech.
• V CR byl PepMV již nalezen na dovážených plodech
  rajcat ze státu EU.
• V soucasnosti hrozí jeho rozšírení nejen na
  rajcata, ale také na brambory pestované v CR.
• Projekt nereší se v žádném projektu ve VÚRV
  v.v.i.
• Námet výzkumu Diagnostika PepMV v porostech
  rajcat/papiky pestovaných v CR stanovení
  vlastností získaného izolátu viru vypracování
  metodiky ochrany proti PepMV.

7
Houbové choroby

• Monilinia fructicola - kloubnaticka jablonová
• Zpusobuje predevším hnilobu plodu pred i po
  sklizni.
• Poškozuje listy, vetve a kmeny, kde vyvolává na
  kure až nekrotické skvrny.
• M. fructicola je druh který se dosud vyskytoval
  predevším v Severní Americe, ale nyní je cím dál
  casteji zaznamenáván v Evrope
• Projekt nereší se v žádném projektu ve VÚRV
  v.v.i.
• Námet výzkumu Diagnostika a zhodnocení výskytu
  Monilinia fructicola v CR. Stanovení citlivosti
  na používané fungicidy v porovnání s M.
  fructigena a M. laxa..

• Mycosphaerella pini a M. dearnessii - Sypavky
  borovic
• Mycosphaerella pini a M. dearnessii poškozují
  jehlice, reznou, odumírají a opadávají, vetve
  zustávají holé bez jehlic.
• Snižuje se prírustek borovic.
• Projekt nereší se v žádném projektu ve VÚRV
  v.v.i.
• Námet výzkumu Diagnostika patogena

8
Bakteriální choroby

• Xanthomonas axonopodis pv. Vesicatoria
• je puvodcem skvrnitosti papriky, která je
  pomerne hodne rozšírena v oblastech intentivního
  pestování této plodové zeleniny v CR.
• Bakterie patrí k podmínene fytokaranténním
  organismum, nebot se prenáší semeny a proto je
  striktne vyžadováno, aby osivárské porosty byly
  prosty patogena.
• V rámci patovaru Xav existuje nekolik ras
  s ruznou virulencí k ruzným odrudám.
• Odrudy tolerantní ci rezistentní mohou patogena
  prenášet do oblastí, kde se pestují spolu
  s náchylnými odrudami papriky, které jsou pak
  velmi ohroženy potenciální infekcí Xav.
• Projekt QH71229
• Námet výzkumu Diagnostika jednotlivých
  patovaru, ras Xav na území CR, ochranné opatrení.

Zdroj Volcani Center, Bet Dagan (IL)

• Clavibacter michiganensis subsp. Sepedonicus
• Zpusobuje bakteriální kroužkovitost brambor.
• K významnému pomnožení patogena dochází behem
  prvních týdnu skladování.
• Predskliznová detekce této bakterie v hlízách je
  velmi problematická.
• Pánková I., Krejzar V., Cepl J., Kudela V.  2007
  Plant Protect. Sci. 43(4) 127-134
• Kokoskova B., Kudela V. 2002 J of Plant
  Diseases and Protection 109(6) 630-638.
• Projekt MZE 000270063(2004-2008), QF4105, MZE
  000270063(2009-2011)
• Námet výzkumu Vcasná diagnostika, adaptace
  citlivých molekulárních metod detekce.

9

• Xylophilus ampelinus
• je puvodcem bakteriální spály révy vinné, který
  nebyl doposud na území CR prokázán.
• Jedná se o bakterii, jenž pro svuj vývoj vyžaduje
  vyšší teploty, které jsou charakteristické pro
  tropické a subtropické oblasti.
• V posledních letech je její výskyt zaznamenáván i
  v mírném podnebném pásmu.
• Projekt MZE 000270603 (2004-2008)
• Námet výzkumu Diagnostika, systematický pruzkum
  výskytu této bakterie na území CR.

Zdroj EPPO

• Erwinia amylovora
• Puvodce spály ružovitých.
• Je karanténní organismus.
• V CR je rozšíren na jedné tretine výmery sadu
  jádrovin.
• Korba J., Šillerová J., Kudela V.  2008 Plant
  Protect. Sci. 44(3) 91-96
• Kudela V.  2007 Czech J. Genet. Plant Breed.
  43(4) 135-1
• Kokoskova B., Mraz I., Hyblova J. 2007 Folia
  Microbiologica 52(2) 175-182
• Kokoskova B., Mraz I., Fousek J. 2005
  Phytopathologia Polonica 35 69-72
• Projekt QH91148, QD1053, MZE 000270604
  (2009-2011)
• Námet výzkumu Ochranná opatrení je nutno zamerit
  na zvyšování rezistence podnoží a odrud jabloní a
  hrušní. Diagnostika a monitoring výskytu.

