Pr

1
Il y a beaucoup dépistasie
2
Passer du génotype au phénotype
Modèle additif
- modèle non épistatique de référence
Modèle multiplicatif (Dillmann Foulley, 1998)
- réponse à la sélection accélérée - très
sensible à la dérive génétique
Modèle métabolique (Bost, Dillmann de Vienne,
1999)
Bases biochimiques de - la distribution en  L 
des effets des QTL - la dominance et l heterosis
3
Les flux métaboliques comme modèles de caractères
quantitatifs
4
Flux métaboliques et valeur sélective
Dean et al, 1989
Il existe une relation linéaire entre le flux de
lactose et la vitesse de croissance en chémostat
dEscherichia coli
5
Réseau de voies métaboliques dans une cellule
6
Modèle détude la glycolyse chez la levure
7
La théorie du contrôle métabolique
Flux dSn1 / dt
Flux à létat stationnaire v1 v2 vj
vn J
K constantes déquilibres, S1, Sn1 Qj
quantité de lenzyme j Aj paramètres
cinétiques de lenzyme
Kacser and Burns, 1973 Heinrich and
Rappoport, 1974
8
Quantification des enzymes de la glycolyse chez
la levure
Thèse Julie Fievet
9
Nombre de molécules par cellule
Qj
n
Fievet, Dillmann, Negroni, Davanture, Lagniel,
Labarre de Vienne, in prep.
Paramètres cinétiques
Aj
Log(nb moles S/mn/mg enzyme)
Teusink et al, 2001
10
Variabilité génétique des quantités denzymes
Enzyme Quantité moyenne Max /Min
Phosphoglycerate mutase 3,1 1.6
L-ascorbate peroxidase 10,1 3
OSR40 (LEA) 3,2 3.1
Ferritin 3,1 3.6
ABA/ripening protein 15,1 3.9
Initiation factor IEF-5A 2,9 5.9
Glutathione S-transferase III 5 7.5
Caffeate OMT 1,7 10.4
Glutathione S-transferase III (isoforme) 21 ns
Cinnamyl alcohol dehydrogenase 3,6 ns
Methionine adenosyl transferase 1,2 ns
Quantité totale de protéines allouées à une
chaîne métabolique
11
Contraintes sur la quantité totale de protéines
Absence 0ltQtotlt?
Présence Qtot cste
Absence
Co-régulation de lexpression
Présence
12
Gabriel, Dillmann, Fievet, Bost, de Vienne, in
prep
Implications sélectives de la contrainte
assymétrie des coefficients de sélection
Flux
Jm()
Jw
Jm(-)
La sélection est plus efficace pour éliminer une
mutation défavorable que pour fixer une mutation
favorable
Proportion de lenzyme
d
-d
13
Implications sélectives de la contrainte contre-sé
lection des concentrations extrêmes
Flux
Jm(-x)
Jm(x)
La sélection est plus efficace pour diminuer la
quantité dune enzyme en excès que pour augmenter
la quantité dune enzyme en déficit
Jw
- 10
10
Proportion de lenzyme
14
Les flux métaboliques comme modèle dépistasie
Modèle biochimique permettant de relier les gènes
(les enzymes) au phénotype et dexpliquer les
interactions entre allèles dominance
(heterosis) épistasie (antagoniste, synergique,
moins quadditive, AD,..)
Modèle épistatique les coefficients de
sélection qui sappliquent sur une enzyme varient
en fonction du contexte génétique et du sens de
la sélection
Modèle de référence permettant de combiner des
approches théoriques et expérimentales