ATP-sintasa

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ATP-sintasa

• Bendita tú eres entre todas las enzimas.

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Estructura de la ATP-sintasa
Matriz mitocondrial
Membrana mitocondrial interna
danos hoy nuestro ATP de cada día
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Qué quisimos hacer?

• Con nuestros conocimientos de la ATP-sintasa (y
  nuestros desconocimientos) quisimos modelar el
  funcionamiento de esta enzima a partir de lo
  aprendido acerca de ratchets, específicamente el
  de la quinesina de una cabeza.

• Potencial dado por las cargas negativas del
  anillo
• Entrada de protones que apaga el potencial
• Asimetría del potencial dada por distintos
  sitios de anclaje a la membrana

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Nuestro ratchet oficial(potencial asimétrico,
T7)
E 0,338
5
Distintas corridas de lo mismo
E 0.346
E 0.3313
E 0.339
E 0.291
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Modificando los tiempos de difusión
T6
T8
E 0.144
E 0.167
7
Modificando la asimetría del potencial
Potencial menos asimétrico
Potencial simétrico
E 0.018
E -0.005
8
Modificando el dx
dx 8
E 0.014
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Resultados

• Pudimos determinar un tiempo óptimo de difusión.
• Realizando varias corridas del mismo ratchet,
  observamos que se obtenían resultados similares
• Modificando el tiempo de difusión respecto del
  óptimo (aumentándolo y disminuyéndolo), la
  asimetría del potencial y el dx, disminuye la
  eficiencia

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Conclusiones

• Nos parece que el modelo de trinquete difusivo de
  la quinesina de una cabeza se aplica bastante
  bien al funcionamiento de la ATP-sintasa. Sin
  embargo, la eficiencia no nos parece muy alta.
• Las modificaciones efectuadas (tiempo de
  difusión, simetría,etc) disminuían la eficiencia,
  como era de esperar de acuerdo a lo aprendido
  para este tipo de ratchet.
• Sin embargo
• Existen algunas diferencias entre el modo de
  funcionamiento real de la ATP-sintasa y lo
  planteado por nosotros en la práctica.

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La verdad de la milanesa

• Las cargas negativas impiden la rotación hacia
  la membrana hidrofóbica (potencial)
• La entrada de protones apaga el potencial.
• Distinta probabilidad de entrada de protones a
  cada canal, debido a la diferente concentración
  de protones (potencial asimètrico)

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Agradecimientos

• A Julio Washington
• A Mari por la picada