Nurul wiqoyah

1
Taxonomy dan Klasifikasi

• Nurul wiqoyah

2

• Taxonomy dan Klasifikasi
• TaxonomyPengaturan spesies ke dalam kelompok
  tertentu
• klasifikasi
• Sistem phenetik
• hubungan evolusioner
• Sequence 16s rRNA

3

• NOMENCLATURE
• Binomial nomenclature
• Genus spesies
• Classification Hierarchy
• Kingdom
• Phylum
• Class
• Ordo
• Family
• Genus
• Spesies
• Strain biovar
• serovar

4

• Classification Hierarchy
• Domain
• Phylum
• Class
• Order
• Family
• Genus
• Spesies
• Strain
• Domain Archae
• Bacteria
• Eukarya

5

• Binomial nomenclature
• Binomial Linneaeus
• Genus
• species
• Ex. Staphylococcus aureus

6
Kingdom

• 5 Kingdoms (1967 Whittaker)
• Animalia
• Plantae
• Protista (Unicellular Eucaryotes)
• Monera/ Procaryotae
• Fungi (Multicellular Eucaryotes)

• 3 Domain (1978 Woses)
• Eubacteria bacteria
• Archaebacteria
• Eucaryotes Protista, Fungi, Plantae and Animalia

7
Dasar dasar klasifikasi

• Karakteristik morfologi
• Sifat pengecatan
• Sifat fisiologi
• Karakteristik ekologi
• Karakteristik genetik/ molekuler

8

• Bergeys Manual of Systematic Bacteriology 2nded
• Seq 16S rRNA
• phylogenetik
• Vol 1 Archae dan bakteri phototropic dengan
  cabangnya
• Vol 2 Proteobacteria
• Vol 3 Bakteri Gram positif dengan GC rendah
• Vol 4 Bakteri Gram positif dengan GC tinggi
• Vol 5 Planctomycetes, spirochaetes,
  Fibrobacteria,
• Bacteroides, Fusobacteria

9

• 1. Archae dan bakteri phototropic dengan
  cabangnya
• Domain Archae
• Domain Bacteria
• 2. Proteobacteria (Phyllum Proteobacteria)
• Kelas I Alphaproteobacteria
• Ricketsia, Nitrobacter, rhizobium,
• Rhodophillum
• Kelas II Betaproteobacteria
• Neisseria,
  Nitrosomonas, Thibacillus
• Kelas III Gammaproteobacteria
• Legionella,
  Pseudomonas, Vibrio, Esobacteria
• Kelas IV Deltaproteobacteria
• Bdellovibrio,
  Myxococcus
• Kelas V Epsiloproteobacteria
• Helicobacter,
  Camphylobacter

10

• 3. Bakteri Gram positif dengan GC rendah
  (Phyllum Firmicitus)
• Kelas I Clostridium
• Clostridium,
  Peptostreptococcus, Desulfumaculum
• Kelas II Mollicules
• Kelas III Bacilli
• Bacillus, Lactobacillus,
  Streptococcus,
• Enterococcus, Listeria,
  Staphylococcus
• 4. Bakteri Gram positif dengan GC tinggi
• Kelas Actinobacteria
• Actinomyces, Micrococcus,
  Corynebacterium,
• Mycobacterium, Nocardia,
  Streptomyces

11

• 5. Planctomycetes, spirochaetes, Fibrobacteria,
  Bacteroides, Fusobacteria
• Phyllum Chlamydia
• Chlamydia
• Phyllum Spirochaetes
• Spirochaeta, Borrellia,
  Treponema, Leptospira
• Phyllum Bacteroidetes
• Bacteroides, Cytophage
• Archae atau Archaebacteria