10
Škudci

• Diabrotica virgifera virgifera- bázlivec
  kukuricný
• Zpusobuje škody na kukurici.
• Škody pusobí larvy, ale i dospelci. Larvy se
  mohou príležitostne vyvinout i na korenech jiných
  trav a dospelí brouci se mohou živit i na
  rostlinách z celedí Poaceae, Asteraceae, Fabaceae
  a Cucurbitaceae.
• Bázlivec kukuricný se od roku 2002, kdy byl
  poprvé zaznamenán výskyt tohoto druhu na území
  Ceské republiky, rozšíril prakticky na celé území
  Moravy a v roce 2006 byl odchycen i ve východních
  Cechách.
• Šírení v Evrope i v CR pokracovalo v roce 2008
  západním smerem, což dokumentují zjištení škudce
  v 8 nových okresech v CR, za hranicí jeho
  soucasného prirozeného šírení v CR. V roce 2009
  lze ocekávat dopadovou analýzu Evropské Komise,
  která má pomoci rozhodnout, jak dále s bázlivcem
  v EU naložit.
• Projekt MZE 000270604 (2009-2011)
• Námet výzkumu Overení možnosti signalizace
  ošetrení proti dospelcum na základe SET (v
  oblastech, kde je škudce dosud rozšíren omezene a
  nelze jej zjistit v lapacích).

Colorado State University, USA
11
Škudci

• Glischrochilus quadrisignatus Lesknácek
• Zpusobuje škody na palicích kukurice
• V roce 2008 byly zjišteny první škody žírem
  dospelcu na palicích kukurice na území CR (okres
  Hradec Králové).
• Projekt MZE 000270604 (2009-2011)
• Námet výzkumu Stanovení škodlivost v CR,
  možnosti úcinné ochrany proti tomuto škudci.

Zdroj BioLib.cz

• Pseudaulacaspis pentagona - štítenka
• Výskyt byl zjišten poprvé v CR v roce 2005 na
  katalpe v Pardubicích. Od roku 2006 jsou nalézány
  další lokality, s výskytem vetšinou na katalpách,
  ale také na jerlínu japonském (Sophora japonica)
  a pavlovnii plstnaté (Paulownia tomentosa).
• Tento široce polyfágní druh štítenky pochází z
  Asie a rozšíril se témer po celém svete.
• Je považován za nebezpecného škudce ovocných i
  okrasných rostlin, zejména drevin.
• Projekt MZE 000270604 (2009-2011)
• Námet výzkumu Stanovení škodlivost v CR, a
  overení schopnosti škudce napadat peckoviny.

University of Georgia - USA
12
Fytoparazitická hádátka

• Bursaphelenchus xylophilus - hádátko borovicové
• Jedná se o, v soucasné dobe, nejvýznamnejší
  fytosanitární karanténní objekt v EU.
• Škudce se šírí od roku 1999 v Portugalsku, letos
  byl poprvé zjišten v sousedním Španelsku a
  existuje rada dukazu o šírení hádátka drevenými
  obaly ze zamorených oblastí do zbytku EU.
• Na našem pracovišti bude výzkum zameren na
  otázku, zda existují rozdíly v okruhu hostitelu
  škudce v Evrope ve srovnání se státy jeho puvodu
• Projekt MZE 000270604 (2009-2011)
• Námet výzkumu Zjistit okruhy hostitelu a
  stanovení škodlivost na jehlicnanech v CR,

• Paratrichodorus a Trichodorus
• Zpusobují prímé škody rostlin napadením jejich
  korenových bunek
• Nekteré druhy jsou i prenašeci tobraviru na
  brambory (e.g. Tobacco rattle virus-TRV)
• Zatím nebyl v CR proveden žádný výzkum ke
  zjištení výskytu a rozsahu techto hádátek ve
  vztahu k tobravirum.
• Projekt MZE 000270604 (2009-2011)
• Námet výzkumu Diagnostika techto hádátek u
  ekonomicky významných plodin.

13
škodlivé organizmy rešení do roku 2008 rešené od roku 2009 oddelení
1) Ca, Phytoplasma vitis (Grapevine flavescence dorée-GFDP) ne ano - zamer09 virologie
2) Ca, Phytoplasma prunorum (European stone fruit yellows-ESFY) ano - zámer04-08 ano - zamer09 virologie
3) Plum pox virus (PPV) ano - zámer04-08 ano - zamer09 virologie
4) Little cherry virus 1, 2 (LChV-1, LChV-2) ne ne virologie
5) Tomato yellow leaf curl virus (TYLCV) ne ne virologie
6) Tomato spotted wilt virus (TSWV) ne ne virologie
7) Pepino mosaic virus (PepMV) ne ne virologie
8) Monilinia fructicola ne ne mykologie
9) Mycosphaerella pini a M. dearnessii ne ne mykologie
10) Xanthomonas axonopodis pv. vesicatoria ano - QH71229 ne bakteriologie
11) Clavibacter michiganensis subsp. Sepedonicus ano - QF4105 ne bakteriologie
12) Xylophilus ampelinus ano - zámer04-08 ne bakteriologie
13) Erwinia amylovora ano - QH91148, QD1053 ano - zamer09 bakteriologie
14) Diabrotica virgifera virgifera ne ano - zamer09 entomologie
15) Glischrochilus quadrisignatus ne ano - zamer09 entomologie
16) Pseudaulacaspis pentagona ne ano - zamer09 entomologie
17) Bursaphelenchus xylophilus ne ano - zamer09 entomologie
18) Paratrichodorus a Trichodorus ne ano - zamer09 virologie